MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 11809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019842	CTT	2	6	1870003	1870008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_019842	TGGG	2	8	1870041	1870048	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_019842	AC	3	6	1871177	1871182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_019842	T	6	6	1871208	1871213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_019842	GGA	2	6	1871254	1871259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019842	AT	3	6	1871303	1871308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019842	AGG	2	6	1871331	1871336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_019842	T	7	7	1871338	1871344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019842	CAT	2	6	1871428	1871433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_019842	TGC	2	6	1871529	1871534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_019842	AAG	2	6	1871872	1871877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_019842	GCG	2	6	1871895	1871900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_019842	AGG	2	6	1871946	1871951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_019842	ATAAAA	2	12	1871960	1871971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_019842	CTG	2	6	1872055	1872060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_019842	ATA	2	6	1872144	1872149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019842	TTGA	2	8	1872159	1872166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019842	ACAA	2	8	1872221	1872228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_019842	GAA	2	6	1872252	1872257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_019842	AAG	2	6	1872282	1872287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_019842	CT	3	6	1872290	1872295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_019842	TAAA	2	8	1872299	1872306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_019842	AATG	2	8	1872320	1872327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_019842	T	6	6	1872791	1872796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_019842	A	6	6	1872803	1872808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_019842	TGA	2	6	1872833	1872838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019842	A	7	7	1872845	1872851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_019842	AT	3	6	1872874	1872879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019842	A	7	7	1872899	1872905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019842	AT	3	6	1872912	1872917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_019842	AAAG	2	8	1873372	1873379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_019842	ATGA	2	8	1874244	1874251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_019842	GAT	2	6	1874269	1874274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_019842	CAT	2	6	1874281	1874286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_019842	TTC	2	6	1874312	1874317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_019842	GAA	2	6	1874339	1874344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_019842	AAT	2	6	1874945	1874950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_019842	A	6	6	1874964	1874969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_019842	T	7	7	1874986	1874992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_019842	A	6	6	1875050	1875055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_019842	GA	3	6	1875140	1875145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_019842	ATG	2	6	1875210	1875215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019842	ATT	2	6	1875285	1875290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019842	TGG	2	6	1875307	1875312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_019842	AACTGA	2	12	1875322	1875333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6047	NC_019842	TCT	2	6	1875926	1875931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_019842	T	7	7	1875937	1875943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_019842	TAT	2	6	1875968	1875973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_019842	A	6	6	1876040	1876045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_019842	TTA	2	6	1876071	1876076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_019842	ATA	2	6	1876088	1876093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_019842	GCA	2	6	1876094	1876099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_019842	AT	3	6	1876141	1876146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_019842	TAA	2	6	1876242	1876247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_019842	TGAA	2	8	1876250	1876257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_019842	ATT	2	6	1876284	1876289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_019842	ATC	2	6	1876325	1876330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_019842	GA	3	6	1876346	1876351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_019842	GGC	2	6	1876360	1876365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_019842	AT	3	6	1876398	1876403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_019842	AGC	2	6	1876443	1876448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_019842	ATA	2	6	1876823	1876828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_019842	AT	3	6	1876837	1876842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_019842	AAAG	2	8	1876901	1876908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_019842	AAT	2	6	1876985	1876990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_019842	CTT	2	6	1877030	1877035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_019842	T	8	8	1877792	1877799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_019842	TATT	2	8	1877834	1877841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_019842	GAATA	2	10	1877871	1877880	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_019842	T	7	7	1877891	1877897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_019842	AAGG	2	8	1879121	1879128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_019842	TTA	2	6	1879171	1879176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6079	NC_019842	TG	3	6	1879880	1879885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_019842	CAG	2	6	1879903	1879908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_019842	CATTT	2	10	1879920	1879929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6085	NC_019842	T	7	7	1880172	1880178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_019842	AGG	2	6	1880222	1880227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_019842	T	6	6	1880305	1880310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_019842	A	6	6	1880311	1880316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_019842	GAA	2	6	1880371	1880376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6092	NC_019842	A	6	6	1880436	1880441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_019842	AAT	2	6	1880453	1880458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_019842	TCG	2	6	1880782	1880787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6096	NC_019842	GAT	2	6	1880934	1880939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_019842	A	8	8	1881081	1881088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_019842	CCT	2	6	1881665	1881670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_019842	TTG	2	6	1881688	1881693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_019842	GTCAT	2	10	1881749	1881758	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6101	NC_019842	GAA	2	6	1881810	1881815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_019842	AAT	2	6	1881816	1881821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_019842	ATA	2	6	1881887	1881892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_019842	AGC	2	6	1881944	1881949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_019842	T	6	6	1881951	1881956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_019842	T	6	6	1881960	1881965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_019842	AAC	2	6	1881981	1881986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_019842	TAATCA	2	12	1881991	1882002	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6109	NC_019842	TCT	2	6	1882022	1882027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_019842	T	7	7	1882027	1882033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_019842	GCT	2	6	1882040	1882045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_019842	GTG	2	6	1882050	1882055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_019842	CATATC	2	12	1882071	1882082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_019842	TCCATA	4	24	1882087	1882110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_019842	TCC	2	6	1882118	1882123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_019842	T	6	6	1882124	1882129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_019842	GTA	2	6	1882139	1882144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_019842	ATGG	2	8	1882161	1882168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_019842	A	6	6	1882218	1882223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_019842	CCCG	2	8	1882234	1882241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6121	NC_019842	AG	3	6	1882249	1882254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_019842	GAT	2	6	1882257	1882262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_019842	CTTT	2	8	1884709	1884716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_019842	CG	3	6	1884753	1884758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_019842	TTC	2	6	1884774	1884779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6127	NC_019842	TAT	2	6	1884866	1884871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_019842	GGA	2	6	1884898	1884903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_019842	AGG	2	6	1884913	1884918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_019842	TA	3	6	1884973	1884978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_019842	TCA	2	6	1885031	1885036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6406	NC_019842	A	8	8	2038316	2038323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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