MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5033

Total Repeats: 12618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022075	T	6	6	3	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022075	T	7	7	13	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022075	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022075	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022075	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022075	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022075	AGG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022075	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022075	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022075	AT	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022075	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022075	AGG	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022075	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022075	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022075	T	6	6	3160	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022075	AT	3	6	4831	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022075	T	6	6	6822	6827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022075	CTA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022075	ATT	2	6	6968	6973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022075	T	7	7	6995	7001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022075	TA	3	6	9499	9504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022075	A	7	7	9513	9519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022075	TGA	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022075	TGT	2	6	9558	9563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022075	T	6	6	9597	9602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022075	A	6	6	9603	9608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022075	GA	3	6	9655	9660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022075	CAA	2	6	9663	9668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022075	TAAA	2	8	9719	9726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022075	AGTC	2	8	9745	9752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022075	ACT	2	6	9755	9760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022075	GGC	2	6	9798	9803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022075	GCG	2	6	9858	9863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022075	CCTG	2	8	9888	9895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022075	CGA	2	6	10043	10048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022075	GCA	2	6	10117	10122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022075	CGC	2	6	10164	10169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022075	GTGA	2	8	10170	10177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022075	TGT	2	6	10203	10208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022075	GAA	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022075	GGC	2	6	10237	10242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022075	CAG	2	6	10286	10291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022075	ATT	2	6	10327	10332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022075	AGA	2	6	10427	10432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022075	GGA	2	6	10477	10482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022075	CT	3	6	10502	10507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022075	GAG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022075	TGC	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022075	GAA	2	6	10741	10746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022075	GGT	2	6	10815	10820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022075	GTC	2	6	10829	10834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022075	TCGTG	2	10	10838	10847	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022075	GGA	2	6	10941	10946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022075	ATC	2	6	10965	10970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022075	AC	3	6	10992	10997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022075	AC	3	6	11161	11166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022075	CAC	2	6	11176	11181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_022075	AGCC	2	8	11225	11232	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022075	GAT	2	6	11248	11253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022075	CCT	2	6	11304	11309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022075	TTC	2	6	11395	11400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022075	TGT	2	6	11405	11410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022075	GGACG	2	10	11540	11549	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022075	AAGC	2	8	11576	11583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022075	CAC	2	6	11615	11620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022075	GGA	2	6	11700	11705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022075	GCG	2	6	11734	11739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022075	AGG	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022075	TC	3	6	11884	11889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022075	CGG	2	6	11908	11913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022075	GGA	2	6	11940	11945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022075	AGT	2	6	12061	12066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022075	AGA	2	6	12142	12147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022075	CACG	2	8	12272	12279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022075	TC	3	6	12345	12350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022075	AGC	2	6	12603	12608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022075	TTC	2	6	12701	12706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022075	ACC	2	6	12929	12934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022075	G	6	6	12954	12959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022075	AGG	2	6	12964	12969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022075	GCGA	2	8	13060	13067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022075	TAG	2	6	13072	13077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022075	GAG	2	6	13159	13164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022075	GA	3	6	13182	13187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022075	GA	3	6	13261	13266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022075	CGG	2	6	13419	13424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022075	GA	3	6	13517	13522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022075	TAGG	2	8	13635	13642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022075	TAC	2	6	13689	13694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022075	CGC	2	6	13719	13724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022075	CGGG	2	8	13731	13738	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022075	CCT	2	6	13777	13782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022075	GGT	2	6	13913	13918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022075	CGT	2	6	14108	14113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022075	GAG	2	6	14157	14162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022075	GTT	2	6	14211	14216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022075	C	6	6	14284	14289	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_022075	GAT	2	6	14335	14340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022075	ATCG	2	8	14396	14403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022075	GA	3	6	14448	14453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022075	TGG	2	6	14469	14474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022075	CGC	2	6	14572	14577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_022075	TCA	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022075	T	6	6	14619	14624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022075	ATA	2	6	15665	15670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022075	A	6	6	17176	17181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022075	T	8	8	17210	17217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022075	TGT	2	6	17243	17248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022075	TTTGAA	2	12	17251	17262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022075	ATGA	2	8	17295	17302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022075	AAGA	2	8	18653	18660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022075	TGA	2	6	18665	18670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022075	A	6	6	18700	18705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022075	ATT	2	6	18710	18715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022075	A	7	7	18719	18725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022075	ATCT	2	8	18730	18737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022075	CT	3	6	20425	20430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022075	AG	3	6	20436	20441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022075	GTG	2	6	20449	20454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022075	TAG	2	6	20508	20513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022075	T	6	6	20622	20627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022075	GTT	2	6	20651	20656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022075	GAAAT	2	10	23238	23247	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022075	A	6	6	23248	23253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022075	TAT	2	6	23293	23298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022075	GGA	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022075	TCC	2	6	23395	23400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_022075	AT	3	6	23435	23440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022075	T	6	6	23478	23483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022075	A	7	7	23490	23496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022075	TCC	2	6	24815	24820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_022075	A	6	6	24887	24892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022075	TA	3	6	26185	26190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022075	TGAA	2	8	26195	26202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022075	CCT	2	6	26208	26213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_022075	AT	3	6	26231	26236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022075	A	6	6	26238	26243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022075	CTG	2	6	26827	26832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022075	A	6	6	26865	26870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022075	AAG	2	6	26874	26879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022075	AG	3	6	26878	26883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022075	TG	3	6	27412	27417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022075	CAT	2	6	27418	27423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022075	ATTT	2	8	27450	27457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022075	TAAG	2	8	27556	27563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022075	GGAA	2	8	27618	27625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022075	GCA	2	6	27626	27631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022075	ATCA	2	8	27728	27735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022075	T	6	6	27771	27776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_022075	ATG	2	6	27829	27834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022075	AGG	2	6	27843	27848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_022075	ATAA	2	8	29902	29909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_022075	TGA	2	6	31131	31136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022075	A	6	6	31151	31156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_022075	AGTC	2	8	31309	31316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_022075	GGA	2	6	32505	32510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_022075	A	6	6	83387	83392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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