MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021008	TTC	2	6	1334022	1334027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_021008	CA	3	6	1334113	1334118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8503	NC_021008	TTC	2	6	1335099	1335104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_021008	CTG	2	6	1335153	1335158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_021008	CTG	2	6	1335160	1335165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_021008	TTGG	2	8	1335172	1335179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_021008	GTG	2	6	1335204	1335209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_021008	GGGA	2	8	1335264	1335271	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_021008	CCG	2	6	1335274	1335279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8510	NC_021008	TAGTG	2	10	1335353	1335362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_021008	TTGC	2	8	1335388	1335395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8512	NC_021008	TTG	2	6	1335548	1335553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_021008	GCG	2	6	1335563	1335568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_021008	TTCG	2	8	1335603	1335610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8515	NC_021008	GC	3	6	1335688	1335693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8516	NC_021008	GCG	2	6	1335723	1335728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_021008	CGG	2	6	1335820	1335825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_021008	GGT	2	6	1335835	1335840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_021008	GGA	2	6	1335880	1335885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_021008	GTC	2	6	1335902	1335907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_021008	GCG	2	6	1335986	1335991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_021008	ATT	2	6	1336038	1336043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_021008	CGG	2	6	1336125	1336130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_021008	ATCG	2	8	1336142	1336149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8525	NC_021008	ATC	2	6	1336180	1336185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_021008	TGC	2	6	1336197	1336202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_021008	CGG	2	6	1336267	1336272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_021008	GAA	2	6	1336313	1336318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_021008	GTG	2	6	1336364	1336369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_021008	GGTGAA	2	12	1336393	1336404	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_021008	TGC	3	9	1336455	1336463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_021008	CAA	2	6	1336477	1336482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_021008	ATC	2	6	1336514	1336519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_021008	GGCA	2	8	1336560	1336567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8535	NC_021008	CGATAT	2	12	1336579	1336590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8536	NC_021008	CTG	2	6	1336628	1336633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_021008	TCT	2	6	1336649	1336654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_021008	GTAT	2	8	1336662	1336669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_021008	AAC	2	6	1336791	1336796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_021008	ACAGA	2	10	1336828	1336837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8541	NC_021008	GAC	2	6	1336861	1336866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_021008	ACCGA	2	10	1337001	1337010	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8543	NC_021008	CAT	2	6	1337034	1337039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_021008	GAA	2	6	1337058	1337063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_021008	CGA	2	6	1337103	1337108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_021008	GCGCG	2	10	1337127	1337136	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8547	NC_021008	CGC	2	6	1337210	1337215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8548	NC_021008	CGA	2	6	1337246	1337251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_021008	GAC	2	6	1337316	1337321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_021008	GGC	2	6	1337882	1337887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_021008	CGA	2	6	1337900	1337905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_021008	GCC	2	6	1337934	1337939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8553	NC_021008	ATC	2	6	1337953	1337958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_021008	TAT	2	6	1338019	1338024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_021008	CGT	3	9	1338065	1338073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_021008	TCC	2	6	1340259	1340264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8557	NC_021008	TTC	2	6	1340372	1340377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_021008	AAT	2	6	1340378	1340383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_021008	CAT	2	6	1342542	1342547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_021008	GCTT	2	8	1342556	1342563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8561	NC_021008	TCC	2	6	1344073	1344078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_021008	TGA	2	6	1347519	1347524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8564	NC_021008	GAT	3	9	1351370	1351378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_021008	GAA	2	6	1351389	1351394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_021008	GC	3	6	1351401	1351406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8567	NC_021008	GTC	2	6	1351471	1351476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_021008	GAT	2	6	1351615	1351620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_021008	ACG	2	6	1353093	1353098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_021008	CG	3	6	1353106	1353111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8571	NC_021008	CGCA	2	8	1353230	1353237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8572	NC_021008	TGA	2	6	1353309	1353314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_021008	TGA	2	6	1353356	1353361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_021008	GCC	2	6	1353380	1353385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8583	NC_021008	A	8	8	1355095	1355102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8588	NC_021008	GCCGC	2	10	1361356	1361365	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8589	NC_021008	GGCT	2	8	1361366	1361373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8592	NC_021008	TCC	2	6	1363108	1363113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8596	NC_021008	GAA	2	6	1363254	1363259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_021008	CAA	2	6	1363305	1363310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_021008	TGC	2	6	1364763	1364768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_021008	CT	3	6	1364770	1364775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8600	NC_021008	TG	3	6	1364860	1364865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_021008	CTG	2	6	1364968	1364973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8603	NC_021008	TGT	2	6	1365021	1365026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_021008	CTG	2	6	1365071	1365076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_021008	GCT	2	6	1365088	1365093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_021008	TGT	2	6	1365118	1365123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_021008	AT	3	6	1365139	1365144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_021008	GCG	2	6	1365182	1365187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_021008	CGC	2	6	1366671	1366676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8610	NC_021008	AATAC	2	10	1366720	1366729	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8611	NC_021008	CCGA	2	8	1366742	1366749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8612	NC_021008	CTTT	2	8	1368592	1368599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8613	NC_021008	CT	3	6	1368612	1368617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8614	NC_021008	GGC	2	6	1368637	1368642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_021008	AG	3	6	1368675	1368680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_021008	AT	3	6	1368691	1368696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_021008	CTCA	2	8	1370354	1370361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8618	NC_021008	TCG	2	6	1370392	1370397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_021008	CGG	2	6	1370402	1370407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_021008	CAG	2	6	1370408	1370413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_021008	CGGACT	2	12	1370429	1370440	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8622	NC_021008	GC	3	6	1370512	1370517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8623	NC_021008	TGA	2	6	1370582	1370587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_021008	GTT	2	6	1370601	1370606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_021008	CTG	2	6	1370622	1370627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_021008	TGG	2	6	1370762	1370767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_021008	GCT	2	6	1370798	1370803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8629	NC_021008	TTGACC	2	12	1371025	1371036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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