MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p

Total Repeats: 2595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018878	TA	3	6	30	35	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018878	TTA	2	6	39	44	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018878	TAT	2	6	72	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018878	T	6	6	94	99	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018878	AAG	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018878	CTT	2	6	1893	1898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018878	T	6	6	1897	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018878	ATTTC	2	10	2211	2220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018878	CTTTC	2	10	2223	2232	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018878	TAT	2	6	2246	2251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018878	TAT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018878	TGT	2	6	2281	2286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018878	GTG	2	6	2340	2345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018878	AAGA	2	8	2346	2353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018878	AGTA	2	8	2355	2362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018878	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018878	AGG	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018878	CTT	2	6	4330	4335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018878	T	6	6	4334	4339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018878	ATA	3	9	4371	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018878	TA	3	6	4378	4383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018878	A	6	6	4391	4396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018878	TAAA	2	8	4415	4422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018878	TAAT	2	8	4436	4443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018878	AATG	2	8	4452	4459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018878	GAAAAC	2	12	4488	4499	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018878	TAAT	2	8	4519	4526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018878	ATA	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018878	TAA	2	6	4554	4559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018878	TAAGA	2	10	4563	4572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018878	AATT	2	8	4607	4614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018878	AT	3	6	4624	4629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018878	ATA	2	6	4634	4639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018878	AGG	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018878	T	6	6	7162	7167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018878	TAAA	2	8	7244	7251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018878	A	6	6	7323	7328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018878	TAA	2	6	7335	7340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018878	GATA	2	8	7349	7356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018878	TTG	2	6	7376	7381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018878	ATA	2	6	9632	9637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018878	TAAA	2	8	9720	9727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018878	AT	3	6	12201	12206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018878	T	6	6	12215	12220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018878	A	6	6	12264	12269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018878	ATACA	2	10	12282	12291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018878	TA	3	6	12298	12303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018878	GAG	2	6	12337	12342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018878	TTAT	2	8	12345	12352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018878	AG	3	6	12838	12843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018878	CTTTT	2	10	12863	12872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018878	ATT	2	6	12907	12912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018878	T	8	8	14382	14389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018878	TA	3	6	14479	14484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018878	ATT	2	6	14491	14496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018878	TAA	2	6	14498	14503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018878	AT	3	6	14514	14519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018878	ATG	2	6	14531	14536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018878	AGG	2	6	14548	14553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018878	ACA	2	6	14580	14585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018878	TCAA	2	8	14591	14598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018878	TAT	2	6	14875	14880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018878	TAA	3	9	14915	14923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018878	CAG	2	6	14927	14932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018878	TC	3	6	16421	16426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018878	T	7	7	16427	16433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018878	G	6	6	16467	16472	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018878	A	6	6	16500	16505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018878	GTG	2	6	16518	16523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018878	AGT	2	6	16913	16918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018878	A	6	6	16981	16986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018878	GAA	2	6	18621	18626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018878	CAC	2	6	18854	18859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018878	TAT	2	6	18877	18882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018878	A	6	6	18898	18903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018878	AT	3	6	18920	18925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018878	TAG	2	6	18935	18940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018878	AC	3	6	18949	18954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018878	TAA	2	6	18972	18977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018878	GAAA	2	8	19004	19011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018878	T	6	6	19384	19389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018878	AG	3	6	19394	19399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018878	GGA	2	6	19603	19608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018878	AAT	2	6	20243	20248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018878	TCAAAA	2	12	20261	20272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018878	T	6	6	20320	20325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018878	TAAA	2	8	20330	20337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018878	GGT	2	6	21449	21454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018878	AGA	2	6	22345	22350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018878	AAT	2	6	22398	22403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018878	CTTT	2	8	22415	22422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018878	TA	3	6	22426	22431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018878	TA	3	6	24365	24370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018878	ATAAA	2	10	24424	24433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018878	TAA	2	6	24434	24439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018878	GA	3	6	24446	24451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018878	TTA	2	6	25668	25673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018878	TTA	2	6	25714	25719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018878	TTA	2	6	25779	25784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018878	CAA	2	6	25807	25812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018878	TA	3	6	25828	25833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018878	TTTATA	2	12	25864	25875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018878	A	6	6	25885	25890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018878	A	6	6	25907	25912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018878	TTTA	2	8	25934	25941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018878	AGT	2	6	25947	25952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018878	ATT	2	6	26016	26021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018878	ATT	2	6	26574	26579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018878	TTA	2	6	26580	26585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018878	ATA	2	6	26591	26596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018878	AGA	2	6	26599	26604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018878	TAAA	2	8	26605	26612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018878	T	7	7	27245	27251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018878	ATAA	2	8	27252	27259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018878	TA	4	8	27535	27542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018878	A	6	6	28161	28166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018878	AGA	2	6	28179	28184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018878	GTCT	2	8	28185	28192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018878	GTTG	2	8	28193	28200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018878	TAATA	2	10	29353	29362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018878	A	6	6	29397	29402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018878	AGA	2	6	29404	29409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018878	ATA	2	6	30012	30017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018878	AACA	2	8	30042	30049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018878	TGG	2	6	30152	30157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018878	TAA	2	6	30222	30227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018878	GAAGG	2	10	30243	30252	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018878	A	6	6	30570	30575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018878	ATT	2	6	30587	30592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018878	TAAA	2	8	30975	30982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018878	TATT	2	8	31001	31008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018878	AGAAAA	2	12	31059	31070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018878	AAG	2	6	31078	31083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018878	TA	3	6	31099	31104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018878	GAA	2	6	31542	31547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018878	T	6	6	31551	31556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018878	ATC	2	6	32643	32648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018878	TA	4	8	33340	33347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018878	A	7	7	33351	33357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018878	CTA	2	6	34461	34466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018878	A	6	6	34509	34514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018878	AATATA	2	12	35387	35398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018878	ACAA	2	8	35426	35433	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018878	GAACG	2	10	35450	35459	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018878	AAC	2	6	35499	35504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018878	TA	3	6	35739	35744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018878	AAAGT	2	10	35750	35759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018878	T	7	7	35776	35782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018878	AAT	2	6	35796	35801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018878	TAAT	2	8	35826	35833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018878	A	6	6	35847	35852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018878	TAA	2	6	35862	35867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018878	ATTTTT	2	12	35900	35911	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018878	ATC	2	6	35950	35955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018878	T	7	7	37084	37090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_018878	AT	3	6	37348	37353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018878	T	6	6	38176	38181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018878	CTT	2	6	40929	40934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_018878	ATAA	2	8	42975	42982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_018878	TCC	2	6	46294	46299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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297	NC_018878	AGA	2	6	61912	61917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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