MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021008	GAT	2	6	1455870	1455875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_021008	CG	4	8	1455879	1455886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9003	NC_021008	GCGA	2	8	1455895	1455902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9004	NC_021008	TCA	2	6	1456495	1456500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_021008	G	6	6	1456592	1456597	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_021008	GA	3	6	1456619	1456624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_021008	CGAT	2	8	1456707	1456714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9008	NC_021008	TAT	2	6	1456761	1456766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_021008	TTGC	2	8	1456789	1456796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9010	NC_021008	TGC	2	6	1456801	1456806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_021008	CGGT	2	8	1458000	1458007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9012	NC_021008	CAG	2	6	1458085	1458090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_021008	GCC	2	6	1458121	1458126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9014	NC_021008	CTC	2	6	1458148	1458153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9015	NC_021008	CTC	2	6	1458232	1458237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9016	NC_021008	TGC	2	6	1458263	1458268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_021008	CGG	2	6	1458276	1458281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_021008	GGC	2	6	1458295	1458300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_021008	GTG	2	6	1458332	1458337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_021008	CCG	2	6	1458350	1458355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9021	NC_021008	CG	3	6	1458426	1458431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9022	NC_021008	GCCTTG	2	12	1458509	1458520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_021008	GCG	2	6	1458521	1458526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_021008	CGC	2	6	1459165	1459170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9025	NC_021008	ACG	2	6	1459187	1459192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_021008	CTT	2	6	1459254	1459259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_021008	CTC	3	9	1459308	1459316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_021008	TGG	2	6	1459415	1459420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_021008	CAG	2	6	1459533	1459538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_021008	GGC	2	6	1459545	1459550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_021008	CAG	2	6	1459593	1459598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_021008	GTC	2	6	1459599	1459604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_021008	CGA	2	6	1459607	1459612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_021008	TGA	2	6	1459709	1459714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_021008	GTA	2	6	1459722	1459727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_021008	TTG	2	6	1459786	1459791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_021008	GGA	2	6	1459800	1459805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_021008	CGG	3	9	1459850	1459858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_021008	ATG	2	6	1459870	1459875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_021008	GCC	2	6	1459917	1459922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9041	NC_021008	TCG	2	6	1459924	1459929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_021008	CCTT	2	8	1459948	1459955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_021008	TTC	2	6	1459966	1459971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_021008	GC	3	6	1459996	1460001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9045	NC_021008	ATG	2	6	1460089	1460094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_021008	GCC	2	6	1460130	1460135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9047	NC_021008	CGG	2	6	1460159	1460164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_021008	CGG	2	6	1460168	1460173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_021008	AGC	2	6	1460184	1460189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_021008	ATC	2	6	1460254	1460259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_021008	GTC	2	6	1460262	1460267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_021008	GC	3	6	1460272	1460277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_021008	CAG	2	6	1460282	1460287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_021008	GCC	2	6	1460355	1460360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_021008	CCAGGC	2	12	1460429	1460440	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9056	NC_021008	CG	3	6	1460509	1460514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9057	NC_021008	ACT	2	6	1460539	1460544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_021008	AGT	2	6	1460583	1460588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_021008	AAC	2	6	1460608	1460613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_021008	TTAGCG	2	12	1460625	1460636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9061	NC_021008	GCC	2	6	1460653	1460658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9062	NC_021008	TCGC	2	8	1461642	1461649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9063	NC_021008	ATC	2	6	1461681	1461686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_021008	ACG	2	6	1461694	1461699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_021008	ATGAAT	2	12	1461702	1461713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_021008	CTC	2	6	1465955	1465960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_021008	GC	3	6	1466012	1466017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9068	NC_021008	CCGG	2	8	1466043	1466050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9069	NC_021008	CGC	2	6	1466076	1466081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_021008	AGGT	2	8	1470001	1470008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_021008	GTTCT	2	10	1470036	1470045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9072	NC_021008	GTG	2	6	1470172	1470177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_021008	ACC	2	6	1470244	1470249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9074	NC_021008	TTCC	2	8	1470293	1470300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9075	NC_021008	GAA	3	9	1470303	1470311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_021008	TTGC	2	8	1470391	1470398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9077	NC_021008	CTC	2	6	1470411	1470416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9078	NC_021008	CAA	2	6	1470425	1470430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_021008	GACCGC	2	12	1470498	1470509	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9080	NC_021008	GCCG	2	8	1470528	1470535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9081	NC_021008	TCA	2	6	1470545	1470550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9083	NC_021008	GCA	2	6	1470579	1470584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_021008	GGCA	2	8	1470663	1470670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9085	NC_021008	GCT	3	9	1470688	1470696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_021008	GGT	2	6	1470732	1470737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_021008	GC	3	6	1470767	1470772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9088	NC_021008	CGGC	2	8	1470797	1470804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9089	NC_021008	CGGCG	2	10	1470855	1470864	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9090	NC_021008	CAC	2	6	1470912	1470917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9091	NC_021008	ACC	2	6	1470937	1470942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9092	NC_021008	TGA	2	6	1471007	1471012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_021008	AAT	2	6	1471045	1471050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_021008	CGG	2	6	1471052	1471057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9095	NC_021008	TCT	2	6	1471063	1471068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9096	NC_021008	GTG	2	6	1471114	1471119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_021008	AGC	2	6	1471150	1471155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_021008	GGCG	2	8	1471191	1471198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9099	NC_021008	AACG	2	8	1471255	1471262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9100	NC_021008	CGG	3	9	1471298	1471306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_021008	CAC	2	6	1471490	1471495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9102	NC_021008	TCG	2	6	1471524	1471529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_021008	CGGCG	2	10	1471534	1471543	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9104	NC_021008	TGA	2	6	1471726	1471731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_021008	TCA	2	6	1471861	1471866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_021008	GGC	2	6	1471973	1471978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_021008	GCC	2	6	1472012	1472017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9108	NC_021008	ATG	2	6	1472019	1472024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_021008	GCCT	2	8	1472065	1472072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9110	NC_021008	GCT	2	6	1472081	1472086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_021008	CGGC	2	8	1472092	1472099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9112	NC_021008	CGG	2	6	1472155	1472160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_021008	CGG	2	6	1472164	1472169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_021008	ACTGA	2	10	1472188	1472197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9115	NC_021008	A	6	6	1474104	1474109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_021008	TGA	2	6	1474194	1474199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_021008	A	6	6	1474219	1474224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_021008	CGGT	2	8	1475057	1475064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9119	NC_021008	GACG	2	8	1475072	1475079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9120	NC_021008	T	7	7	1476703	1476709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_021008	CG	3	6	1476769	1476774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9122	NC_021008	T	6	6	1476823	1476828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_021008	TGC	2	6	1476850	1476855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_021008	GCG	2	6	1476935	1476940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_021008	GTC	2	6	1477059	1477064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_021008	GCC	2	6	1477085	1477090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9127	NC_021008	GT	3	6	1477134	1477139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_021008	AC	3	6	1479949	1479954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9130	NC_021008	TGCCTT	2	12	1482555	1482566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9257	NC_021008	CAT	2	6	1514139	1514144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9391	NC_021008	CTG	2	6	1545513	1545518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9394	NC_021008	CTGA	2	8	1546936	1546943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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