MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 17686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	T	7	7	5	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019908	AGAT	2	8	14	21	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019908	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019908	A	6	6	1388	1393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019908	TA	3	6	1437	1442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019908	ATTGT	2	10	1449	1458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019908	ATA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019908	CCT	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019908	T	6	6	1521	1526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019908	ATT	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019908	TAT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019908	TG	3	6	1580	1585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019908	TTA	3	9	1586	1594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019908	ATA	2	6	1598	1603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019908	T	6	6	1615	1620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019908	T	6	6	1622	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019908	AT	4	8	1637	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019908	TCT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019908	TAAA	2	8	1677	1684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019908	TA	3	6	1686	1691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019908	ATT	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019908	A	6	6	1754	1759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019908	ATT	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019908	AT	3	6	1784	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019908	AAT	2	6	1809	1814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019908	T	8	8	2509	2516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019908	TAAT	2	8	2757	2764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019908	AT	3	6	4730	4735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019908	TAG	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019908	T	7	7	4793	4799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019908	ATT	2	6	4815	4820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019908	TCA	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019908	T	6	6	4872	4877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019908	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019908	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019908	ATT	2	6	5971	5976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019908	ATTT	2	8	5986	5993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019908	T	6	6	6345	6350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019908	TTA	2	6	6411	6416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019908	T	6	6	6421	6426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019908	T	7	7	7995	8001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019908	ATTT	2	8	8002	8009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019908	T	6	6	8017	8022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019908	TGA	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019908	TTAT	2	8	8042	8049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019908	GAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019908	TTA	2	6	8073	8078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019908	ATA	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019908	TA	3	6	8108	8113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019908	AGA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019908	TGT	2	6	8134	8139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019908	ATA	3	9	8145	8153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019908	TA	3	6	8159	8164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019908	A	6	6	8164	8169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019908	AT	3	6	8213	8218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019908	A	6	6	8230	8235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019908	TAT	2	6	8238	8243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019908	T	7	7	8245	8251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019908	GAT	2	6	8255	8260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019908	TAT	2	6	8297	8302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019908	A	7	7	8329	8335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019908	GAA	2	6	8336	8341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019908	TAA	2	6	8362	8367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019908	ATA	2	6	8394	8399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019908	ATA	2	6	8412	8417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019908	T	6	6	8819	8824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019908	ATTTT	2	10	8856	8865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019908	GTA	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019908	TA	3	6	8881	8886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019908	A	6	6	8895	8900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019908	CTT	2	6	8912	8917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019908	CGC	2	6	8925	8930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019908	CTTC	2	8	8936	8943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019908	AAG	2	6	8952	8957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019908	ATTT	2	8	9000	9007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019908	T	6	6	9005	9010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019908	A	7	7	9020	9026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019908	TA	3	6	9032	9037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019908	A	6	6	9037	9042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019908	A	6	6	9050	9055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019908	TATT	2	8	9071	9078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019908	T	6	6	9077	9082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019908	ATTA	2	8	9083	9090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019908	T	6	6	9094	9099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019908	GAT	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019908	ATC	2	6	9163	9168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019908	TAA	3	9	9238	9246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019908	TCT	2	6	9261	9266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019908	AAC	2	6	9335	9340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019908	TAT	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019908	AGA	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019908	CAA	2	6	9540	9545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019908	TAC	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019908	TTA	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019908	TA	3	6	9698	9703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019908	T	6	6	9721	9726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019908	GAT	2	6	9727	9732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019908	CAG	2	6	9735	9740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019908	CAG	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019908	TTTC	2	8	9835	9842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019908	CTT	2	6	9870	9875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019908	TAAA	2	8	9882	9889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019908	AGC	2	6	9928	9933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019908	ATA	2	6	10033	10038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019908	ACT	2	6	10061	10066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019908	AGC	2	6	10288	10293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019908	AAAGC	2	10	10299	10308	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019908	TTTCT	2	10	10321	10330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019908	AGC	2	6	10357	10362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019908	GTA	2	6	10435	10440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019908	ATC	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019908	GCC	2	6	10509	10514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019908	GTG	2	6	10548	10553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019908	AACCAG	2	12	10610	10621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019908	AGG	2	6	10659	10664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019908	CTA	2	6	10688	10693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019908	A	6	6	10696	10701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019908	CCG	2	6	10735	10740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_019908	ATA	2	6	10748	10753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019908	TATAG	2	10	10767	10776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019908	AGC	2	6	10791	10796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019908	TAT	2	6	10812	10817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019908	CCG	2	6	10819	10824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019908	AC	3	6	10826	10831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019908	ATA	2	6	10844	10849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019908	CAA	2	6	10853	10858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019908	TAG	3	9	10862	10870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019908	AAT	2	6	10879	10884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019908	CTC	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019908	ATC	2	6	10909	10914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019908	GCAT	2	8	10927	10934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019908	A	6	6	10938	10943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019908	AGC	2	6	10962	10967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019908	TCTT	2	8	10978	10985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019908	ATA	2	6	11017	11022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019908	ATA	2	6	11038	11043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019908	ATA	2	6	11066	11071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019908	TAG	2	6	11129	11134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019908	ATGA	2	8	11200	11207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019908	T	7	7	11265	11271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019908	AT	4	8	11273	11280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019908	T	7	7	11294	11300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019908	TAT	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019908	A	6	6	11342	11347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019908	TCT	2	6	11368	11373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019908	TAA	2	6	11382	11387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019908	AAAT	2	8	11395	11402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019908	T	6	6	11409	11414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019908	TAT	2	6	11424	11429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019908	AAT	2	6	11444	11449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019908	TAA	2	6	11455	11460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019908	T	6	6	12166	12171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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