MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT8_2

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020242	TCA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020242	T	7	7	147	153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020242	CTT	2	6	182	187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020242	A	7	7	189	195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020242	A	7	7	235	241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020242	AAT	2	6	304	309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020242	TAAT	2	8	437	444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020242	T	6	6	488	493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020242	A	7	7	543	549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020242	GCA	2	6	563	568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020242	AAG	2	6	623	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020242	TA	3	6	636	641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020242	A	6	6	658	663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020242	GC	3	6	722	727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020242	GC	3	6	746	751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020242	AT	3	6	817	822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020242	AGA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020242	AAG	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020242	TA	3	6	907	912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020242	TCA	2	6	914	919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020242	ATGGAA	2	12	966	977	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020242	AAG	2	6	985	990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020242	TTTA	2	8	1011	1018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020242	T	6	6	1025	1030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020242	T	6	6	1044	1049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020242	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020242	T	7	7	1192	1198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020242	AAT	2	6	1223	1228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020242	TAT	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020242	TA	3	6	1264	1269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020242	T	7	7	1867	1873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020242	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020242	AGG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020242	AGG	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020242	AAAG	2	8	2526	2533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020242	TAA	2	6	2941	2946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020242	AG	3	6	2998	3003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020242	GTT	2	6	3006	3011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020242	TAA	3	9	3295	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020242	GTT	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020242	T	6	6	3348	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020242	TTC	2	6	5746	5751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020242	GAA	2	6	5760	5765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020242	TAT	2	6	5802	5807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020242	AT	3	6	5806	5811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020242	ATTTA	2	10	5831	5840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020242	TGT	2	6	5857	5862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020242	ATC	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020242	GTC	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020242	AT	3	6	6125	6130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020242	TAT	2	6	6897	6902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020242	CTT	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020242	A	6	6	7114	7119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020242	TA	3	6	7422	7427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020242	ATT	2	6	7446	7451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020242	AGA	2	6	7455	7460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020242	T	7	7	7469	7475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020242	TA	3	6	7581	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020242	TTA	2	6	7592	7597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020242	T	7	7	7606	7612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020242	TGT	2	6	7665	7670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020242	AAG	2	6	7699	7704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020242	TGA	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020242	AGC	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020242	ATT	2	6	7740	7745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020242	A	8	8	7758	7765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020242	GTTAAC	2	12	7772	7783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020242	T	8	8	7809	7816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020242	CTA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020242	T	6	6	7850	7855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020242	ATC	2	6	7889	7894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020242	TGT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020242	A	7	7	7930	7936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020242	TTTTA	2	10	7953	7962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020242	T	6	6	7975	7980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020242	CAA	2	6	8019	8024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020242	A	6	6	8040	8045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020242	ACC	2	6	8048	8053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_020242	ACC	2	6	8059	8064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020242	TAA	2	6	8068	8073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020242	T	7	7	8141	8147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020242	A	7	7	8202	8208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020242	A	7	7	8230	8236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.