MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_15p

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018880	TAT	2	6	19	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018880	AAT	2	6	84	89	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018880	GAAATG	2	12	1187	1198	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018880	TA	3	6	1239	1244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018880	TCC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018880	GAGT	2	8	1291	1298	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018880	A	6	6	1403	1408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018880	TTA	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018880	ATA	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018880	GTTCC	2	10	1700	1709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018880	TAA	2	6	1860	1865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018880	TGA	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018880	GCG	2	6	1955	1960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018880	TTA	2	6	1998	2003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018880	TA	3	6	2019	2024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018880	TA	3	6	2097	2102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018880	TAG	2	6	2112	2117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018880	GTC	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018880	A	6	6	2335	2340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018880	GAA	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018880	TAAT	2	8	2662	2669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018880	ATT	2	6	2693	2698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018880	TACT	2	8	2717	2724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018880	T	6	6	2765	2770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018880	AAT	2	6	2776	2781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018880	A	6	6	2855	2860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018880	GCG	2	6	2895	2900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018880	CGG	2	6	2948	2953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018880	ATT	2	6	3001	3006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018880	GTA	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018880	TTTAT	2	10	3495	3504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018880	CG	3	6	3527	3532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018880	AAT	2	6	3563	3568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018880	CCT	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018880	TAA	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018880	A	7	7	3736	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018880	ATA	2	6	3749	3754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018880	TA	3	6	3770	3775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018880	CTC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018880	AGG	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018880	CCT	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018880	CAT	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018880	ATT	2	6	5435	5440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018880	TAC	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018880	A	7	7	5627	5633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018880	A	6	6	5656	5661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018880	AT	3	6	5669	5674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018880	ATT	2	6	5676	5681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018880	T	7	7	5701	5707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018880	A	6	6	5712	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018880	ACA	2	6	5722	5727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018880	TGT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018880	TAA	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018880	ATAA	2	8	5800	5807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018880	GGA	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018880	A	6	6	9709	9714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018880	T	7	7	9727	9733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018880	AAAAT	2	10	9776	9785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018880	A	6	6	9807	9812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018880	AC	4	8	9842	9849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018880	A	6	6	11319	11324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018880	AGAA	2	8	11350	11357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018880	T	7	7	11363	11369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018880	TAAAG	2	10	11438	11447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018880	GTTAT	2	10	11470	11479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018880	GTT	2	6	11491	11496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018880	ACA	2	6	11509	11514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018880	AAG	2	6	11523	11528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018880	TAA	2	6	12252	12257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018880	AGG	2	6	12260	12265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018880	AGA	2	6	13734	13739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018880	CA	3	6	13746	13751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018880	C	7	7	13762	13768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_018880	TA	3	6	13774	13779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018880	TA	3	6	13782	13787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018880	TAT	2	6	13855	13860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018880	TAA	2	6	13884	13889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018880	TAT	2	6	13891	13896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018880	TAG	2	6	13908	13913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018880	ATT	2	6	14008	14013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018880	A	6	6	14027	14032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018880	TCGT	2	8	14074	14081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018880	AT	3	6	14093	14098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018880	CTTTT	2	10	14153	14162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018880	A	6	6	14232	14237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018880	ACA	2	6	14251	14256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018880	A	6	6	14259	14264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018880	TA	3	6	14300	14305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018880	GA	3	6	14321	14326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018880	AGG	2	6	14610	14615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018880	ACT	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018880	GA	3	6	14950	14955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018880	CAA	2	6	15028	15033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018880	T	7	7	15054	15060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018880	TAG	2	6	15064	15069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.