MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 14260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021008	ACC	2	6	1115082	1115087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7002	NC_021008	TA	3	6	1115133	1115138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_021008	CGC	2	6	1116053	1116058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_021008	AC	3	6	1116129	1116134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7005	NC_021008	GAA	2	6	1116451	1116456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_021008	CGG	2	6	1116557	1116562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_021008	T	6	6	1116671	1116676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_021008	TGG	2	6	1116694	1116699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_021008	CT	3	6	1118849	1118854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_021008	ATC	2	6	1119516	1119521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_021008	TCGTT	2	10	1119559	1119568	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7012	NC_021008	CAT	2	6	1119572	1119577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_021008	AAT	2	6	1119585	1119590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_021008	CCG	2	6	1120433	1120438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_021008	ACGTGG	2	12	1120453	1120464	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7016	NC_021008	GCC	2	6	1120617	1120622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_021008	CGC	3	9	1120637	1120645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_021008	AGA	2	6	1120720	1120725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_021008	GCC	2	6	1120788	1120793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_021008	TGCGC	2	10	1120820	1120829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7021	NC_021008	GCG	2	6	1120849	1120854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_021008	AAC	2	6	1120861	1120866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_021008	CCG	2	6	1120873	1120878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_021008	CGC	3	9	1120917	1120925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_021008	GTA	2	6	1120946	1120951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_021008	GTT	2	6	1120964	1120969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_021008	GGC	2	6	1122720	1122725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_021008	GTT	2	6	1122754	1122759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_021008	AAC	2	6	1122766	1122771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_021008	ATCGC	2	10	1123229	1123238	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7031	NC_021008	CAGT	2	8	1123866	1123873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7032	NC_021008	CCAA	2	8	1126061	1126068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_021008	TGA	2	6	1126072	1126077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021008	GCT	2	6	1126153	1126158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_021008	GTC	2	6	1126179	1126184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_021008	GTT	2	6	1127503	1127508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_021008	AAG	2	6	1127527	1127532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_021008	AGC	2	6	1127672	1127677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_021008	GAG	2	6	1127680	1127685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_021008	TGG	2	6	1127708	1127713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_021008	CGG	2	6	1127790	1127795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_021008	GCGCG	2	10	1127808	1127817	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7043	NC_021008	GCC	2	6	1127929	1127934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7044	NC_021008	CCG	2	6	1127951	1127956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_021008	CCA	2	6	1127966	1127971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_021008	CT	3	6	1128009	1128014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7047	NC_021008	CAG	2	6	1128136	1128141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_021008	GCC	2	6	1128142	1128147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_021008	AGC	2	6	1128191	1128196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_021008	CGG	2	6	1128198	1128203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_021008	ACA	2	6	1128218	1128223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_021008	GGACGC	2	12	1128231	1128242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_021008	CAA	2	6	1128300	1128305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_021008	AAG	2	6	1128349	1128354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_021008	CGG	2	6	1128384	1128389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_021008	TCG	2	6	1128461	1128466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_021008	GCCG	2	8	1128480	1128487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_021008	CTG	2	6	1128496	1128501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_021008	AAG	3	9	1128508	1128516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_021008	GCC	2	6	1128543	1128548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7061	NC_021008	GGC	2	6	1128580	1128585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_021008	CTGAT	2	10	1128602	1128611	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7063	NC_021008	CGA	2	6	1128624	1128629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_021008	GCC	2	6	1128661	1128666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_021008	CTG	2	6	1128736	1128741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_021008	GC	3	6	1128816	1128821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7067	NC_021008	TTC	2	6	1128880	1128885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_021008	GGC	2	6	1128946	1128951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_021008	GAG	2	6	1128964	1128969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_021008	AAG	2	6	1128985	1128990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_021008	CTT	2	6	1129026	1129031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_021008	CT	3	6	1129045	1129050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7073	NC_021008	AGC	2	6	1129057	1129062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_021008	CGT	2	6	1129252	1129257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_021008	TCA	2	6	1129263	1129268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_021008	CTG	2	6	1129271	1129276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_021008	GCC	2	6	1129298	1129303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_021008	CAT	2	6	1129327	1129332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_021008	TTC	2	6	1129353	1129358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_021008	AGC	2	6	1130416	1130421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_021008	AT	3	6	1130441	1130446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_021008	GTAT	2	8	1130487	1130494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_021008	CCG	2	6	1131341	1131346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_021008	GTC	2	6	1131357	1131362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_021008	TGG	2	6	1131436	1131441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_021008	TCA	2	6	1131491	1131496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_021008	TTC	2	6	1131514	1131519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_021008	CGA	3	9	1131573	1131581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_021008	TCC	2	6	1131604	1131609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7090	NC_021008	CGC	2	6	1131669	1131674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7091	NC_021008	GC	3	6	1131678	1131683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7092	NC_021008	CAC	2	6	1131756	1131761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7093	NC_021008	GTG	2	6	1131763	1131768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_021008	TGC	2	6	1131791	1131796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_021008	GAG	2	6	1131808	1131813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_021008	GC	3	6	1131874	1131879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7097	NC_021008	CCG	3	9	1131914	1131922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7098	NC_021008	TAC	2	6	1131930	1131935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_021008	GCC	2	6	1132030	1132035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7100	NC_021008	GC	4	8	1132103	1132110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_021008	GGCC	2	8	1132113	1132120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7102	NC_021008	GGTG	2	8	1132128	1132135	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_021008	GCTG	2	8	1132137	1132144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7104	NC_021008	ATC	2	6	1132170	1132175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_021008	GCC	2	6	1132196	1132201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7106	NC_021008	GCC	2	6	1132204	1132209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7107	NC_021008	TGG	2	6	1132286	1132291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_021008	GGC	2	6	1132297	1132302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_021008	CACAGG	2	12	1132343	1132354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_021008	ACC	3	9	1132411	1132419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7111	NC_021008	TGC	2	6	1132439	1132444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_021008	GCC	2	6	1132447	1132452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_021008	CAA	2	6	1132476	1132481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_021008	CGA	2	6	1132485	1132490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_021008	GCC	2	6	1132510	1132515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7116	NC_021008	CTG	2	6	1132585	1132590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_021008	TGG	2	6	1132670	1132675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_021008	GCC	2	6	1132676	1132681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7119	NC_021008	GTC	2	6	1132695	1132700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_021008	GC	3	6	1132717	1132722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7121	NC_021008	GAA	2	6	1132723	1132728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_021008	CG	3	6	1132760	1132765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_021008	CGA	2	6	1132773	1132778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_021008	CGGC	2	8	1132820	1132827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7125	NC_021008	GCC	2	6	1132835	1132840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_021008	ATT	2	6	1132865	1132870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_021008	CT	3	6	1132872	1132877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7128	NC_021008	GCC	2	6	1132888	1132893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_021008	AGC	2	6	1133042	1133047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7375	NC_021008	CAG	2	6	1178517	1178522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7382	NC_021008	A	7	7	1180197	1180203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7383	NC_021008	AC	3	6	1182824	1182829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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