MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-9

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020378	GAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020378	CAT	3	9	82	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020378	GATT	2	8	228	235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020378	GAA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020378	CTT	2	6	352	357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020378	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020378	TA	3	6	482	487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020378	TCA	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020378	ATC	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020378	ATG	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020378	ATA	2	6	656	661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020378	TCA	3	9	681	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020378	ATTCA	2	10	764	773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020378	TCG	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020378	TAA	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020378	GTT	2	6	922	927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020378	CTT	2	6	931	936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020378	TAA	2	6	1036	1041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020378	TCT	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020378	T	6	6	1064	1069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020378	TGCT	2	8	1076	1083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020378	T	6	6	1100	1105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020378	TTTG	2	8	1110	1117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020378	TCA	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020378	TCC	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020378	TATT	2	8	2939	2946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020378	ATTTAT	2	12	2979	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020378	ACA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020378	TGT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020378	ATT	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020378	T	6	6	3032	3037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020378	A	7	7	3042	3048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020378	AAT	2	6	3068	3073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020378	AT	3	6	3075	3080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020378	T	7	7	3088	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020378	T	7	7	3117	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020378	T	6	6	3203	3208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020378	TAT	2	6	3217	3222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020378	T	6	6	3243	3248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020378	T	9	9	3575	3583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020378	TCC	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020378	ATT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020378	ATT	2	6	4441	4446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020378	TTCAAA	2	12	4482	4493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020378	A	6	6	4511	4516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020378	TTA	2	6	4528	4533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020378	AAT	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020378	GAA	2	6	4645	4650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020378	A	6	6	4744	4749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020378	TA	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020378	GAGAGT	2	12	4850	4861	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020378	CTA	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020378	TTA	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020378	ATTAAA	2	12	4964	4975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020378	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020378	TTA	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020378	AATT	2	8	5670	5677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020378	TAAT	2	8	5693	5700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020378	A	7	7	5712	5718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020378	T	7	7	5770	5776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020378	TCAT	2	8	5837	5844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020378	A	7	7	5854	5860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020378	T	7	7	5918	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020378	T	6	6	6033	6038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020378	TGA	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020378	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020378	CTTT	2	8	6153	6160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020378	ATT	2	6	6209	6214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020378	ACA	2	6	6290	6295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020378	A	7	7	6313	6319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020378	AAC	2	6	6349	6354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020378	TATT	2	8	6398	6405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020378	AATT	2	8	6432	6439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020378	ACA	2	6	6480	6485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020378	TTA	2	6	6516	6521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020378	TA	3	6	6536	6541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020378	AT	3	6	6566	6571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020378	A	7	7	6589	6595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020378	T	6	6	6620	6625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020378	A	6	6	6711	6716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020378	CA	3	6	6729	6734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020378	TTAG	2	8	6770	6777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020378	TGA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020378	ACT	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020378	GA	3	6	8209	8214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020378	TCT	2	6	8568	8573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020378	TCAT	2	8	8603	8610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020378	ATTA	2	8	8640	8647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020378	A	6	6	8647	8652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020378	A	7	7	8689	8695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020378	T	6	6	8708	8713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020378	AGA	2	6	9664	9669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.