MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-6

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020390	T	6	6	3	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020390	TTGT	2	8	87	94	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020390	TTGT	2	8	171	178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020390	T	6	6	197	202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020390	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020390	TC	3	6	259	264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020390	T	7	7	296	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020390	TGT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020390	TCT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020390	TTTCT	2	10	423	432	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020390	T	7	7	437	443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020390	TTG	2	6	459	464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020390	T	6	6	470	475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020390	TGT	2	6	514	519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020390	ACT	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020390	T	6	6	633	638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020390	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020390	TCT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020390	GTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020390	AATG	2	8	904	911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020390	TAC	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020390	T	6	6	1025	1030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020390	CAA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020390	AAT	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020390	ACT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020390	GA	3	6	1242	1247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020390	TTG	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020390	CCA	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020390	TCT	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020390	A	6	6	2174	2179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020390	GAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020390	TA	4	8	2275	2282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020390	AG	5	10	2291	2300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020390	A	8	8	2311	2318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020390	AT	3	6	2324	2329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020390	GT	3	6	2350	2355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020390	AC	3	6	2390	2395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020390	A	8	8	2404	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020390	TTA	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020390	AATT	2	8	3119	3126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020390	TAAT	2	8	3142	3149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020390	A	7	7	3161	3167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020390	CTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020390	GTT	2	6	3182	3187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020390	AAC	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020390	T	7	7	3218	3224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020390	AT	3	6	3263	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020390	T	7	7	3272	3278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020390	TTA	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020390	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020390	T	6	6	3359	3364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020390	AT	3	6	3410	3415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020390	TAA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020390	AT	3	6	3437	3442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020390	ATA	2	6	3469	3474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020390	A	6	6	3484	3489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020390	TTTA	2	8	4779	4786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020390	A	6	6	5082	5087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020390	CAT	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020390	AAT	2	6	5961	5966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020390	AT	3	6	5975	5980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020390	AATC	2	8	6032	6039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020390	CAA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020390	A	6	6	6069	6074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020390	A	6	6	6076	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020390	ATCT	2	8	6089	6096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020390	ACT	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020390	TTTC	2	8	6232	6239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020390	A	7	7	6314	6320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020390	T	7	7	6345	6351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020390	A	6	6	6437	6442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020390	TA	4	8	6449	6456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020390	T	6	6	6471	6476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020390	ACC	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_020390	GAC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020390	CAC	2	6	6682	6687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020390	T	6	6	6724	6729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020390	ACA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020390	TAA	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.