MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021008	GGTC	2	8	2057234	2057241	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12002	NC_021008	CTC	2	6	2057271	2057276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12003	NC_021008	TCT	2	6	2057282	2057287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_021008	GGTC	2	8	2057465	2057472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12005	NC_021008	TTG	2	6	2057545	2057550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_021008	CGG	2	6	2057597	2057602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_021008	TGG	4	12	2057642	2057653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_021008	GAC	2	6	2057670	2057675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_021008	TGG	2	6	2057681	2057686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_021008	TGG	2	6	2057780	2057785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_021008	TTG	2	6	2057791	2057796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_021008	CCGG	2	8	2057890	2057897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12013	NC_021008	CGT	2	6	2057984	2057989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_021008	GCT	2	6	2057997	2058002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_021008	TCG	2	6	2058031	2058036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12016	NC_021008	TTG	2	6	2058091	2058096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_021008	CTG	2	6	2058132	2058137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_021008	CCG	2	6	2058280	2058285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12019	NC_021008	TGCGGT	2	12	2058324	2058335	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12020	NC_021008	CTT	2	6	2058414	2058419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_021008	TCT	2	6	2058635	2058640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_021008	GTT	2	6	2058750	2058755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_021008	TCG	2	6	2058838	2058843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_021008	GT	3	6	2058850	2058855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_021008	GAA	2	6	2058915	2058920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_021008	TGG	2	6	2059025	2059030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_021008	GCC	2	6	2059041	2059046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12028	NC_021008	GCA	2	6	2059169	2059174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_021008	GTT	2	6	2059179	2059184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_021008	GCC	2	6	2059248	2059253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12031	NC_021008	GCC	2	6	2059368	2059373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12032	NC_021008	TTC	2	6	2059444	2059449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12033	NC_021008	GGT	3	9	2059470	2059478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_021008	GCC	2	6	2059479	2059484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12035	NC_021008	GGA	2	6	2059539	2059544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_021008	GCA	2	6	2059559	2059564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_021008	GGA	2	6	2059584	2059589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_021008	CCA	2	6	2059619	2059624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12039	NC_021008	ACT	2	6	2059693	2059698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12040	NC_021008	GTT	2	6	2059743	2059748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_021008	CGG	2	6	2059787	2059792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_021008	CAG	2	6	2059794	2059799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_021008	GTT	2	6	2059803	2059808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_021008	TGG	2	6	2059844	2059849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_021008	CAT	2	6	2059853	2059858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12046	NC_021008	GGC	2	6	2059881	2059886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12047	NC_021008	TGT	2	6	2059925	2059930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12049	NC_021008	GCC	2	6	2059959	2059964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_021008	GCC	2	6	2060052	2060057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12051	NC_021008	GCC	2	6	2060071	2060076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_021008	GGT	2	6	2060121	2060126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_021008	ATC	2	6	2060149	2060154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12054	NC_021008	GAA	2	6	2060194	2060199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_021008	CA	3	6	2060212	2060217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12056	NC_021008	TGT	2	6	2060237	2060242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_021008	CGATGC	2	12	2060312	2060323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12058	NC_021008	GCG	2	6	2060370	2060375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12059	NC_021008	AGCG	2	8	2060441	2060448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12060	NC_021008	CAT	2	6	2060469	2060474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12061	NC_021008	GTC	2	6	2060484	2060489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12062	NC_021008	GCC	2	6	2060493	2060498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12063	NC_021008	AGC	2	6	2060566	2060571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12064	NC_021008	CTT	2	6	2060607	2060612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12065	NC_021008	GTG	2	6	2060626	2060631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12071	NC_021008	GGT	2	6	2060864	2060869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_021008	CTG	2	6	2060916	2060921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12073	NC_021008	GGT	2	6	2060922	2060927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12074	NC_021008	GCC	2	6	2060952	2060957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12075	NC_021008	CAT	2	6	2060984	2060989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12077	NC_021008	CTGG	2	8	2061153	2061160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12082	NC_021008	CGT	2	6	2061398	2061403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12083	NC_021008	GCA	2	6	2061497	2061502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12085	NC_021008	TCT	2	6	2061536	2061541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12086	NC_021008	CTG	2	6	2061627	2061632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12088	NC_021008	GT	3	6	2061670	2061675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12089	NC_021008	CTT	2	6	2061680	2061685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12090	NC_021008	GGC	2	6	2061810	2061815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12091	NC_021008	AGCC	2	8	2061878	2061885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12092	NC_021008	TTG	2	6	2061898	2061903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12093	NC_021008	GCG	2	6	2062024	2062029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12094	NC_021008	CGT	2	6	2062040	2062045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12095	NC_021008	CCG	2	6	2062051	2062056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12096	NC_021008	CCA	2	6	2062060	2062065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12097	NC_021008	GCC	2	6	2062089	2062094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12098	NC_021008	TCG	2	6	2062129	2062134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_021008	TGCCT	2	10	2062161	2062170	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12100	NC_021008	TGG	2	6	2062187	2062192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_021008	CGC	2	6	2062278	2062283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12102	NC_021008	CGC	2	6	2062343	2062348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12103	NC_021008	AATC	2	8	2062364	2062371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12104	NC_021008	GTT	2	6	2062437	2062442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_021008	CAGA	2	8	2062484	2062491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12106	NC_021008	C	9	9	2062509	2062517	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12108	NC_021008	GTT	2	6	2062784	2062789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_021008	CAT	2	6	2062810	2062815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_021008	TGCA	2	8	2062884	2062891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12111	NC_021008	AGA	2	6	2062907	2062912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_021008	AAT	2	6	2062950	2062955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_021008	CAG	2	6	2062956	2062961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_021008	CAG	2	6	2063006	2063011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_021008	AC	3	6	2063533	2063538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12116	NC_021008	A	6	6	2063614	2063619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_021008	ACACC	2	10	2063706	2063715	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
12118	NC_021008	TTGGC	2	10	2063721	2063730	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12119	NC_021008	GTT	2	6	2063747	2063752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12120	NC_021008	CGT	2	6	2063753	2063758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12121	NC_021008	CG	3	6	2063921	2063926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12122	NC_021008	CTAT	2	8	2064049	2064056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12123	NC_021008	GGAA	2	8	2064477	2064484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12124	NC_021008	CG	4	8	2066028	2066035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12125	NC_021008	AGC	2	6	2066048	2066053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12127	NC_021008	TGCC	2	8	2066134	2066141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12383	NC_021008	GCCGA	2	10	2115513	2115522	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12384	NC_021008	AAG	2	6	2115664	2115669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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