MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 1

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022659	CGTG	2	8	864922	864929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_022659	GCCG	2	8	864961	864968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_022659	TCG	2	6	865073	865078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_022659	CGCGCA	2	12	865090	865101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_022659	CGG	2	6	865103	865108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_022659	C	6	6	865119	865124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5007	NC_022659	CGG	3	9	865177	865185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_022659	CGC	2	6	865189	865194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_022659	GGC	2	6	866929	866934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_022659	CGC	2	6	866935	866940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_022659	GC	3	6	866975	866980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_022659	GCC	2	6	866983	866988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_022659	CG	3	6	866992	866997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_022659	CCGG	2	8	867018	867025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_022659	GCT	2	6	867034	867039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_022659	GCC	2	6	867565	867570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_022659	GCC	3	9	867577	867585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_022659	CTGG	2	8	867598	867605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_022659	CG	3	6	867650	867655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_022659	GGC	2	6	867662	867667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_022659	ACG	2	6	867670	867675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_022659	GCG	2	6	867692	867697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_022659	CGC	2	6	867717	867722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_022659	GCC	3	9	867746	867754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_022659	CATC	2	8	868148	868155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_022659	CG	3	6	868179	868184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_022659	CGGCG	2	10	868241	868250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5028	NC_022659	CGT	2	6	868283	868288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_022659	CGA	2	6	868294	868299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_022659	CG	3	6	868300	868305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_022659	GCCGC	2	10	868312	868321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5032	NC_022659	CCG	2	6	868327	868332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_022659	ACG	2	6	868333	868338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_022659	CGC	2	6	868342	868347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_022659	CGGT	2	8	868864	868871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_022659	CG	3	6	868904	868909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_022659	CG	3	6	868914	868919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_022659	GCG	2	6	868922	868927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_022659	CG	3	6	868926	868931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_022659	CGG	2	6	868983	868988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_022659	ATGC	2	8	869076	869083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_022659	CGA	2	6	869088	869093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_022659	GCC	2	6	869127	869132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_022659	CG	3	6	869155	869160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_022659	CCG	2	6	869261	869266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_022659	CG	3	6	869300	869305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_022659	A	7	7	869315	869321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022659	CCG	2	6	869322	869327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_022659	GCG	2	6	869334	869339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_022659	CGGC	2	8	869367	869374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_022659	A	8	8	871204	871211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022659	GCGGGC	2	12	871223	871234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5054	NC_022659	GCC	2	6	871280	871285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_022659	GCC	2	6	871288	871293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_022659	CCG	3	9	871304	871312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_022659	GCC	2	6	871317	871322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_022659	CGC	2	6	871385	871390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_022659	GCC	2	6	871392	871397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_022659	GGC	2	6	871398	871403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_022659	CAGG	2	8	872064	872071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_022659	ATCG	2	8	872075	872082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_022659	CGG	2	6	872087	872092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_022659	CG	4	8	872128	872135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_022659	CGG	2	6	872882	872887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_022659	A	6	6	872959	872964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_022659	CGG	2	6	872968	872973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_022659	T	6	6	872982	872987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_022659	GCG	2	6	872988	872993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_022659	CGC	2	6	873928	873933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_022659	CCCGC	2	10	873985	873994	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5072	NC_022659	CGGGCG	2	12	874018	874029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_022659	A	7	7	875229	875235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_022659	CTT	2	6	875251	875256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_022659	CGA	2	6	875258	875263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_022659	CTCGG	2	10	876013	876022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5077	NC_022659	CG	3	6	876023	876028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_022659	GC	3	6	876045	876050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_022659	ACC	2	6	876145	876150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_022659	GCCC	2	8	876172	876179	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5081	NC_022659	ATG	2	6	878251	878256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_022659	A	7	7	878332	878338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_022659	GCAG	2	8	878363	878370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_022659	CG	3	6	878395	878400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5089	NC_022659	AT	3	6	880803	880808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_022659	CGA	2	6	880818	880823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_022659	GGCG	2	8	882680	882687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_022659	CGG	2	6	882697	882702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_022659	CGG	2	6	882732	882737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_022659	CGA	2	6	882747	882752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_022659	GCC	2	6	882756	882761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_022659	CCG	3	9	882766	882774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_022659	AGCG	2	8	882786	882793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_022659	T	6	6	882816	882821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_022659	TCG	2	6	885495	885500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5112	NC_022659	T	6	6	886589	886594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_022659	GCA	2	6	886608	886613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_022659	CGGCTT	2	12	893364	893375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_022659	A	6	6	893404	893409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_022659	CGA	2	6	893485	893490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_022659	CAG	2	6	893513	893518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_022659	TCGC	2	8	893526	893533	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_022659	TCG	2	6	893553	893558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_022659	AAC	2	6	893594	893599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_022659	GCA	2	6	893602	893607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_022659	GGT	2	6	893635	893640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_022659	CTA	2	6	893698	893703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_022659	A	6	6	893732	893737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_022659	GAA	2	6	893756	893761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_022659	TGA	2	6	893807	893812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_022659	TAT	2	6	893858	893863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_022659	CA	3	6	893881	893886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_022659	CATCG	2	10	894740	894749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5130	NC_022659	GCT	3	9	894787	894795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_022659	GCT	2	6	894803	894808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_022659	AGC	2	6	894824	894829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_022659	CCG	2	6	896293	896298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_022659	GCC	2	6	896332	896337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5135	NC_022659	CGC	2	6	896399	896404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5136	NC_022659	GCG	2	6	896436	896441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5141	NC_022659	GGC	2	6	896570	896575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5145	NC_022659	CG	3	6	896635	896640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5399	NC_022659	GGCGC	2	10	945762	945771	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5404	NC_022659	CG	4	8	946433	946440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5405	NC_022659	GGCGC	2	10	946460	946469	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5410	NC_022659	GCG	2	6	946894	946899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5411	NC_022659	CGCC	2	8	946922	946929	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5413	NC_022659	CCG	2	6	946968	946973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5414	NC_022659	GGC	2	6	946974	946979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5415	NC_022659	GC	3	6	946978	946983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5416	NC_022659	GGC	2	6	946985	946990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5432	NC_022659	CGAC	2	8	948731	948738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5433	NC_022659	CGGCAG	3	18	948755	948772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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5464	NC_022659	GCCG	2	8	953989	953996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5473	NC_022659	CG	3	6	957437	957442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5475	NC_022659	GC	3	6	957476	957481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5476	NC_022659	GC	3	6	957511	957516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5477	NC_022659	GGC	2	6	957523	957528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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