MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021008	CAC	2	6	2276817	2276822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_021008	CAG	2	6	2276968	2276973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_021008	GTC	2	6	2276977	2276982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_021008	CGG	2	6	2277009	2277014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_021008	GGC	2	6	2277018	2277023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_021008	GCT	2	6	2277036	2277041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_021008	CGT	2	6	2277042	2277047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_021008	GAT	2	6	2277088	2277093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_021008	GTC	2	6	2277094	2277099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_021008	GCG	2	6	2277116	2277121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_021008	TCG	2	6	2277131	2277136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_021008	TCG	2	6	2277152	2277157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_021008	GCC	2	6	2277181	2277186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13514	NC_021008	TCT	2	6	2277219	2277224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_021008	TGGA	2	8	2277296	2277303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_021008	TCA	2	6	2277305	2277310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_021008	GCA	2	6	2277321	2277326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_021008	CG	3	6	2277354	2277359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13519	NC_021008	GAA	2	6	2277412	2277417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_021008	CAG	2	6	2277418	2277423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_021008	GAA	2	6	2277445	2277450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_021008	CCA	2	6	2277456	2277461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13523	NC_021008	CGT	2	6	2277462	2277467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_021008	GCC	2	6	2277499	2277504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13525	NC_021008	TCG	2	6	2277524	2277529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_021008	ACC	2	6	2277569	2277574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13527	NC_021008	GCG	2	6	2277637	2277642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_021008	GTC	2	6	2277643	2277648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_021008	CGA	2	6	2277660	2277665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_021008	TCG	2	6	2277668	2277673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_021008	TCG	2	6	2277677	2277682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_021008	GAT	2	6	2277685	2277690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_021008	CAG	2	6	2277847	2277852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_021008	CGGTGT	2	12	2277873	2277884	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13535	NC_021008	GCG	2	6	2277994	2277999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_021008	TGG	2	6	2278016	2278021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_021008	CTG	2	6	2278105	2278110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_021008	GTT	2	6	2278132	2278137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_021008	ACC	2	6	2278142	2278147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_021008	GAGCAC	2	12	2278168	2278179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_021008	TCG	2	6	2278208	2278213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_021008	GAC	2	6	2278267	2278272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_021008	ACC	2	6	2278310	2278315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13544	NC_021008	TGG	2	6	2278419	2278424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_021008	TGA	2	6	2278449	2278454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_021008	CAG	2	6	2278471	2278476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_021008	GGT	2	6	2278497	2278502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_021008	TGT	2	6	2278539	2278544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_021008	GCG	2	6	2278545	2278550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_021008	TGG	2	6	2278557	2278562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_021008	CGG	2	6	2278581	2278586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_021008	GCA	2	6	2278620	2278625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_021008	CGT	2	6	2278647	2278652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_021008	GGC	3	9	2278741	2278749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_021008	GTC	2	6	2278753	2278758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_021008	CGA	2	6	2278788	2278793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_021008	GGT	2	6	2278863	2278868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_021008	TTG	2	6	2278904	2278909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_021008	GCC	2	6	2278930	2278935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13560	NC_021008	GC	3	6	2279000	2279005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13561	NC_021008	CGA	2	6	2279007	2279012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_021008	CTG	2	6	2279053	2279058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_021008	CCT	2	6	2279118	2279123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13564	NC_021008	TCG	2	6	2279165	2279170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_021008	GTT	2	6	2279176	2279181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_021008	TGT	2	6	2279194	2279199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_021008	CCTC	2	8	2279228	2279235	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13568	NC_021008	GAGG	2	8	2279240	2279247	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_021008	GGA	2	6	2279250	2279255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_021008	CGA	2	6	2281485	2281490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_021008	TTTG	2	8	2281515	2281522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_021008	TCG	2	6	2284405	2284410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_021008	TACG	2	8	2284450	2284457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13574	NC_021008	GAT	2	6	2284483	2284488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_021008	AGTA	2	8	2284505	2284512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_021008	ATA	2	6	2284519	2284524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_021008	TCG	2	6	2284650	2284655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_021008	CAA	2	6	2284703	2284708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13579	NC_021008	CCG	2	6	2284733	2284738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13580	NC_021008	T	6	6	2284775	2284780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_021008	TCG	2	6	2284820	2284825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_021008	TCGC	2	8	2284869	2284876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13583	NC_021008	TC	3	6	2284909	2284914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13584	NC_021008	T	7	7	2284924	2284930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_021008	GTC	2	6	2284958	2284963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_021008	CCA	2	6	2285036	2285041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13587	NC_021008	AGTC	2	8	2285080	2285087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13588	NC_021008	TC	3	6	2285107	2285112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13589	NC_021008	ACA	2	6	2286661	2286666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_021008	ATA	2	6	2286668	2286673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_021008	AACA	2	8	2286735	2286742	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13592	NC_021008	TGGT	2	8	2286773	2286780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_021008	CCG	2	6	2286784	2286789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13594	NC_021008	GT	3	6	2286807	2286812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_021008	TCCG	2	8	2286841	2286848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13596	NC_021008	GCA	2	6	2286904	2286909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_021008	TCG	2	6	2287186	2287191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13598	NC_021008	CGA	2	6	2287208	2287213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13599	NC_021008	CAT	2	6	2287215	2287220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_021008	GAT	2	6	2287221	2287226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_021008	GAC	2	6	2287227	2287232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_021008	CTG	2	6	2287344	2287349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_021008	GC	3	6	2287373	2287378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13604	NC_021008	TTCGC	2	10	2287404	2287413	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13605	NC_021008	CAG	2	6	2287419	2287424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_021008	CTT	2	6	2287476	2287481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13607	NC_021008	TGA	2	6	2287491	2287496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_021008	TGG	2	6	2287498	2287503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_021008	AC	3	6	2287536	2287541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13610	NC_021008	TTG	2	6	2287546	2287551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_021008	TAT	2	6	2287556	2287561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_021008	GCCG	2	8	2287650	2287657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13613	NC_021008	CGA	2	6	2287675	2287680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_021008	T	6	6	2287701	2287706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_021008	AG	3	6	2287769	2287774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_021008	TA	3	6	2287829	2287834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_021008	CGA	2	6	2289453	2289458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_021008	GTC	2	6	2289490	2289495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_021008	AAAC	2	8	2289499	2289506	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13620	NC_021008	CGT	2	6	2289530	2289535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_021008	ATG	2	6	2290339	2290344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_021008	CAT	2	6	2290457	2290462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_021008	AGG	2	6	2290502	2290507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_021008	GAG	2	6	2291543	2291548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_021008	AGC	2	6	2291559	2291564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13626	NC_021008	ATT	2	6	2292875	2292880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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