MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens CC178

Total Repeats: 10915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022653	T	6	6	3	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022653	T	7	7	13	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022653	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022653	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022653	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022653	CA	3	6	229	234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022653	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022653	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022653	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022653	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022653	AGG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022653	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022653	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022653	AT	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022653	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022653	AGG	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022653	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022653	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022653	T	6	6	3160	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022653	AT	3	6	4831	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022653	T	6	6	6822	6827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022653	CTA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022653	ATT	2	6	6968	6973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022653	T	7	7	6995	7001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022653	TA	3	6	9499	9504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022653	A	7	7	9513	9519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022653	TGA	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022653	TGT	2	6	9558	9563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022653	T	6	6	9597	9602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022653	A	6	6	9603	9608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022653	GA	3	6	9655	9660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022653	CAA	2	6	9663	9668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022653	TAAA	2	8	9719	9726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022653	AGTC	2	8	9745	9752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022653	ACT	2	6	9755	9760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022653	GGC	2	6	9798	9803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022653	GCG	2	6	9858	9863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022653	CCTG	2	8	9888	9895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022653	CGA	2	6	10043	10048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022653	GCA	2	6	10117	10122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022653	CGC	2	6	10164	10169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_022653	GTGA	2	8	10170	10177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022653	TGT	2	6	10203	10208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022653	GAA	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022653	GGC	2	6	10237	10242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022653	CAG	2	6	10286	10291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022653	ATT	2	6	10327	10332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022653	AGA	2	6	10427	10432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022653	GGA	2	6	10477	10482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022653	CT	3	6	10502	10507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022653	GAG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022653	TGC	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022653	GAA	2	6	10741	10746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022653	GGT	2	6	10815	10820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022653	GTC	2	6	10829	10834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022653	TCGTG	2	10	10838	10847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022653	GGA	2	6	10941	10946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022653	ATC	2	6	10965	10970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022653	AC	3	6	10992	10997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022653	AC	3	6	11161	11166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022653	CAC	2	6	11176	11181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_022653	AGCC	2	8	11224	11231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022653	GAT	2	6	11247	11252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022653	CCT	2	6	11303	11308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_022653	GGT	2	6	11460	11465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022653	CCA	2	6	11482	11487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_022653	AGG	2	6	11542	11547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022653	CCA	2	6	11572	11577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022653	GGACG	2	10	11713	11722	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022653	AAGC	2	8	11749	11756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022653	CAC	2	6	11788	11793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022653	GGA	2	6	11873	11878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022653	GCG	2	6	11907	11912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022653	AGG	2	6	12025	12030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022653	TC	3	6	12057	12062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022653	CGG	2	6	12081	12086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022653	GGA	2	6	12113	12118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022653	AGT	2	6	12234	12239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022653	AGA	2	6	12315	12320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022653	CACG	2	8	12445	12452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022653	TC	3	6	12518	12523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022653	AGC	2	6	12776	12781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022653	TTC	2	6	12874	12879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022653	ACA	2	6	13081	13086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022653	ACC	2	6	13102	13107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_022653	G	6	6	13127	13132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022653	AGG	2	6	13137	13142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022653	GCGA	2	8	13233	13240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022653	TAG	2	6	13245	13250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022653	GAG	2	6	13332	13337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022653	GA	3	6	13355	13360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022653	GA	3	6	13434	13439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022653	CGG	2	6	13592	13597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022653	GA	3	6	13690	13695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022653	TAGG	2	8	13808	13815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022653	TAC	2	6	13862	13867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022653	CGC	2	6	13892	13897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_022653	CGGG	2	8	13904	13911	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022653	CCT	2	6	13950	13955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_022653	GGT	2	6	14086	14091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022653	CGT	2	6	14281	14286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022653	GAG	2	6	14330	14335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022653	GTT	2	6	14384	14389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022653	C	6	6	14457	14462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_022653	GAT	2	6	14508	14513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022653	ATCG	2	8	14569	14576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022653	GA	3	6	14621	14626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022653	TGG	2	6	14642	14647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022653	CGC	2	6	14745	14750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022653	TCA	2	6	14777	14782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022653	T	6	6	14792	14797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022653	ATA	2	6	15838	15843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022653	A	6	6	17349	17354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022653	T	8	8	17383	17390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022653	TGT	2	6	17416	17421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022653	TTTGAA	2	12	17424	17435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022653	ATGA	2	8	17468	17475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022653	AAGA	2	8	18827	18834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022653	TGA	2	6	18839	18844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022653	A	6	6	18874	18879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022653	ATT	2	6	18884	18889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022653	A	7	7	18893	18899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022653	ATCT	2	8	18904	18911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022653	AG	3	6	20610	20615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022653	GTG	2	6	20623	20628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022653	T	6	6	20796	20801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022653	GTT	2	6	20825	20830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022653	GAAAT	2	10	23412	23421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022653	A	6	6	23422	23427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022653	TAT	2	6	23467	23472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022653	GGA	2	6	23486	23491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022653	TCC	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_022653	AT	3	6	23609	23614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022653	TCC	2	6	24989	24994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_022653	A	6	6	25061	25066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022653	TA	3	6	26359	26364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022653	TGAA	2	8	26369	26376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022653	CCT	2	6	26382	26387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_022653	AT	3	6	26405	26410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022653	A	6	6	26412	26417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022653	CTG	2	6	27001	27006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022653	A	6	6	27039	27044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022653	AAG	2	6	27048	27053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022653	AG	3	6	27052	27057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022653	TG	3	6	27586	27591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022653	CAT	2	6	27592	27597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022653	ATTT	2	8	27624	27631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022653	TAAG	2	8	27730	27737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022653	GGAA	2	8	27792	27799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022653	GCA	2	6	27800	27805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_022653	CAG	2	6	28068	28073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022653	AG	3	6	29733	29738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022653	ATAA	2	8	30076	30083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022653	GGA	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022653	TCT	2	6	30944	30949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_022653	ATT	2	6	31257	31262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_022653	TGA	2	6	31305	31310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022653	GAC	2	6	31350	31355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_022653	AAT	2	6	31375	31380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022653	TAAA	2	8	31457	31464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022653	AGTC	2	8	31483	31490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_022653	ACT	2	6	31493	31498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_022653	GGC	2	6	31536	31541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_022653	GCG	2	6	31596	31601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_022653	CCTG	2	8	31626	31633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
167	NC_022653	CGA	2	6	31781	31786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_022653	GCA	2	6	31855	31860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_022653	CGC	2	6	31902	31907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_022653	TGT	2	6	31941	31946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_022653	GGC	2	6	31975	31980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_022653	CAG	2	6	32024	32029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_022653	ATT	2	6	32065	32070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_022653	GGT	2	6	32553	32558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022653	GTC	2	6	32567	32572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_022653	TCGTG	2	10	32576	32585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
185	NC_022653	GGA	2	6	32679	32684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022653	ATC	2	6	32703	32708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_022653	AC	3	6	32899	32904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_022653	CAC	2	6	32914	32919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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193	NC_022653	GGT	2	6	33198	33203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_022653	CCA	2	6	33310	33315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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243	NC_022653	AGA	2	6	36934	36939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_022653	ATA	2	6	38800	38805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_022653	AATG	2	8	40926	40933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_022653	TAT	2	6	46449	46454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_022653	ATG	2	6	52732	52737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_022653	ATT	2	6	53679	53684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_022653	AAT	2	6	53753	53758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_022653	TTG	2	6	53760	53765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_022653	TTG	2	6	53821	53826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_022653	TTTTG	2	10	54142	54151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_022653	T	7	7	56803	56809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_022653	TGTA	2	8	56851	56858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022653	A	7	7	56873	56879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022653	TA	3	6	56937	56942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_022653	GGT	2	6	56950	56955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_022653	CGC	2	6	56988	56993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_022653	CTG	2	6	57277	57282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_022653	T	6	6	57317	57322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_022653	TAA	2	6	57339	57344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_022653	TCT	2	6	57380	57385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_022653	GCGA	2	8	100652	100659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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