MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 11696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11503	NC_020410	GC	3	6	3869932	3869937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11505	NC_020410	AAT	2	6	3870879	3870884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020410	ATTTT	2	10	3870888	3870897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_020410	TTTA	2	8	3870903	3870910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_020410	A	6	6	3871553	3871558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_020410	A	6	6	3871593	3871598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_020410	CTTCA	2	10	3872020	3872029	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11511	NC_020410	CTTT	2	8	3873132	3873139	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_020410	AATT	2	8	3873145	3873152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_020410	AT	3	6	3873169	3873174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_020410	AAT	2	6	3873176	3873181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_020410	T	6	6	3873209	3873214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_020410	T	6	6	3873219	3873224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_020410	A	7	7	3873225	3873231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020410	ATT	2	6	3874153	3874158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_020410	T	6	6	3874157	3874162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_020410	AGGA	2	8	3874235	3874242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_020410	TCAT	2	8	3874293	3874300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11522	NC_020410	TAA	2	6	3874311	3874316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_020410	T	6	6	3874791	3874796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020410	ATT	2	6	3874814	3874819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11527	NC_020410	ATT	2	6	3875359	3875364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020410	T	7	7	3875388	3875394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_020410	TG	3	6	3875423	3875428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020410	A	7	7	3875461	3875467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11532	NC_020410	TC	3	6	3875577	3875582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11533	NC_020410	CTG	2	6	3875592	3875597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11535	NC_020410	TAC	2	6	3875634	3875639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11537	NC_020410	A	6	6	3876604	3876609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_020410	AT	3	6	3876616	3876621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020410	T	6	6	3876637	3876642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020410	A	6	6	3876661	3876666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020410	TGA	2	6	3876702	3876707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11543	NC_020410	ATA	2	6	3877182	3877187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020410	CT	3	6	3877198	3877203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_020410	CATT	2	8	3877234	3877241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11546	NC_020410	TCCAT	2	10	3878164	3878173	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11548	NC_020410	T	6	6	3879130	3879135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020410	AT	4	8	3879168	3879175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020410	GCC	2	6	3879198	3879203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11551	NC_020410	GGC	2	6	3879209	3879214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_020410	T	6	6	3879215	3879220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020410	AAG	2	6	3879241	3879246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020410	TA	3	6	3879305	3879310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020410	TCC	2	6	3880769	3880774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11556	NC_020410	ATC	2	6	3880818	3880823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_020410	TTA	2	6	3880830	3880835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_020410	TGGT	2	8	3880858	3880865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_020410	T	7	7	3881890	3881896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11562	NC_020410	A	7	7	3882298	3882304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_020410	TGT	2	6	3882320	3882325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_020410	TTTTA	2	10	3882330	3882339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020410	T	7	7	3882348	3882354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_020410	TCTT	2	8	3882986	3882993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11569	NC_020410	ATCG	2	8	3883065	3883072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11570	NC_020410	AAT	2	6	3883087	3883092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11574	NC_020410	AG	3	6	3883209	3883214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11601	NC_020410	GGTAA	2	10	3885279	3885288	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_020410	T	7	7	3885298	3885304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_020410	A	7	7	3885305	3885311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11608	NC_020410	TAGC	2	8	3885490	3885497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11609	NC_020410	TTCCT	2	10	3888332	3888341	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11610	NC_020410	TA	3	6	3888384	3888389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020410	AAG	2	6	3888394	3888399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11614	NC_020410	A	7	7	3889866	3889872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_020410	T	7	7	3890290	3890296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_020410	CTC	2	6	3891275	3891280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11617	NC_020410	A	6	6	3891294	3891299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020410	GCA	2	6	3891300	3891305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11630	NC_020410	CT	4	8	3895869	3895876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11631	NC_020410	TCCTC	2	10	3897897	3897906	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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11633	NC_020410	TTTA	2	8	3898168	3898175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11693	NC_020410	C	6	6	3910272	3910277	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11696	NC_020410	T	7	7	3910309	3910315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.