MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-233

Total Repeats: 1443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020394	GCA	2	6	26	31	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020394	TATAT	2	10	331	340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020394	AAG	2	6	348	353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020394	T	6	6	374	379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020394	T	6	6	442	447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020394	A	6	6	477	482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020394	AAAG	2	8	521	528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020394	TCA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020394	A	7	7	732	738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020394	AAG	2	6	742	747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020394	T	6	6	779	784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020394	T	6	6	787	792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020394	AAT	2	6	794	799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020394	TCA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020394	TAA	2	6	2039	2044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020394	ATA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020394	GAT	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020394	TAC	2	6	2100	2105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020394	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020394	ATA	2	6	2133	2138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020394	ATTAGG	2	12	2163	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020394	TAAA	2	8	2196	2203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020394	ATG	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020394	ATA	2	6	2229	2234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020394	TTA	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020394	TAA	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020394	TAG	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020394	A	8	8	2312	2319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020394	GAT	2	6	2368	2373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020394	ATA	2	6	2409	2414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020394	TAGAT	2	10	2465	2474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020394	TAA	2	6	2487	2492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020394	TTA	2	6	2510	2515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020394	GTT	2	6	2539	2544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020394	AT	3	6	2572	2577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020394	TTC	2	6	2592	2597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020394	T	6	6	2606	2611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020394	TTTAT	2	10	2644	2653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020394	T	7	7	2653	2659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020394	CCT	2	6	2671	2676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020394	TCC	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020394	AT	3	6	2748	2753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020394	TAATA	2	10	2771	2780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020394	ATAA	2	8	2844	2851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020394	TA	4	8	2877	2884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020394	TTAG	2	8	2947	2954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020394	A	6	6	2971	2976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020394	TA	3	6	2982	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020394	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020394	AT	3	6	3060	3065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020394	ATA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020394	TAAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020394	GCA	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020394	CATA	2	8	3273	3280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020394	TA	3	6	5965	5970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020394	TTA	2	6	5973	5978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020394	CTT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020394	A	6	6	6061	6066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020394	TGG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020394	CTA	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020394	TG	3	6	6102	6107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020394	TTTC	2	8	6143	6150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020394	ACA	2	6	6156	6161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020394	TAGT	2	8	6327	6334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020394	AACT	2	8	6406	6413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020394	A	7	7	6505	6511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020394	TTC	2	6	6522	6527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020394	AAGG	2	8	6563	6570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020394	CATC	2	8	6576	6583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020394	AAT	2	6	6600	6605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020394	ATA	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020394	TA	3	6	6720	6725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020394	CAT	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020394	ATG	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020394	TAA	2	6	7249	7254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020394	TTC	2	6	7434	7439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020394	GGTT	2	8	7457	7464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020394	TGG	2	6	7622	7627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020394	GTG	2	6	7682	7687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020394	AGT	2	6	7688	7693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020394	AT	3	6	7700	7705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020394	TTA	2	6	7769	7774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020394	C	6	6	7841	7846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_020394	TGT	2	6	7932	7937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020394	ATG	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020394	ACTC	2	8	8040	8047	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020394	ATA	2	6	8049	8054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020394	CA	3	6	8088	8093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020394	TCATTG	2	12	8114	8125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020394	T	7	7	8185	8191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020394	ATTGC	2	10	8235	8244	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020394	CAA	2	6	8264	8269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020394	TTA	2	6	8312	8317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020394	AGG	2	6	8340	8345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020394	ATT	2	6	8367	8372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020394	TAA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020394	A	6	6	8516	8521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020394	ATT	2	6	8591	8596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020394	TTC	2	6	8625	8630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020394	ACTA	2	8	8647	8654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020394	AATA	2	8	8693	8700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020394	GGT	2	6	8738	8743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020394	ATGAG	2	10	10846	10855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020394	AACA	2	8	10881	10888	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020394	AT	3	6	10931	10936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020394	CAA	2	6	10937	10942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020394	TTA	2	6	10974	10979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020394	A	7	7	10986	10992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020394	TTAA	2	8	10999	11006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020394	CTAT	2	8	11010	11017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020394	TTA	2	6	11024	11029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020394	A	6	6	12372	12377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020394	C	6	6	12646	12651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_020394	TCT	2	6	12654	12659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020394	TA	3	6	12663	12668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020394	AT	3	6	12691	12696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020394	ACAA	2	8	12736	12743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020394	TATTT	2	10	12756	12765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020394	AT	3	6	12779	12784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020394	ATTT	2	8	12826	12833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020394	AT	3	6	12861	12866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020394	ATTAA	2	10	12869	12878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020394	TAGT	2	8	12907	12914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020394	TAA	2	6	12936	12941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020394	TTC	2	6	13526	13531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020394	A	6	6	13640	13645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020394	TTC	2	6	13722	13727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020394	CTT	2	6	13737	13742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020394	TTA	2	6	13772	13777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020394	ACA	2	6	13815	13820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020394	TAA	2	6	13832	13837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020394	TAC	2	6	13838	13843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020394	TCT	2	6	13844	13849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020394	AGTA	2	8	16239	16246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020394	TTA	2	6	16264	16269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020394	CTT	2	6	21231	21236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020394	TAGG	2	8	21241	21248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020394	ATT	3	9	21267	21275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020394	AG	3	6	21278	21283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020394	CT	3	6	21301	21306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020394	TACC	2	8	21487	21494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020394	T	6	6	21499	21504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020394	ATG	2	6	21509	21514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020394	AAT	2	6	21525	21530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020394	A	7	7	21576	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020394	AT	3	6	21584	21589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020394	A	7	7	21594	21600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020394	ATA	2	6	21605	21610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020394	ACTT	2	8	21644	21651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020394	CTAA	2	8	21683	21690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020394	A	7	7	21718	21724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020394	AGA	2	6	21734	21739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020394	TAAAAA	2	12	21924	21935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020394	TCT	2	6	21973	21978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_020394	ATT	2	6	22039	22044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020394	CT	3	6	22347	22352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_020394	ATA	2	6	22393	22398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020394	AAAT	2	8	22443	22450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020394	A	6	6	22451	22456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020394	ACA	2	6	22476	22481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_020394	CTC	2	6	23266	23271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_020394	AAT	2	6	23273	23278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020394	ATT	2	6	23360	23365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020394	TAA	2	6	23379	23384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020394	AT	3	6	26210	26215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020394	TA	3	6	26222	26227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020394	GATA	2	8	26242	26249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020394	TATG	2	8	26264	26271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020394	AGGA	2	8	26350	26357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020394	TCT	2	6	26359	26364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_020394	GT	3	6	26700	26705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020394	CT	3	6	26726	26731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_020394	TTCCT	2	10	26753	26762	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_020394	A	7	7	26774	26780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020394	TAAA	2	8	27859	27866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020394	A	6	6	27887	27892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020394	AT	3	6	27973	27978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_020394	T	6	6	28053	28058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020394	CTG	2	6	28070	28075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_020394	AT	3	6	28077	28082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_020394	AC	3	6	28084	28089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_020394	ACA	2	6	28091	28096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_020394	T	6	6	28178	28183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020394	AAAAT	2	10	29389	29398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_020394	ATT	2	6	32741	32746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020394	T	7	7	32798	32804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020394	ATTTT	2	10	33895	33904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020394	T	6	6	33901	33906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_020394	AAT	2	6	34690	34695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_020394	TATT	2	8	34721	34728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020394	A	6	6	34746	34751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020394	ATA	2	6	34757	34762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_020394	ATA	2	6	34817	34822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_020394	CCA	2	6	41371	41376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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221	NC_020394	A	6	6	86657	86662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_020394	T	6	6	94692	94697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_020394	AAAT	2	8	113895	113902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_020394	CTC	2	6	116681	116686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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