MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021008	CGG	3	9	2202369	2202377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_021008	TCCACG	2	12	2202452	2202463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13003	NC_021008	CGG	2	6	2202908	2202913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_021008	GA	3	6	2202963	2202968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_021008	GCTG	2	8	2202974	2202981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13006	NC_021008	ATG	2	6	2203000	2203005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_021008	CG	3	6	2203028	2203033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_021008	TGA	2	6	2203060	2203065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_021008	GGT	2	6	2203104	2203109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021008	TCG	2	6	2203141	2203146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_021008	GC	3	6	2203148	2203153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_021008	CAG	2	6	2203155	2203160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_021008	GCC	2	6	2203179	2203184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_021008	GCA	2	6	2203211	2203216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_021008	CGC	2	6	2203292	2203297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13016	NC_021008	CTT	2	6	2203317	2203322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_021008	ACC	2	6	2203405	2203410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_021008	GC	3	6	2203457	2203462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_021008	TGG	2	6	2203547	2203552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_021008	GTC	2	6	2203560	2203565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_021008	GTG	2	6	2203618	2203623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_021008	GAG	2	6	2203681	2203686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_021008	CGT	2	6	2203700	2203705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_021008	GCC	2	6	2203713	2203718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_021008	GGCGAC	2	12	2203803	2203814	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_021008	GCC	2	6	2203863	2203868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_021008	GTG	2	6	2203888	2203893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_021008	TGCCGT	2	12	2203901	2203912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_021008	ATT	2	6	2203932	2203937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_021008	CGG	3	9	2203994	2204002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_021008	AGA	2	6	2204005	2204010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021008	CGGGC	2	10	2204051	2204060	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13033	NC_021008	CAC	2	6	2205238	2205243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_021008	GC	3	6	2205274	2205279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_021008	GTG	2	6	2207812	2207817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_021008	CGC	2	6	2207818	2207823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13037	NC_021008	T	6	6	2207882	2207887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_021008	GGA	2	6	2207933	2207938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_021008	GTC	2	6	2208661	2208666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_021008	CCG	2	6	2213946	2213951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_021008	CCCCT	2	10	2217038	2217047	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
13042	NC_021008	CAA	2	6	2217074	2217079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_021008	CGC	2	6	2217145	2217150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_021008	CTC	2	6	2219105	2219110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_021008	CTG	2	6	2219150	2219155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_021008	GGC	2	6	2219162	2219167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_021008	CGG	2	6	2219315	2219320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_021008	CCG	2	6	2219368	2219373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_021008	ATC	2	6	2219400	2219405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_021008	CCG	2	6	2219418	2219423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_021008	CAC	2	6	2219438	2219443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_021008	CTG	2	6	2219456	2219461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_021008	GTT	3	9	2219498	2219506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_021008	ATC	2	6	2219531	2219536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_021008	CGTTAC	2	12	2219540	2219551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_021008	GCCGCT	2	12	2219552	2219563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_021008	GCA	2	6	2219572	2219577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_021008	CCTTG	2	10	2219605	2219614	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13059	NC_021008	TG	3	6	2219619	2219624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_021008	CTG	2	6	2219702	2219707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_021008	CCA	2	6	2219737	2219742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13062	NC_021008	TGG	2	6	2219758	2219763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021008	CAG	2	6	2219798	2219803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_021008	GAC	2	6	2219822	2219827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_021008	ACC	2	6	2219840	2219845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13066	NC_021008	TCT	2	6	2219901	2219906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_021008	CGC	2	6	2219920	2219925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13068	NC_021008	TAT	2	6	2219942	2219947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_021008	TATC	2	8	2220469	2220476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_021008	T	6	6	2220486	2220491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_021008	CCA	2	6	2220589	2220594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_021008	GTG	2	6	2220688	2220693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_021008	GCG	2	6	2220699	2220704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_021008	TTGGC	2	10	2220733	2220742	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13075	NC_021008	CAA	2	6	2220791	2220796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_021008	AAT	2	6	2220801	2220806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_021008	AC	3	6	2220863	2220868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_021008	GC	3	6	2220922	2220927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13079	NC_021008	CA	3	6	2220957	2220962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13080	NC_021008	ACG	2	6	2220975	2220980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_021008	TCG	2	6	2221005	2221010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_021008	T	9	9	2221070	2221078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_021008	CAA	2	6	2221747	2221752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_021008	CACG	2	8	2221774	2221781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_021008	CAA	2	6	2221782	2221787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_021008	TCA	2	6	2221800	2221805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_021008	ACC	2	6	2221810	2221815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13088	NC_021008	ATGC	2	8	2221855	2221862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13089	NC_021008	CGC	2	6	2221899	2221904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13090	NC_021008	AAG	2	6	2222296	2222301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_021008	GATG	2	8	2222312	2222319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_021008	CTT	2	6	2222332	2222337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_021008	CGG	2	6	2222344	2222349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_021008	GCG	2	6	2222432	2222437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_021008	GC	3	6	2222470	2222475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13096	NC_021008	CGG	2	6	2222481	2222486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_021008	TTCC	2	8	2224945	2224952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_021008	TAT	2	6	2224971	2224976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_021008	CG	3	6	2224979	2224984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_021008	TCG	2	6	2224992	2224997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_021008	ACG	2	6	2225025	2225030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_021008	GTAA	2	8	2225575	2225582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_021008	CCA	2	6	2225584	2225589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_021008	GCG	2	6	2225590	2225595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_021008	ATT	2	6	2225648	2225653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_021008	TCA	2	6	2226091	2226096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_021008	AG	3	6	2226102	2226107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_021008	TTTA	2	8	2226162	2226169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_021008	CGC	2	6	2227290	2227295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_021008	GCG	2	6	2227353	2227358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_021008	CTG	2	6	2227360	2227365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_021008	CAG	2	6	2228969	2228974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_021008	CAA	2	6	2228987	2228992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_021008	CAC	2	6	2229006	2229011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_021008	CAT	2	6	2229078	2229083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_021008	GCTG	2	8	2229149	2229156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13117	NC_021008	ATC	2	6	2229328	2229333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_021008	ACG	2	6	2229408	2229413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_021008	ACA	2	6	2229442	2229447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_021008	TTG	2	6	2229518	2229523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_021008	AGTC	2	8	2230333	2230340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_021008	CCG	2	6	2230400	2230405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13123	NC_021008	ATC	2	6	2230433	2230438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_021008	CCG	2	6	2230480	2230485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_021008	TC	3	6	2230535	2230540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13126	NC_021008	A	6	6	2230601	2230606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_021008	CTC	2	6	2230611	2230616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13249	NC_021008	TTC	2	6	2245448	2245453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13251	NC_021008	CA	3	6	2245624	2245629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13252	NC_021008	A	6	6	2245665	2245670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_021008	ACAG	2	8	2245684	2245691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13255	NC_021008	CATC	2	8	2245738	2245745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13256	NC_021008	GAT	2	6	2245754	2245759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13258	NC_021008	CAA	2	6	2245803	2245808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13259	NC_021008	A	6	6	2245850	2245855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13260	NC_021008	CTC	2	6	2245886	2245891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13368	NC_021008	GCA	2	6	2265875	2265880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13379	NC_021008	TTG	2	6	2266662	2266667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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