MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-15

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020379	GT	4	8	1278	1285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020379	T	6	6	1315	1320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020379	ATTTT	2	10	1342	1351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020379	A	8	8	1394	1401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020379	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020379	TCC	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020379	TATT	2	8	5317	5324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020379	ATTTAT	2	12	5357	5368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020379	ACA	2	6	5382	5387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020379	TGT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020379	ATT	2	6	5406	5411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020379	T	6	6	5410	5415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020379	A	7	7	5420	5426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020379	AAT	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020379	AT	3	6	5453	5458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020379	T	6	6	5466	5471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020379	T	7	7	5494	5500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020379	TAG	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020379	TAA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020379	ATG	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020379	AGG	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020379	CCT	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020379	AAAGAG	2	12	6553	6564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020379	TA	3	6	7352	7357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020379	TAT	2	6	7373	7378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020379	ATT	2	6	7381	7386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020379	T	6	6	7385	7390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020379	AGG	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020379	ATT	2	6	7558	7563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020379	CG	3	6	7594	7599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020379	ATAAA	2	10	7622	7631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020379	TAA	2	6	7669	7674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020379	A	7	7	7673	7679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020379	TAAA	2	8	7685	7692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020379	TGT	2	6	7698	7703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020379	ACTTG	2	10	7739	7748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020379	TAC	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020379	ATA	2	6	8117	8122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020379	CCG	2	6	8172	8177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020379	CGC	2	6	8225	8230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020379	T	6	6	8265	8270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020379	GAT	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020379	A	6	6	8355	8360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020379	AGTA	2	8	8401	8408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020379	AAT	2	6	8427	8432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020379	ATTA	2	8	8456	8463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020379	TTC	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020379	T	6	6	8785	8790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020379	GAC	2	6	8981	8986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020379	ACT	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020379	CCGT	2	8	9016	9023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020379	TA	3	6	9101	9106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020379	TAA	2	6	9122	9127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020379	CGC	2	6	9165	9170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_020379	ATC	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020379	ATT	2	6	9259	9264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020379	GGAAC	2	10	9416	9425	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020379	TAT	2	6	9509	9514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020379	TAA	2	6	9580	9585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020379	T	6	6	9717	9722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020379	CATTTC	2	12	9927	9938	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020379	ATT	2	6	11036	11041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020379	TAT	2	6	11230	11235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020379	CTA	2	6	11245	11250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020379	A	7	7	11254	11260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020379	TTG	2	6	11281	11286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020379	TC	3	6	11359	11364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020379	TGT	2	6	11447	11452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020379	AGT	2	6	11491	11496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020379	TTCA	2	8	11625	11632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020379	ACCA	2	8	11641	11648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020379	A	6	6	11648	11653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020379	CT	3	6	11658	11663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020379	T	6	6	11672	11677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020379	ATT	2	6	11681	11686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020379	CCT	2	6	11698	11703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020379	TAA	2	6	11726	11731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020379	A	6	6	11730	11735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020379	TC	3	6	11986	11991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020379	TA	3	6	12007	12012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020379	T	6	6	12048	12053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020379	TGT	2	6	12056	12061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020379	T	6	6	12075	12080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020379	AAAAG	2	10	12150	12159	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020379	AT	3	6	12214	12219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020379	ACGA	2	8	12231	12238	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020379	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020379	AAT	2	6	12299	12304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020379	CTA	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020379	ATA	2	6	12416	12421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020379	TTA	2	6	12423	12428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020379	TAA	2	6	12450	12455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020379	TAT	2	6	12486	12491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020379	TA	3	6	12525	12530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020379	TA	3	6	12533	12538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020379	G	7	7	12544	12550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020379	TG	3	6	12561	12566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020379	TCT	2	6	12573	12578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020379	TCC	2	6	14046	14051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_020379	TAA	2	6	14059	14064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020379	CTT	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020379	TTG	2	6	14797	14802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020379	AAC	2	6	14816	14821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020379	ATAAC	2	10	14833	14842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020379	CTTTA	2	10	14865	14874	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020379	A	7	7	14943	14949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020379	TTCT	2	8	14955	14962	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020379	T	6	6	14988	14993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020379	CTT	2	6	15058	15063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020379	T	6	6	15062	15067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020379	AGA	2	6	15068	15073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020379	A	7	7	15080	15086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.