MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021008	CTG	2	6	563957	563962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_021008	GGC	2	6	563984	563989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_021008	TCG	2	6	564024	564029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_021008	TGG	2	6	564031	564036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021008	GCAC	2	8	564069	564076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_021008	CGG	2	6	564082	564087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021008	GCA	2	6	564136	564141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_021008	GTCG	2	8	564215	564222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_021008	ACC	2	6	564225	564230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_021008	CGG	2	6	564238	564243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021008	GTC	2	6	564299	564304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_021008	CAG	2	6	564311	564316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021008	CAG	2	6	564337	564342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021008	GCG	2	6	564354	564359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021008	AAC	2	6	564360	564365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_021008	GCA	2	6	564418	564423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021008	GCGCC	2	10	564482	564491	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3518	NC_021008	AGGT	2	8	564498	564505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021008	GAT	2	6	564557	564562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021008	GCG	2	6	564569	564574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_021008	CGG	2	6	564628	564633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021008	GGA	2	6	564680	564685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021008	GGC	2	6	564722	564727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021008	CGT	2	6	564742	564747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021008	AGC	2	6	564786	564791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_021008	CCT	2	6	564817	564822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_021008	CGG	2	6	564835	564840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_021008	CG	3	6	564917	564922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_021008	GCC	3	9	564938	564946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_021008	GC	3	6	564972	564977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_021008	GGC	2	6	564992	564997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021008	GTC	2	6	565004	565009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021008	TGG	2	6	565026	565031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021008	CCG	2	6	565032	565037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_021008	ATG	2	6	565062	565067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021008	GTG	2	6	565068	565073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021008	CGG	2	6	565207	565212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_021008	GAC	2	6	565214	565219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021008	GC	3	6	565234	565239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_021008	CTT	2	6	565250	565255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021008	GAG	2	6	565269	565274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021008	TCC	2	6	565338	565343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_021008	GCG	2	6	565359	565364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_021008	CGG	2	6	565384	565389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021008	GCC	3	9	565397	565405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_021008	CGG	2	6	565438	565443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021008	GGT	2	6	565463	565468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021008	GCA	2	6	565483	565488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_021008	CGG	2	6	565493	565498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021008	GCCG	2	8	565538	565545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_021008	TGA	2	6	565552	565557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021008	CG	3	6	565558	565563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_021008	GTG	2	6	565638	565643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021008	CAC	2	6	565673	565678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_021008	CGG	2	6	565744	565749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_021008	AGC	2	6	565794	565799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021008	GCG	2	6	565888	565893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021008	GCC	2	6	565946	565951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_021008	GTG	2	6	566048	566053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021008	GTT	2	6	566096	566101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021008	CCA	2	6	566110	566115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_021008	GGCT	2	8	566161	566168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_021008	CGG	2	6	566205	566210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_021008	CGG	2	6	566215	566220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021008	CGGCCA	2	12	566233	566244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_021008	GTG	2	6	566259	566264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021008	CGG	2	6	566266	566271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021008	CGG	2	6	566284	566289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_021008	GCG	2	6	566451	566456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_021008	N	309	309	566466	566774	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021008	GGT	2	6	566800	566805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021008	CAG	2	6	566809	566814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_021008	CGG	2	6	566817	566822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021008	CGGC	2	8	566840	566847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_021008	GCG	2	6	566849	566854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_021008	GGT	2	6	566890	566895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021008	GAA	2	6	566977	566982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021008	GGT	2	6	566983	566988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021008	CT	3	6	570624	570629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_021008	AGAGG	2	10	570634	570643	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021008	CA	3	6	570656	570661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_021008	CG	4	8	570697	570704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_021008	CCG	2	6	570756	570761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_021008	GC	3	6	570775	570780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_021008	AAG	2	6	570787	570792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021008	AAATCG	2	12	570826	570837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3587	NC_021008	GACCG	2	10	570937	570946	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3588	NC_021008	CGC	2	6	570959	570964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_021008	CCA	2	6	571004	571009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_021008	CCG	2	6	571046	571051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_021008	CATC	2	8	571063	571070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_021008	CCGC	2	8	571076	571083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3593	NC_021008	CTA	2	6	571728	571733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_021008	GCTA	2	8	571734	571741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_021008	CGG	2	6	571770	571775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021008	GTG	2	6	571859	571864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021008	CCGT	2	8	571865	571872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_021008	CG	3	6	571896	571901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_021008	CCT	2	6	571920	571925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_021008	ACG	2	6	572031	572036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_021008	TGCAGC	2	12	572051	572062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_021008	GCG	2	6	572073	572078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_021008	GAC	2	6	572131	572136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_021008	GTC	2	6	572137	572142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_021008	CATCAG	2	12	572148	572159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_021008	TACCGG	2	12	572160	572171	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021008	ACG	2	6	572172	572177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021008	AGC	2	6	572198	572203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_021008	CGT	2	6	572232	572237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_021008	ATC	2	6	572336	572341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_021008	CAGC	2	8	572344	572351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_021008	TCG	2	6	572363	572368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_021008	CG	4	8	572377	572384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_021008	TCG	2	6	572406	572411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_021008	CTGA	2	8	572425	572432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_021008	CGGC	2	8	572456	572463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_021008	CGG	2	6	572475	572480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_021008	CCA	2	6	572481	572486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_021008	TGG	2	6	572510	572515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021008	ATC	2	6	572543	572548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021008	GCG	2	6	572628	572633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021008	ATC	2	6	572651	572656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021008	GC	3	6	572714	572719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_021008	AAC	2	6	572825	572830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_021008	AT	3	6	572881	572886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021008	CAG	2	6	575769	575774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021008	TTCC	2	8	576604	576611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_021008	C	8	8	576610	576617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3629	NC_021008	CAC	2	6	576665	576670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_021008	CGGC	2	8	576697	576704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_021008	TC	3	6	576824	576829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3632	NC_021008	GCC	2	6	576960	576965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3634	NC_021008	GCT	2	6	576998	577003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3903	NC_021008	TTC	2	6	627286	627291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3904	NC_021008	TTC	2	6	627346	627351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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