MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-16

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020380	A	6	6	39	44	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020380	A	6	6	2323	2328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020380	T	7	7	2341	2347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020380	GTA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020380	TGT	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020380	TACT	2	8	2462	2469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020380	TGT	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020380	ATTTTC	2	12	2500	2511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020380	ATT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020380	T	6	6	2533	2538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020380	ATT	2	6	2545	2550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020380	TAT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020380	ATA	2	6	2568	2573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020380	ATA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020380	TAT	2	6	2591	2596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020380	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020380	T	7	7	2875	2881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020380	ATT	2	6	2925	2930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020380	T	7	7	2929	2935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020380	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020380	TTA	2	6	4264	4269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020380	AT	4	8	4276	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020380	ACA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020380	A	7	7	4472	4478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020380	ACA	2	6	4508	4513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020380	T	7	7	4530	4536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020380	ATT	2	6	4549	4554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020380	AAT	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020380	ATA	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020380	T	8	8	5327	5334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020380	A	6	6	5363	5368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020380	A	6	6	5385	5390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020380	A	6	6	5407	5412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020380	C	7	7	5421	5427	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_020380	T	10	10	5452	5461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020380	CTCTTA	2	12	5464	5475	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020380	TA	5	10	5474	5483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020380	T	7	7	5510	5516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020380	GGA	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020380	CGCTA	2	10	5664	5673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_020380	ATA	2	6	5769	5774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020380	A	6	6	5789	5794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020380	TAAAAA	2	12	5813	5824	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020380	A	6	6	5835	5840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020380	AAAC	2	8	5849	5856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020380	GTTT	2	8	5874	5881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020380	A	6	6	5926	5931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020380	AT	3	6	5950	5955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020380	TA	4	8	6011	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020380	CTT	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020380	TAC	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020380	GCGGG	2	10	6121	6130	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020380	GA	3	6	6137	6142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020380	AGT	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020380	ATA	2	6	6165	6170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020380	AG	3	6	6171	6176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020380	AAGAG	2	10	6178	6187	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020380	AGAA	2	8	6202	6209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020380	TAA	2	6	6222	6227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020380	GGA	2	6	6244	6249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020380	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020380	GGT	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020380	AGA	2	6	6329	6334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020380	AG	3	6	6363	6368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020380	TAG	2	6	6378	6383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020380	AG	3	6	7033	7038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020380	ATTA	2	8	8936	8943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020380	GTA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020380	AGAC	2	8	9484	9491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020380	AAG	2	6	9658	9663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020380	A	6	6	11034	11039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020380	TTA	2	6	11615	11620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020380	T	7	7	11647	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020380	A	6	6	11665	11670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020380	TA	3	6	11683	11688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020380	ATG	2	6	11698	11703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020380	T	6	6	11764	11769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020380	GAA	2	6	11778	11783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020380	ATGA	2	8	11796	11803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020380	A	6	6	11841	11846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020380	ATAA	2	8	11905	11912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020380	GTT	2	6	11933	11938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020380	AT	3	6	11946	11951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020380	A	6	6	11973	11978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020380	TAA	2	6	12031	12036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020380	CTT	2	6	12058	12063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020380	AGA	2	6	12078	12083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020380	A	6	6	12088	12093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020380	T	6	6	12097	12102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020380	TA	3	6	12135	12140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020380	ATG	2	6	12191	12196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020380	TATAT	2	10	12203	12212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020380	TCA	2	6	12241	12246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020380	CTAA	2	8	12247	12254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020380	TG	3	6	12290	12295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020380	T	6	6	12308	12313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020380	A	6	6	12401	12406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020380	T	6	6	12431	12436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020380	TATT	2	8	12451	12458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020380	TCTAG	2	10	12485	12494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020380	AGAA	2	8	12507	12514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020380	A	6	6	12520	12525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020380	GAA	2	6	12592	12597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020380	ATTG	2	8	12622	12629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020380	TAGA	2	8	12661	12668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020380	C	6	6	12676	12681	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_020380	ATA	2	6	12844	12849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020380	T	7	7	12892	12898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020380	TAA	2	6	12906	12911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020380	T	6	6	12917	12922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020380	TTG	2	6	12936	12941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020380	T	6	6	12953	12958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020380	ATT	2	6	12962	12967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020380	AT	3	6	12982	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020380	AT	3	6	13006	13011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020380	GTTTTT	2	12	13032	13043	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020380	ATGG	2	8	13044	13051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020380	AT	4	8	13060	13067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020380	ATT	3	9	13073	13081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020380	ATC	2	6	13085	13090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020380	TA	3	6	13130	13135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020380	A	6	6	13161	13166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020380	T	7	7	13197	13203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020380	ATTA	2	8	13204	13211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020380	TTTA	2	8	13212	13219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020380	T	6	6	13223	13228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020380	GTA	2	6	13229	13234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020380	AGA	2	6	13555	13560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020380	TAAAAA	2	12	13575	13586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020380	A	7	7	13582	13588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020380	AAAG	2	8	13605	13612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020380	TAG	2	6	13870	13875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020380	TAAA	2	8	13881	13888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020380	A	6	6	14476	14481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020380	AT	3	6	14489	14494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020380	ATT	2	6	14496	14501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020380	T	7	7	14521	14527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020380	A	6	6	14532	14537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020380	ACA	2	6	14542	14547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020380	TGT	2	6	14560	14565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020380	TAA	2	6	14577	14582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020380	ATAA	2	8	14620	14627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020380	GGA	2	6	14660	14665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020380	CTGG	2	8	15729	15736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020380	GAA	2	6	15809	15814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020380	TCT	2	6	15896	15901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020380	TTA	2	6	15917	15922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020380	CAA	2	6	15935	15940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020380	AAT	2	6	15953	15958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020380	TTC	2	6	16011	16016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020380	TATG	2	8	16021	16028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020380	AAGCA	2	10	16050	16059	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_020380	GTATA	2	10	16078	16087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.