MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 11809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019842	T	6	6	331901	331906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_019842	TTA	2	6	331957	331962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_019842	CAA	2	6	332039	332044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_019842	AAG	2	6	332070	332075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019842	CTC	2	6	333288	333293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_019842	T	6	6	333294	333299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019842	GTA	2	6	333419	333424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019842	TGA	2	6	333430	333435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019842	TG	3	6	333440	333445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019842	GAT	2	6	333468	333473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019842	AGGA	2	8	333492	333499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019842	T	7	7	333895	333901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_019842	CTGT	2	8	333936	333943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_019842	T	8	8	333958	333965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_019842	TACG	2	8	333977	333984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_019842	T	7	7	333989	333995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_019842	CGG	2	6	334328	334333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_019842	CA	3	6	334455	334460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_019842	G	6	6	356017	356022	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_019842	AGG	2	6	359873	359878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_019842	A	6	6	362054	362059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_019842	CCT	2	6	362072	362077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_019842	CAG	2	6	362503	362508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_019842	A	6	6	362516	362521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_019842	TGA	2	6	362543	362548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_019842	AGC	2	6	362583	362588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_019842	GATA	2	8	362595	362602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_019842	GT	3	6	362613	362618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019842	GCCG	2	8	363613	363620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_019842	GGGAA	2	10	363637	363646	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_019842	AAT	2	6	363663	363668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_019842	TCC	2	6	365689	365694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_019842	A	7	7	365751	365757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_019842	CTT	2	6	366418	366423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_019842	A	8	8	366463	366470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_019842	GAA	2	6	366471	366476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019842	CTT	2	6	366494	366499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_019842	AGT	2	6	368777	368782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019842	A	6	6	368792	368797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_019842	T	8	8	368822	368829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019842	TTC	2	6	368866	368871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_019842	CTTT	2	8	369767	369774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_019842	AT	3	6	369824	369829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019842	ATG	2	6	369837	369842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_019842	AGG	2	6	369869	369874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_019842	A	6	6	372598	372603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_019842	A	6	6	374136	374141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_019842	TA	3	6	374165	374170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_019842	A	6	6	374203	374208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_019842	TAT	2	6	374280	374285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_019842	T	6	6	374309	374314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_019842	AG	3	6	374372	374377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_019842	AGG	2	6	374380	374385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_019842	AGG	2	6	376190	376195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019842	T	6	6	376205	376210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_019842	CCG	2	6	376511	376516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_019842	GAA	2	6	376539	376544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_019842	A	7	7	376549	376555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_019842	T	6	6	376566	376571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019842	GAG	2	6	379434	379439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019842	CCGG	2	8	380575	380582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_019842	T	6	6	380592	380597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019842	A	7	7	380598	380604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019842	GTG	2	6	380695	380700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_019842	AGG	2	6	382068	382073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_019842	CGG	2	6	383397	383402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_019842	GAA	4	12	384858	384869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_019842	G	6	6	387376	387381	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_019842	TGC	2	6	388153	388158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_019842	CTC	2	6	388159	388164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_019842	TCC	2	6	389608	389613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_019842	CTT	2	6	389643	389648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_019842	TA	3	6	389670	389675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_019842	A	7	7	389692	389698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_019842	GAT	2	6	389718	389723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_019842	TAT	2	6	389776	389781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_019842	GGA	2	6	389804	389809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019842	GAA	2	6	393322	393327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_019842	T	7	7	393376	393382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_019842	GCG	2	6	393402	393407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_019842	CGC	2	6	393423	393428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_019842	GCC	2	6	393476	393481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_019842	ATAA	2	8	393513	393520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_019842	AAC	2	6	393521	393526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_019842	GCT	2	6	393611	393616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_019842	A	6	6	393643	393648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_019842	TAT	2	6	395070	395075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_019842	CT	3	6	395076	395081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_019842	T	6	6	395103	395108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019842	GGA	2	6	395138	395143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_019842	TCA	2	6	395184	395189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_019842	A	6	6	395195	395200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_019842	AGC	2	6	395206	395211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_019842	GAT	2	6	395330	395335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_019842	TGATAA	2	12	395353	395364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_019842	AT	3	6	395379	395384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_019842	GTT	2	6	395389	395394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_019842	CTT	2	6	400521	400526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_019842	CTT	2	6	401418	401423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_019842	ATG	2	6	401470	401475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_019842	TTTG	2	8	401513	401520	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_019842	A	6	6	401529	401534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_019842	TCAT	2	8	402313	402320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_019842	TCC	2	6	402622	402627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_019842	AACT	2	8	402664	402671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_019842	GAT	2	6	402733	402738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_019842	TCA	2	6	404559	404564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_019842	AAG	2	6	404572	404577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_019842	ATT	2	6	405929	405934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_019842	CGG	2	6	405942	405947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_019842	TAG	2	6	406006	406011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019842	AGG	2	6	408443	408448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_019842	A	7	7	409243	409249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_019842	GAT	2	6	411541	411546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_019842	GGTT	2	8	411560	411567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_019842	TCC	2	6	412152	412157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_019842	TGA	2	6	412174	412179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_019842	CCTC	2	8	412181	412188	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1619	NC_019842	CA	3	6	412213	412218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_019842	TGA	2	6	412225	412230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019842	A	6	6	412242	412247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_019842	AGA	2	6	412296	412301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019842	GGA	2	6	412309	412314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_019842	TGA	2	6	412671	412676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_019842	T	9	9	412683	412691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_019842	CTC	2	6	412723	412728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_019842	ATG	2	6	412764	412769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_019842	GA	5	10	412781	412790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019842	TTAT	2	8	412802	412809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019842	GCAA	2	8	412822	412829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_019842	AGGG	2	8	412832	412839	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019842	T	6	6	415887	415892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_019842	GA	4	8	415906	415913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_019842	GCC	2	6	416329	416334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_019842	GCG	2	6	416339	416344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_019842	T	6	6	416586	416591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_019842	A	6	6	417407	417412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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