MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022659	CG	3	6	3107774	3107779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16002	NC_022659	CGCTT	2	10	3107823	3107832	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16003	NC_022659	GATC	2	8	3107836	3107843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16004	NC_022659	GCACG	2	10	3107866	3107875	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16005	NC_022659	CCAG	2	8	3107881	3107888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16006	NC_022659	AGG	2	6	3109393	3109398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_022659	CGG	2	6	3110392	3110397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_022659	CCG	2	6	3111482	3111487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16009	NC_022659	CGT	2	6	3111492	3111497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_022659	TCCG	2	8	3112943	3112950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16011	NC_022659	GC	3	6	3112951	3112956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16012	NC_022659	CGG	2	6	3112961	3112966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_022659	GC	3	6	3112980	3112985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16014	NC_022659	AGC	2	6	3113032	3113037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_022659	GCTCG	2	10	3113064	3113073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16016	NC_022659	TGC	2	6	3113164	3113169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_022659	TTC	2	6	3113180	3113185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_022659	CGT	2	6	3113187	3113192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_022659	CGG	2	6	3113302	3113307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_022659	GAA	2	6	3114550	3114555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_022659	TCG	2	6	3114607	3114612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_022659	GCGA	2	8	3114628	3114635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16023	NC_022659	CTTTT	2	10	3114779	3114788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16024	NC_022659	GGC	2	6	3114826	3114831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_022659	TCG	2	6	3114847	3114852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_022659	TCGC	2	8	3114881	3114888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16027	NC_022659	CG	3	6	3114909	3114914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16028	NC_022659	GCGCG	2	10	3114919	3114928	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16029	NC_022659	CG	3	6	3114962	3114967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16030	NC_022659	ATC	3	9	3114989	3114997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_022659	CGG	2	6	3115001	3115006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_022659	TCG	2	6	3115020	3115025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_022659	CCG	2	6	3115057	3115062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16034	NC_022659	CGCGG	4	20	3115063	3115082	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16035	NC_022659	CGT	2	6	3115097	3115102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_022659	TCG	2	6	3115103	3115108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_022659	CGG	2	6	3115113	3115118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_022659	TCGA	2	8	3115130	3115137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16039	NC_022659	ATCG	2	8	3115211	3115218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16040	NC_022659	CG	4	8	3115243	3115250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16041	NC_022659	GC	3	6	3115287	3115292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_022659	CG	3	6	3115293	3115298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16043	NC_022659	CG	3	6	3115333	3115338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_022659	GAT	2	6	3115438	3115443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_022659	A	6	6	3115474	3115479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_022659	CGG	2	6	3115512	3115517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_022659	GGC	2	6	3115540	3115545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_022659	GCTC	2	8	3115553	3115560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16049	NC_022659	GC	3	6	3115561	3115566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16050	NC_022659	TTGC	2	8	3115634	3115641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16051	NC_022659	CGGC	2	8	3115647	3115654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16052	NC_022659	TCGAT	2	10	3115775	3115784	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16053	NC_022659	GAT	2	6	3115796	3115801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_022659	GCC	2	6	3116949	3116954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16055	NC_022659	GAC	2	6	3117005	3117010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_022659	ATGC	2	8	3117011	3117018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16057	NC_022659	GCG	2	6	3118884	3118889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_022659	GTC	2	6	3118907	3118912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_022659	GC	5	10	3120196	3120205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16060	NC_022659	GC	3	6	3120217	3120222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16061	NC_022659	AATG	2	8	3124633	3124640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_022659	CGGC	2	8	3124641	3124648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16063	NC_022659	TGTCGG	2	12	3124661	3124672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16064	NC_022659	GCG	2	6	3124716	3124721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_022659	TCG	2	6	3124722	3124727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_022659	GC	4	8	3124744	3124751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16067	NC_022659	CGC	2	6	3124774	3124779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16068	NC_022659	CG	3	6	3124790	3124795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16069	NC_022659	CG	3	6	3124805	3124810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16070	NC_022659	GGC	2	6	3124811	3124816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_022659	CG	4	8	3124895	3124902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16072	NC_022659	TCGA	2	8	3124928	3124935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16073	NC_022659	AAT	2	6	3124977	3124982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_022659	CGC	2	6	3124987	3124992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_022659	ATT	2	6	3125034	3125039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_022659	AT	3	6	3125080	3125085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_022659	GCGA	2	8	3125100	3125107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16078	NC_022659	GCG	2	6	3125140	3125145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_022659	TCG	2	6	3125198	3125203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16080	NC_022659	CGC	2	6	3125225	3125230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16081	NC_022659	A	7	7	3125253	3125259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_022659	GGGC	2	8	3125260	3125267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16083	NC_022659	GC	3	6	3125289	3125294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16084	NC_022659	GC	3	6	3125327	3125332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16085	NC_022659	GC	4	8	3125338	3125345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16086	NC_022659	CG	3	6	3125380	3125385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16087	NC_022659	CCG	2	6	3125386	3125391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16088	NC_022659	GC	4	8	3125396	3125403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16089	NC_022659	AGC	2	6	3125463	3125468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16090	NC_022659	GA	3	6	3125516	3125521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_022659	GGCCAT	2	12	3125537	3125548	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_022659	CGG	2	6	3125565	3125570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_022659	GC	3	6	3125585	3125590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16094	NC_022659	TGC	2	6	3125616	3125621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_022659	GCG	2	6	3125646	3125651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_022659	CG	3	6	3125785	3125790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16097	NC_022659	GAA	2	6	3125798	3125803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_022659	T	6	6	3125849	3125854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_022659	AGA	2	6	3125976	3125981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_022659	CG	3	6	3126020	3126025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16101	NC_022659	GAC	2	6	3126043	3126048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_022659	GA	3	6	3126055	3126060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_022659	TTCC	2	8	3127566	3127573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16104	NC_022659	CGCT	2	8	3130818	3130825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16105	NC_022659	CGGCG	2	10	3130860	3130869	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16106	NC_022659	CCG	2	6	3130873	3130878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_022659	CGG	3	9	3130883	3130891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_022659	CGC	2	6	3130892	3130897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16109	NC_022659	GCC	2	6	3130901	3130906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_022659	GCG	2	6	3130907	3130912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_022659	GCG	2	6	3130915	3130920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_022659	GCG	2	6	3130926	3130931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_022659	GGT	2	6	3130939	3130944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_022659	GGT	2	6	3130950	3130955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_022659	GGT	2	6	3130961	3130966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_022659	GGT	2	6	3130972	3130977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_022659	GGT	2	6	3130983	3130988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_022659	GCG	2	6	3130992	3130997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_022659	GCG	2	6	3131003	3131008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_022659	GGT	2	6	3131016	3131021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_022659	CGG	2	6	3131037	3131042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_022659	GCG	3	9	3131047	3131055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_022659	CG	4	8	3131054	3131061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_022659	CGA	2	6	3131074	3131079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_022659	AACG	2	8	3131121	3131128	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16126	NC_022659	GCG	2	6	3132547	3132552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_022659	CGT	2	6	3132580	3132585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16128	NC_022659	GGACG	2	10	3132592	3132601	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16129	NC_022659	CGC	2	6	3143258	3143263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16130	NC_022659	CGG	2	6	3143274	3143279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16131	NC_022659	GAGAG	2	10	3144160	3144169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16132	NC_022659	CGT	2	6	3144170	3144175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16133	NC_022659	GCCG	2	8	3148937	3148944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16134	NC_022659	CGCGG	2	10	3148946	3148955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16135	NC_022659	GAT	2	6	3148974	3148979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16137	NC_022659	CGG	2	6	3150172	3150177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16138	NC_022659	GC	3	6	3150183	3150188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16139	NC_022659	GGT	2	6	3150223	3150228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16140	NC_022659	CGCAGG	2	12	3150300	3150311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16141	NC_022659	CTG	2	6	3150326	3150331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16142	NC_022659	CGT	2	6	3150352	3150357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16149	NC_022659	CG	3	6	3151250	3151255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16150	NC_022659	GC	3	6	3151267	3151272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16153	NC_022659	CGCGC	2	10	3152157	3152166	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16154	NC_022659	GCCGC	2	10	3152176	3152185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16155	NC_022659	CG	3	6	3152189	3152194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16156	NC_022659	CGATT	2	10	3152197	3152206	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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16160	NC_022659	GCC	2	6	3152252	3152257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16161	NC_022659	CGC	2	6	3152273	3152278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16162	NC_022659	GC	3	6	3155568	3155573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16165	NC_022659	CCGG	2	8	3158428	3158435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16166	NC_022659	CG	4	8	3158462	3158469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16167	NC_022659	GC	3	6	3158479	3158484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16168	NC_022659	CGA	2	6	3158495	3158500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16169	NC_022659	CGG	2	6	3158503	3158508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16170	NC_022659	GTGCG	2	10	3158542	3158551	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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16173	NC_022659	GC	3	6	3159752	3159757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16174	NC_022659	GC	3	6	3159759	3159764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16175	NC_022659	GCGT	2	8	3159769	3159776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16182	NC_022659	CGA	2	6	3161852	3161857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16185	NC_022659	CG	3	6	3161957	3161962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16199	NC_022659	GCG	2	6	3163100	3163105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16217	NC_022659	CGG	2	6	3165988	3165993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16221	NC_022659	CG	3	6	3166053	3166058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16251	NC_022659	GC	3	6	3170080	3170085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16252	NC_022659	CG	3	6	3170086	3170091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16253	NC_022659	AGGC	2	8	3170106	3170113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16254	NC_022659	GCG	2	6	3170114	3170119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16255	NC_022659	CGG	2	6	3170144	3170149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16256	NC_022659	CCG	2	6	3170161	3170166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16260	NC_022659	ACAA	2	8	3174049	3174056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16262	NC_022659	GCCG	2	8	3174852	3174859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16263	NC_022659	GCG	2	6	3174912	3174917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16268	NC_022659	GGCG	2	8	3174970	3174977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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16390	NC_022659	T	6	6	3188674	3188679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16476	NC_022659	CG	3	6	3203338	3203343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16497	NC_022659	GC	3	6	3210918	3210923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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