MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_7p

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018882	AAGG	2	8	26	33	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018882	T	6	6	64	69	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018882	AT	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018882	A	6	6	1153	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018882	GAA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018882	TGA	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018882	AG	3	6	1322	1327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018882	TC	3	6	1353	1358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018882	T	6	6	1359	1364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018882	GAAA	2	8	1370	1377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018882	GCA	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018882	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018882	T	6	6	1446	1451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018882	TTAAAT	2	12	1453	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018882	ATTT	2	8	1479	1486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018882	AT	3	6	1504	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018882	TGA	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018882	TAC	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018882	T	7	7	1571	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018882	AT	3	6	1580	1585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018882	T	6	6	1609	1614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018882	T	6	6	1619	1624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018882	TTTA	2	8	1678	1685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018882	TA	3	6	1778	1783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018882	A	6	6	1809	1814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018882	TG	3	6	1881	1886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018882	A	7	7	1889	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018882	TGT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018882	T	6	6	1934	1939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018882	AT	3	6	2042	2047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018882	AT	3	6	2050	2055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018882	ATG	2	6	2078	2083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018882	A	6	6	2084	2089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018882	A	6	6	2105	2110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018882	TGA	2	6	2114	2119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018882	T	6	6	2131	2136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018882	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018882	AAT	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018882	TTTAA	2	10	2821	2830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018882	TAAA	3	12	2849	2860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018882	ATAA	2	8	2861	2868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018882	TA	3	6	2878	2883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018882	TTTAA	2	10	2891	2900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018882	ATA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018882	T	6	6	2929	2934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018882	A	6	6	2991	2996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018882	A	6	6	3030	3035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018882	ATG	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018882	TCTT	2	8	3447	3454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018882	TGTT	2	8	3459	3466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018882	TG	3	6	3567	3572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018882	TGG	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018882	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018882	A	6	6	3619	3624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018882	T	7	7	3646	3652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018882	ATAC	2	8	3685	3692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018882	CAC	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018882	T	6	6	3827	3832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018882	GAAT	2	8	3849	3856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018882	A	7	7	3981	3987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018882	AGT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018882	AT	3	6	4072	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018882	GAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018882	CGGA	2	8	4132	4139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018882	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018882	TTC	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018882	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018882	GAA	2	6	4444	4449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018882	AGG	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018882	TG	3	6	5999	6004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018882	T	6	6	6011	6016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018882	ATA	2	6	6052	6057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018882	GTTT	2	8	6099	6106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018882	A	6	6	6110	6115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018882	TCC	2	6	6560	6565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018882	TCC	2	6	6873	6878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018882	T	6	6	6897	6902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018882	TA	3	6	6949	6954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018882	TGTT	2	8	6966	6973	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018882	TTGT	2	8	6974	6981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018882	T	6	6	6992	6997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018882	TCT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018882	TGTT	2	8	7020	7027	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018882	TAT	3	9	7044	7052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018882	TTAG	2	8	7058	7065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018882	CTTG	2	8	7175	7182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018882	AAAG	2	8	7201	7208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.