MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 plasmid pBamNAU-B3a

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022531	ATC	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022531	GCAG	2	8	70	77	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022531	TTG	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022531	ATG	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022531	GCA	2	6	267	272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022531	TTTA	2	8	303	310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022531	CGG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022531	GGA	2	6	394	399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022531	GAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022531	CGAA	2	8	441	448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022531	T	7	7	530	536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022531	AAATT	2	10	1931	1940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022531	TATG	3	12	1994	2005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022531	CCA	2	6	2057	2062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022531	TTTTGG	2	12	2065	2076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022531	TTATT	2	10	2113	2122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022531	T	7	7	2142	2148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022531	TTG	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022531	T	7	7	2325	2331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022531	T	8	8	2370	2377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022531	AT	3	6	2434	2439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022531	T	6	6	2445	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022531	CAA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022531	T	7	7	2504	2510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022531	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022531	TGC	2	6	2581	2586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022531	TC	3	6	2620	2625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022531	CGG	2	6	2628	2633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022531	GA	3	6	2694	2699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022531	TAT	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022531	GTT	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022531	GTTT	2	8	4942	4949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022531	AAAT	2	8	4992	4999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022531	AGG	2	6	5044	5049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022531	GTA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022531	GGA	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022531	CAAA	2	8	5325	5332	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022531	GTTT	2	8	5336	5343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022531	G	6	6	5385	5390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022531	TGG	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022531	A	6	6	5486	5491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022531	GA	3	6	5512	5517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022531	CCT	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_022531	G	6	6	5602	5607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022531	T	7	7	5649	5655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022531	TGT	2	6	5668	5673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022531	GTA	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022531	CAA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022531	TGC	2	6	6937	6942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022531	CGG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022531	T	8	8	7073	7080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022531	T	6	6	7145	7150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022531	T	6	6	7221	7226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022531	TAC	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022531	TAC	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022531	GCT	2	6	7440	7445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022531	T	6	6	7448	7453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022531	AAAT	2	8	7464	7471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022531	TG	3	6	7539	7544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022531	T	6	6	7579	7584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022531	AAT	2	6	7604	7609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022531	T	6	6	7628	7633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022531	A	7	7	7635	7641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022531	GAA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022531	A	7	7	7690	7696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022531	T	6	6	7717	7722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022531	TA	3	6	7768	7773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022531	ACA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022531	A	7	7	7790	7796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022531	TAT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022531	GAA	2	6	7998	8003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022531	GACG	2	8	8006	8013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_022531	AGA	2	6	8045	8050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022531	TG	3	6	8189	8194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022531	ATA	2	6	8225	8230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022531	AATT	2	8	8231	8238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022531	AGA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022531	GTA	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022531	ATG	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022531	GAA	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.