MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 11809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019842	ATG	3	9	1383145	1383153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_019842	GAA	2	6	1383154	1383159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019842	GA	3	6	1383161	1383166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019842	GA	3	6	1383171	1383176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_019842	AAGG	2	8	1384542	1384549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019842	GGA	2	6	1385088	1385093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_019842	TCC	2	6	1385096	1385101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_019842	T	6	6	1385108	1385113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_019842	GAA	2	6	1385131	1385136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019842	ATT	2	6	1385149	1385154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_019842	CCG	2	6	1385192	1385197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_019842	TAA	2	6	1385206	1385211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019842	TGC	2	6	1385240	1385245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_019842	GGC	2	6	1385252	1385257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_019842	GAT	2	6	1385284	1385289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019842	AG	3	6	1385304	1385309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019842	T	6	6	1387262	1387267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019842	GTTC	2	8	1387272	1387279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_019842	GAAT	2	8	1387306	1387313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_019842	AGG	2	6	1387331	1387336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019842	A	6	6	1388456	1388461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019842	T	6	6	1388486	1388491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019842	TTC	2	6	1388631	1388636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_019842	CTGTTT	2	12	1388655	1388666	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5025	NC_019842	A	6	6	1388703	1388708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019842	CGTT	2	8	1389710	1389717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_019842	A	6	6	1390665	1390670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019842	GAA	2	6	1390674	1390679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_019842	T	6	6	1390717	1390722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019842	AGG	2	6	1390820	1390825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019842	ATA	2	6	1392981	1392986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_019842	GTA	2	6	1392991	1392996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019842	TTTAA	2	10	1393004	1393013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_019842	T	8	8	1395041	1395048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_019842	A	6	6	1395058	1395063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_019842	G	6	6	1395064	1395069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_019842	AGG	2	6	1395086	1395091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_019842	CT	3	6	1395368	1395373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_019842	AAC	2	6	1395388	1395393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_019842	GTCT	2	8	1395415	1395422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_019842	ACG	2	6	1396467	1396472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_019842	T	7	7	1396477	1396483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_019842	ATTT	2	8	1396512	1396519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019842	AGG	2	6	1396564	1396569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_019842	AAT	2	6	1398590	1398595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_019842	GGA	2	6	1398614	1398619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_019842	CCG	2	6	1399504	1399509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_019842	T	6	6	1399518	1399523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_019842	T	7	7	1400326	1400332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_019842	T	6	6	1400357	1400362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019842	GCAG	2	8	1400371	1400378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_019842	ACA	2	6	1400391	1400396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_019842	TAATTG	2	12	1400408	1400419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_019842	TAT	2	6	1400459	1400464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_019842	T	6	6	1400464	1400469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019842	ATT	2	6	1400492	1400497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019842	AT	3	6	1400509	1400514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_019842	T	8	8	1400539	1400546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_019842	AAC	2	6	1400562	1400567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_019842	AT	3	6	1400606	1400611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_019842	GGC	2	6	1402782	1402787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_019842	CTTT	2	8	1402805	1402812	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_019842	T	6	6	1402861	1402866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019842	AATC	2	8	1402871	1402878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_019842	AGG	2	6	1402937	1402942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019842	TCA	2	6	1405967	1405972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_019842	TA	3	6	1405981	1405986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_019842	CTT	2	6	1406076	1406081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_019842	A	7	7	1406086	1406092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019842	ATCT	2	8	1406133	1406140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_019842	TTA	2	6	1406326	1406331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019842	CTT	2	6	1406336	1406341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_019842	A	6	6	1406399	1406404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_019842	T	7	7	1406408	1406414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_019842	AT	3	6	1406471	1406476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_019842	ATG	2	6	1407439	1407444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_019842	T	7	7	1407452	1407458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_019842	GCG	2	6	1407459	1407464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_019842	TC	3	6	1407937	1407942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_019842	AT	3	6	1407962	1407967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_019842	T	6	6	1407977	1407982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_019842	TGA	2	6	1408026	1408031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_019842	AT	3	6	1409381	1409386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019842	ATC	2	6	1409388	1409393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_019842	CCT	2	6	1409927	1409932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_019842	AACC	2	8	1410862	1410869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_019842	GTT	2	6	1410879	1410884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_019842	TAT	2	6	1410886	1410891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_019842	ATC	2	6	1410892	1410897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_019842	ATTC	2	8	1410970	1410977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_019842	GGGT	2	8	1410987	1410994	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_019842	AT	3	6	1411771	1411776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_019842	ATT	2	6	1411779	1411784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_019842	GAA	2	6	1411880	1411885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_019842	TAT	2	6	1411952	1411957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_019842	TAT	2	6	1411977	1411982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019842	TGA	2	6	1412003	1412008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_019842	TTA	2	6	1412017	1412022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019842	TTTTA	2	10	1412415	1412424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_019842	GCT	2	6	1412426	1412431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_019842	CCT	2	6	1412441	1412446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_019842	GCT	2	6	1413748	1413753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_019842	T	7	7	1413763	1413769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5108	NC_019842	A	6	6	1413790	1413795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_019842	ATCATT	2	12	1413817	1413828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5110	NC_019842	AG	3	6	1413836	1413841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_019842	CT	3	6	1413848	1413853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_019842	A	6	6	1413886	1413891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_019842	T	7	7	1413913	1413919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_019842	TACA	2	8	1413950	1413957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_019842	GGC	2	6	1413966	1413971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_019842	ATT	2	6	1413986	1413991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_019842	A	6	6	1414015	1414020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019842	ATG	2	6	1414109	1414114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_019842	TAT	2	6	1414129	1414134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_019842	AATA	2	8	1414135	1414142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_019842	TTG	2	6	1414144	1414149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_019842	GTT	2	6	1414157	1414162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019842	T	6	6	1414161	1414166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019842	T	7	7	1414177	1414183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_019842	TTA	2	6	1414480	1414485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_019842	T	6	6	1415440	1415445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_019842	A	6	6	1415466	1415471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_019842	TAT	2	6	1415484	1415489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_019842	TGA	2	6	1415513	1415518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_019842	CATA	2	8	1416036	1416043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_019842	TTTAT	2	10	1416068	1416077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_019842	T	8	8	1417029	1417036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_019842	T	6	6	1417038	1417043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_019842	T	7	7	1507798	1507804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_019842	TA	3	6	1513456	1513461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_019842	A	6	6	1513520	1513525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_019842	T	6	6	1513553	1513558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_019842	TAA	2	6	1514455	1514460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_019842	CAA	3	9	1556712	1556720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5393	NC_019842	CAATT	2	10	1556725	1556734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5394	NC_019842	GCA	2	6	1557703	1557708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5399	NC_019842	T	6	6	1560279	1560284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_019842	GCC	2	6	1560289	1560294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5402	NC_019842	TTTA	2	8	1562367	1562374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5434	NC_019842	TGGA	2	8	1573813	1573820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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