MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 13323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_019382	CCT	2	6	5212882	5212887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_019382	CCCG	2	8	5212949	5212956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12503	NC_019382	TGA	2	6	5212983	5212988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_019382	CG	3	6	5212994	5212999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12505	NC_019382	GTC	2	6	5213020	5213025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_019382	CCGCG	2	10	5213116	5213125	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12507	NC_019382	GGA	2	6	5213148	5213153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_019382	CCA	2	6	5213181	5213186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12509	NC_019382	GCGAT	2	10	5213270	5213279	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12510	NC_019382	GC	3	6	5213286	5213291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_019382	TTG	2	6	5213330	5213335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_019382	CGG	2	6	5213336	5213341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_019382	CG	3	6	5213525	5213530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_019382	GCG	2	6	5213557	5213562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_019382	CG	5	10	5213624	5213633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_019382	TCT	2	6	5213669	5213674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_019382	AGGG	2	8	5213716	5213723	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_019382	CGC	2	6	5213728	5213733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12519	NC_019382	GGCC	2	8	5213736	5213743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_019382	TCG	2	6	5213772	5213777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_019382	GCG	2	6	5213785	5213790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_019382	ACC	2	6	5213799	5213804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12523	NC_019382	TGG	2	6	5213848	5213853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_019382	ACC	3	9	5213877	5213885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_019382	TCC	2	6	5213931	5213936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_019382	GGTCG	2	10	5213939	5213948	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12527	NC_019382	GCC	2	6	5213954	5213959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_019382	GTG	2	6	5213966	5213971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_019382	CGA	2	6	5213989	5213994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_019382	GTC	2	6	5214059	5214064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_019382	CGGC	2	8	5214110	5214117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12532	NC_019382	GTC	2	6	5214206	5214211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_019382	TTG	2	6	5214248	5214253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_019382	GTG	2	6	5214284	5214289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_019382	GGGC	2	8	5214304	5214311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12536	NC_019382	TCC	2	6	5214325	5214330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_019382	TGG	2	6	5214333	5214338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_019382	GCC	2	6	5214343	5214348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_019382	CTG	2	6	5216788	5216793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_019382	GC	3	6	5217118	5217123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12541	NC_019382	AGCA	2	8	5217140	5217147	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12542	NC_019382	GAT	2	6	5217187	5217192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_019382	TCG	2	6	5217255	5217260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_019382	CG	3	6	5217331	5217336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12545	NC_019382	CG	3	6	5217346	5217351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12546	NC_019382	CG	3	6	5217391	5217396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12547	NC_019382	CG	3	6	5217481	5217486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_019382	CG	3	6	5217586	5217591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12549	NC_019382	CG	3	6	5217601	5217606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12550	NC_019382	CG	3	6	5217646	5217651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12551	NC_019382	CG	3	6	5217691	5217696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12552	NC_019382	CG	3	6	5217706	5217711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12553	NC_019382	CG	3	6	5217826	5217831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12554	NC_019382	CG	3	6	5217931	5217936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_019382	CG	3	6	5217946	5217951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12556	NC_019382	CG	3	6	5217991	5217996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12557	NC_019382	GC	4	8	5218096	5218103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12558	NC_019382	CG	3	6	5218104	5218109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_019382	GGC	2	6	5218189	5218194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_019382	GCTG	2	8	5218240	5218247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12561	NC_019382	GGCG	2	8	5218260	5218267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12562	NC_019382	GCCG	2	8	5218309	5218316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12563	NC_019382	GAT	2	6	5218317	5218322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_019382	CTT	2	6	5218353	5218358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_019382	GCA	2	6	5218404	5218409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_019382	GCG	2	6	5221474	5221479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_019382	CCA	2	6	5221483	5221488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12568	NC_019382	GGA	2	6	5221491	5221496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_019382	GCC	2	6	5221507	5221512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12570	NC_019382	CAC	2	6	5221532	5221537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12572	NC_019382	AAGA	2	8	5221604	5221611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_019382	CCG	2	6	5221702	5221707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12574	NC_019382	GAC	2	6	5221757	5221762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12576	NC_019382	CAC	2	6	5221850	5221855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12579	NC_019382	GGA	2	6	5221885	5221890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_019382	GGT	3	9	5221936	5221944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12582	NC_019382	TGG	2	6	5222016	5222021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12584	NC_019382	CCGACG	2	12	5222037	5222048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12585	NC_019382	GGCC	2	8	5222078	5222085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12586	NC_019382	CGG	3	9	5222086	5222094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_019382	CTCC	2	8	5222096	5222103	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12588	NC_019382	AGA	2	6	5222147	5222152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_019382	CG	5	10	5222188	5222197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12590	NC_019382	GCC	3	9	5222257	5222265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_019382	CG	3	6	5222291	5222296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12592	NC_019382	CGC	2	6	5222481	5222486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12593	NC_019382	GC	3	6	5222530	5222535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12594	NC_019382	ATCGC	2	10	5222542	5222551	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12595	NC_019382	TGG	2	6	5222635	5222640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12597	NC_019382	CGGCG	2	10	5222693	5222702	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12598	NC_019382	TGCGC	2	10	5222744	5222753	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12599	NC_019382	CGA	2	6	5222795	5222800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_019382	CG	3	6	5222822	5222827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12601	NC_019382	TCA	2	6	5222833	5222838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_019382	CGGG	2	8	5222865	5222872	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12603	NC_019382	AGG	2	6	5222934	5222939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_019382	CCG	2	6	5222955	5222960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12605	NC_019382	GCG	2	6	5223034	5223039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_019382	CG	3	6	5223038	5223043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12607	NC_019382	CGG	2	6	5223054	5223059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_019382	GC	3	6	5223087	5223092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_019382	CCCA	2	8	5223224	5223231	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12610	NC_019382	CGC	2	6	5223247	5223252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12611	NC_019382	AGC	2	6	5223372	5223377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_019382	CTG	2	6	5223479	5223484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_019382	CCG	2	6	5223485	5223490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12614	NC_019382	GAACAG	2	12	5223593	5223604	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12615	NC_019382	CTT	2	6	5223619	5223624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_019382	CGGC	2	8	5223666	5223673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12617	NC_019382	GCC	2	6	5223692	5223697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_019382	GAAG	2	8	5223799	5223806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_019382	GCG	2	6	5223929	5223934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_019382	CGA	2	6	5223946	5223951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_019382	GC	3	6	5223953	5223958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12622	NC_019382	GCG	2	6	5223962	5223967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_019382	GC	3	6	5224077	5224082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12624	NC_019382	TCC	2	6	5224098	5224103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12625	NC_019382	CGC	2	6	5224110	5224115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12626	NC_019382	CG	3	6	5224205	5224210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12627	NC_019382	GAC	2	6	5224213	5224218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12628	NC_019382	GC	3	6	5224263	5224268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12630	NC_019382	CAAGG	2	10	5224339	5224348	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12631	NC_019382	CGA	3	9	5224350	5224358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12632	NC_019382	GTG	2	6	5224360	5224365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12633	NC_019382	CACCG	2	10	5224375	5224384	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12634	NC_019382	CGC	2	6	5224411	5224416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12755	NC_019382	GCC	2	6	5231157	5231162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12756	NC_019382	CG	3	6	5231166	5231171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12757	NC_019382	TGC	2	6	5231181	5231186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12882	NC_019382	TGCCA	2	10	5238761	5238770	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12883	NC_019382	ACC	3	9	5238858	5238866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12884	NC_019382	TGC	2	6	5238923	5238928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13000	NC_019382	GCG	2	6	5244794	5244799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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