MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_5p

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018884	CT	3	6	34	39	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018884	AGT	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018884	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018884	ACTA	2	8	1471	1478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018884	TG	3	6	1515	1520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018884	T	6	6	1533	1538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018884	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018884	T	7	7	1654	1660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018884	AT	3	6	1678	1683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018884	TA	3	6	1708	1713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018884	TAA	2	6	1728	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018884	TGT	2	6	1763	1768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018884	TAAT	2	8	1808	1815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018884	TAA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018884	TGT	2	6	1893	1898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018884	T	7	7	1929	1935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018884	TGT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018884	AAT	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018884	AAAG	2	8	2088	2095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018884	GAT	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018884	ATC	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018884	A	6	6	2210	2215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018884	A	7	7	2324	2330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018884	T	7	7	2388	2394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018884	ATGA	2	8	2404	2411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018884	ACA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018884	A	7	7	2472	2478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018884	T	7	7	2530	2536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018884	AATT	2	8	2547	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018884	AATT	2	8	2571	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018884	ATA	2	6	2590	2595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018884	GAG	2	6	2637	2642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018884	T	7	7	3270	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018884	ATA	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018884	TAG	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018884	ACTCTC	2	12	3388	3399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018884	TA	3	6	3400	3405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018884	T	6	6	3500	3505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018884	TTC	2	6	3599	3604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018884	ATT	2	6	3706	3711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018884	TAA	2	6	3716	3721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018884	T	6	6	3733	3738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018884	TTTGAA	2	12	3756	3767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018884	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018884	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018884	AGG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018884	A	10	10	4666	4675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018884	A	6	6	5041	5046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018884	T	6	6	5115	5120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018884	AATT	2	8	5121	5128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018884	AATG	2	8	5156	5163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018884	GAA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.