MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-107

Total Repeats: 485

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020393	T	7	7	132	138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020393	GAA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020393	ATG	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020393	AGC	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020393	TCA	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020393	CCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020393	TCC	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020393	TGC	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020393	TAC	2	6	2071	2076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020393	TTC	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020393	TC	3	6	2198	2203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020393	CGC	2	6	2209	2214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_020393	CCG	2	6	2222	2227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020393	TTG	2	6	2265	2270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020393	GGAGT	2	10	2436	2445	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020393	A	6	6	3547	3552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020393	GATG	2	8	3629	3636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020393	TG	3	6	3635	3640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020393	AAG	2	6	3666	3671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020393	ATTA	2	8	3727	3734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020393	ATA	3	9	3751	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020393	ATATT	2	10	3765	3774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020393	TAC	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020393	TTC	2	6	3842	3847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020393	TAT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020393	TAA	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020393	AAATA	2	10	4005	4014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020393	A	7	7	4051	4057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020393	A	7	7	4073	4079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020393	TTCT	2	8	4085	4092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020393	T	6	6	4117	4122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020393	A	6	6	5548	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020393	A	6	6	5616	5621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020393	A	6	6	5768	5773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020393	CT	3	6	5783	5788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020393	ACT	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020393	TAAT	2	8	5863	5870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020393	TTA	2	6	5873	5878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020393	GAT	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020393	CTC	2	6	9592	9597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020393	TTC	2	6	9635	9640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020393	T	6	6	9689	9694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020393	CTA	2	6	9811	9816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020393	AATATA	2	12	9825	9836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020393	TA	4	8	9842	9849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020393	TAA	2	6	9852	9857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020393	TA	4	8	9873	9880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020393	TA	3	6	10028	10033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020393	ATT	2	6	10080	10085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020393	ATT	2	6	10136	10141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020393	TCC	2	6	14098	14103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020393	TTTA	2	8	14134	14141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020393	T	6	6	14147	14152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020393	TAG	2	6	14166	14171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020393	A	9	9	14178	14186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020393	T	6	6	14240	14245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020393	A	7	7	14300	14306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020393	T	7	7	14325	14331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020393	GAAA	2	8	14347	14354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020393	TTG	2	6	14375	14380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020393	CTT	2	6	14385	14390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020393	TACA	2	8	14426	14433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020393	AT	3	6	14441	14446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020393	T	6	6	14451	14456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020393	TAT	2	6	14878	14883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020393	A	7	7	14948	14954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020393	TA	3	6	15289	15294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020393	ATAG	2	8	16815	16822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020393	AATAA	2	10	16824	16833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020393	TATCA	2	10	16963	16972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020393	T	6	6	16980	16985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020393	CGA	2	6	17001	17006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020393	AGC	2	6	17031	17036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020393	CAA	2	6	17148	17153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020393	ATA	2	6	17183	17188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020393	TTA	2	6	17198	17203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020393	ATT	2	6	17509	17514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020393	TTA	2	6	17533	17538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020393	ACA	2	6	17565	17570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020393	AAG	2	6	17584	17589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020393	ATT	3	9	17614	17622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020393	A	7	7	17665	17671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020393	CTTT	2	8	17851	17858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020393	ATT	2	6	17860	17865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020393	GA	3	6	18140	18145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020393	GA	4	8	18395	18402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020393	TAA	2	6	18433	18438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020393	ATC	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020393	AAG	2	6	18467	18472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020393	GT	3	6	18474	18479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020393	CTA	2	6	18634	18639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020393	TTC	3	9	18649	18657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020393	AT	3	6	18658	18663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020393	TAA	2	6	18676	18681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020393	TCC	2	6	21212	21217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020393	ATTT	2	8	21234	21241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020393	T	8	8	21239	21246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020393	ATA	2	6	21247	21252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020393	ACA	2	6	21256	21261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020393	TTG	2	6	21269	21274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020393	CAA	2	6	21284	21289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020393	T	6	6	21309	21314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020393	T	6	6	25796	25801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020393	TCA	2	6	25837	25842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020393	TCA	2	6	25887	25892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020393	TTG	2	6	25971	25976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020393	AATT	2	8	26003	26010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020393	CCT	2	6	26056	26061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020393	TTGT	2	8	26066	26073	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020393	ATG	2	6	26102	26107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020393	AATA	2	8	26113	26120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020393	ATT	2	6	26126	26131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020393	AGG	2	6	26143	26148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020393	TTA	2	6	30410	30415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020393	ATCA	2	8	30446	30453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020393	ATA	2	6	30454	30459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020393	ACA	2	6	30461	30466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020393	TAT	2	6	30477	30482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020393	TAA	2	6	30528	30533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020393	TAT	2	6	30542	30547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020393	A	6	6	30582	30587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020393	TA	3	6	30588	30593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020393	A	6	6	31835	31840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020393	AGTTG	2	10	31845	31854	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020393	TGAG	2	8	31857	31864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020393	TAG	2	6	31891	31896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020393	A	6	6	31907	31912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020393	ATATA	2	10	31915	31924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020393	GAA	2	6	31942	31947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020393	ATT	2	6	31951	31956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020393	GCT	2	6	32000	32005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020393	GTA	2	6	32007	32012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020393	ATT	2	6	32052	32057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020393	AAT	2	6	32080	32085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020393	TGT	2	6	32121	32126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020393	CTT	2	6	32173	32178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020393	TA	3	6	32185	32190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020393	AT	3	6	33276	33281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020393	TA	3	6	33285	33290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020393	ATA	2	6	33360	33365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020393	GAT	2	6	33397	33402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020393	AT	3	6	33401	33406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020393	T	7	7	33426	33432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020393	AGG	2	6	33456	33461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020393	AATA	2	8	33764	33771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020393	GGT	2	6	33809	33814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020393	AAT	2	6	35910	35915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020393	ATA	2	6	35932	35937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020393	AAATA	2	10	35943	35952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020393	ATT	2	6	35965	35970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_020393	TAAT	2	8	36293	36300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_020393	A	6	6	36377	36382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020393	ATA	2	6	36384	36389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_020393	ATA	2	6	36523	36528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_020393	AGG	2	6	68439	68444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_020393	AAG	2	6	72365	72370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020393	AAT	2	6	72918	72923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020393	TC	3	6	74837	74842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
291	NC_020393	TTTTAA	2	12	74853	74864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020393	GGA	2	6	74878	74883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_020393	TAA	2	6	99814	99819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_020393	A	7	7	99827	99833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_020393	CTT	2	6	99860	99865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_020393	TAA	2	6	100306	100311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_020393	TAA	2	6	100343	100348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_020393	TTTAA	2	10	100372	100381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_020393	ACA	3	9	100404	100412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_020393	TTG	2	6	100439	100444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_020393	ATT	2	6	100484	100489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_020393	TAT	2	6	100495	100500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_020393	ATA	2	6	101805	101810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_020393	TAA	2	6	102486	102491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_020393	ATT	2	6	102499	102504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_020393	TAA	2	6	102561	102566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_020393	ATT	2	6	102590	102595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_020393	TTAT	2	8	102618	102625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_020393	AT	3	6	102624	102629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_020393	TA	3	6	102671	102676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_020393	T	7	7	103791	103797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_020393	TAA	2	6	104958	104963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_020393	TAA	2	6	105004	105009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_020393	T	6	6	105027	105032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_020393	AT	3	6	106783	106788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_020393	TTA	2	6	107401	107406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.