MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021008	TTG	2	6	2138367	2138372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_021008	GAA	2	6	2138408	2138413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_021008	GC	3	6	2138454	2138459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_021008	CGC	2	6	2138509	2138514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12505	NC_021008	GCA	2	6	2138539	2138544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_021008	GCAG	2	8	2138590	2138597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12507	NC_021008	TCA	2	6	2138626	2138631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_021008	GAC	2	6	2138636	2138641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_021008	GCGG	2	8	2138698	2138705	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12510	NC_021008	TCA	2	6	2138737	2138742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_021008	GAA	2	6	2138774	2138779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_021008	AGT	2	6	2138791	2138796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_021008	CGG	2	6	2138803	2138808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_021008	GCC	2	6	2138910	2138915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_021008	CTG	2	6	2138938	2138943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_021008	CGG	2	6	2138984	2138989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_021008	ATT	2	6	2138993	2138998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_021008	GTT	3	9	2139014	2139022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_021008	TGT	2	6	2139032	2139037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_021008	CAA	2	6	2139098	2139103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_021008	A	7	7	2139102	2139108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_021008	CAT	2	6	2139115	2139120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_021008	TAA	2	6	2139217	2139222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_021008	CCT	2	6	2139270	2139275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_021008	GGC	2	6	2139404	2139409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_021008	CGC	2	6	2139437	2139442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12527	NC_021008	CCGC	2	8	2139471	2139478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12528	NC_021008	CTGC	2	8	2139482	2139489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12529	NC_021008	TCGCCT	2	12	2139502	2139513	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12530	NC_021008	AG	3	6	2139555	2139560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_021008	CTG	2	6	2140656	2140661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_021008	CTG	2	6	2142343	2142348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_021008	CTCGT	2	10	2142349	2142358	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12534	NC_021008	CGG	2	6	2142365	2142370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_021008	GCGG	2	8	2142453	2142460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12536	NC_021008	ACT	2	6	2142495	2142500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_021008	GC	3	6	2142505	2142510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12538	NC_021008	TGCG	2	8	2144102	2144109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12539	NC_021008	TGTT	2	8	2144118	2144125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_021008	GTAT	2	8	2144148	2144155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_021008	TTG	2	6	2144295	2144300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_021008	TTGAG	2	10	2144318	2144327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_021008	CGT	2	6	2144338	2144343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_021008	CCAAA	2	10	2144363	2144372	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12545	NC_021008	CGA	2	6	2145598	2145603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_021008	ACG	2	6	2145681	2145686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_021008	CG	3	6	2145723	2145728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_021008	A	6	6	2145756	2145761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_021008	GCC	2	6	2145782	2145787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12550	NC_021008	ATC	2	6	2145814	2145819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_021008	AG	3	6	2146705	2146710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_021008	GAG	2	6	2146736	2146741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_021008	CTTTC	2	10	2148118	2148127	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12554	NC_021008	TGA	2	6	2148130	2148135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_021008	CCT	2	6	2149008	2149013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_021008	GAT	2	6	2149057	2149062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_021008	GAA	2	6	2149063	2149068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_021008	GC	3	6	2149164	2149169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_021008	CAT	2	6	2149249	2149254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_021008	GAT	3	9	2149261	2149269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_021008	GATCA	2	10	2149318	2149327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12562	NC_021008	CAT	2	6	2149363	2149368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_021008	CTG	2	6	2149378	2149383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_021008	CCG	2	6	2149422	2149427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_021008	CAG	2	6	2149471	2149476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_021008	GCC	2	6	2149501	2149506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_021008	GAA	2	6	2149522	2149527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_021008	CAG	2	6	2149579	2149584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_021008	TGA	3	9	2149599	2149607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_021008	GTC	2	6	2149610	2149615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_021008	ACCG	2	8	2149631	2149638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12572	NC_021008	TTC	2	6	2149685	2149690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_021008	CCCA	2	8	2149694	2149701	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12574	NC_021008	ACG	2	6	2149763	2149768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_021008	ACA	2	6	2149785	2149790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12576	NC_021008	GTAG	2	8	2149793	2149800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_021008	CAC	2	6	2149825	2149830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12578	NC_021008	TCTCC	2	10	2149857	2149866	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12579	NC_021008	AGA	2	6	2149882	2149887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_021008	TCT	2	6	2149936	2149941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_021008	CT	3	6	2149979	2149984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12582	NC_021008	TTA	2	6	2150000	2150005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_021008	CAG	2	6	2152513	2152518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_021008	ACG	2	6	2152571	2152576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_021008	AGG	2	6	2152588	2152593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_021008	CCG	2	6	2152615	2152620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12587	NC_021008	GC	3	6	2152631	2152636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12588	NC_021008	CG	3	6	2152659	2152664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12589	NC_021008	ATC	2	6	2152667	2152672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12592	NC_021008	CGC	2	6	2152773	2152778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12593	NC_021008	CGT	2	6	2152810	2152815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_021008	GCC	2	6	2152883	2152888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12595	NC_021008	GCC	2	6	2152918	2152923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12596	NC_021008	CTC	2	6	2152943	2152948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_021008	TGG	2	6	2152984	2152989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_021008	GCC	2	6	2153039	2153044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12599	NC_021008	CAG	2	6	2153075	2153080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12601	NC_021008	CTT	2	6	2153246	2153251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12603	NC_021008	TGT	2	6	2153287	2153292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_021008	GCC	3	9	2153328	2153336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12605	NC_021008	GCC	2	6	2153408	2153413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12606	NC_021008	GCGG	2	8	2153426	2153433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12607	NC_021008	GTT	2	6	2153510	2153515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_021008	CG	3	6	2153554	2153559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_021008	TCG	2	6	2153601	2153606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_021008	CCGGT	2	10	2153678	2153687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12611	NC_021008	GCCCG	2	10	2153695	2153704	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12612	NC_021008	CG	3	6	2153746	2153751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12613	NC_021008	TGCA	2	8	2155330	2155337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12614	NC_021008	CCA	2	6	2155413	2155418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12615	NC_021008	GTA	2	6	2155421	2155426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_021008	ACTG	2	8	2155436	2155443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12617	NC_021008	CAC	2	6	2155484	2155489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_021008	GCA	2	6	2155491	2155496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_021008	A	6	6	2155496	2155501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_021008	AAG	2	6	2155508	2155513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_021008	CAT	2	6	2155622	2155627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_021008	CTGG	2	8	2155747	2155754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12623	NC_021008	GCG	2	6	2155770	2155775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_021008	GGC	2	6	2155776	2155781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_021008	CGG	2	6	2155865	2155870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_021008	CAC	2	6	2155945	2155950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12628	NC_021008	TCT	2	6	2156025	2156030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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