MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT8_1

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020241	TG	3	6	63	68	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020241	A	6	6	264	269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020241	A	6	6	285	290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020241	A	6	6	298	303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020241	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020241	T	7	7	613	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020241	TA	3	6	658	663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020241	ATA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020241	AT	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020241	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020241	A	6	6	768	773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020241	ATT	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020241	GTAA	2	8	823	830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020241	TGAA	2	8	845	852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020241	GTA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020241	ATG	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020241	T	8	8	1179	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020241	TGA	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020241	T	7	7	1396	1402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020241	TA	3	6	1472	1477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020241	AAAAT	2	10	1526	1535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020241	CAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020241	ATT	2	6	2829	2834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020241	TAT	2	6	2867	2872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020241	CTTATT	2	12	3717	3728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020241	TAT	2	6	3732	3737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020241	A	7	7	3788	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020241	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020241	GAC	2	6	3884	3889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020241	CAC	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020241	T	7	7	4109	4115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020241	T	7	7	4145	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020241	TGA	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020241	A	8	8	4415	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020241	AGT	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020241	ATG	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020241	A	7	7	5033	5039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020241	T	6	6	6274	6279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020241	T	6	6	6281	6286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020241	T	6	6	6312	6317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020241	A	8	8	6363	6370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020241	A	8	8	6383	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020241	T	7	7	6422	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020241	T	6	6	6456	6461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020241	CTTT	2	8	6462	6469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020241	AT	3	6	6716	6721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020241	A	6	6	7989	7994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020241	TAA	2	6	8019	8024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020241	ACTG	2	8	8029	8036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020241	TTATT	2	10	8056	8065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020241	GCA	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020241	T	7	7	8103	8109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020241	TTAAAT	2	12	8135	8146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020241	ATTT	2	8	8162	8169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020241	AT	3	6	8187	8192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020241	CTA	2	6	8199	8204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020241	T	7	7	8254	8260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020241	AT	4	8	8265	8272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020241	T	6	6	8292	8297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020241	GAT	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020241	T	7	7	8303	8309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020241	T	6	6	8357	8362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020241	GATTT	2	10	8369	8378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020241	TCTTT	2	10	8434	8443	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020241	TA	3	6	8473	8478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020241	A	6	6	8504	8509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.