MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia phenoliruptrix BR3459a plasmid pSYMBR3459

Total Repeats: 3719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018696	CTG	2	6	12	17	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018696	CTG	2	6	33	38	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018696	GC	3	6	144	149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018696	CGC	2	6	210	215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018696	GAAA	2	8	844	851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018696	GC	3	6	857	862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018696	CA	3	6	881	886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018696	CG	3	6	941	946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018696	GAGC	2	8	978	985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018696	AAATG	2	10	1016	1025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018696	TA	3	6	1029	1034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018696	GCG	2	6	1165	1170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018696	TGT	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018696	CGA	2	6	1218	1223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018696	TGGT	2	8	1278	1285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018696	CGT	2	6	1331	1336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018696	ATG	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018696	CAAC	2	8	1442	1449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018696	CTT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018696	CGG	2	6	1467	1472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018696	CA	3	6	1522	1527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018696	TCT	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018696	CGT	2	6	1693	1698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018696	GATCAA	2	12	1747	1758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018696	GGCGA	2	10	3229	3238	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018696	AG	3	6	3272	3277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018696	CAT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018696	GCAC	2	8	3284	3291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018696	ATG	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018696	GCC	2	6	3382	3387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018696	GCCG	2	8	3395	3402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018696	TACA	2	8	3403	3410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018696	CCTG	2	8	3434	3441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018696	GGT	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018696	TCG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018696	GTC	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018696	CA	3	6	3620	3625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018696	TCC	2	6	9388	9393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018696	CGT	2	6	9404	9409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018696	TGGAG	2	10	9453	9462	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018696	CGT	2	6	9514	9519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018696	GGCG	2	8	9520	9527	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018696	TG	3	6	17579	17584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018696	AGC	2	6	17625	17630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018696	TTG	2	6	17692	17697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018696	AACG	2	8	17738	17745	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018696	CAA	2	6	17874	17879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018696	ATG	2	6	17954	17959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018696	ATT	2	6	17985	17990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018696	CCT	2	6	18135	18140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018696	TA	3	6	18186	18191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018696	GTTC	2	8	19587	19594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018696	TCGA	2	8	19652	19659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018696	G	6	6	19953	19958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018696	CCATT	2	10	19959	19968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018696	GGC	2	6	19975	19980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018696	GTCTG	2	10	20000	20009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018696	GAT	2	6	20115	20120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018696	GC	3	6	20222	20227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018696	TCG	2	6	20229	20234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018696	TTAT	2	8	20269	20276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018696	CAC	2	6	20351	20356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018696	GCG	2	6	20368	20373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018696	TCC	2	6	20396	20401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018696	GC	3	6	20407	20412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018696	CGC	2	6	20420	20425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018696	CG	3	6	21114	21119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018696	TGGC	2	8	21249	21256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018696	CGC	2	6	21290	21295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018696	CTGG	2	8	21352	21359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018696	CGC	2	6	21367	21372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018696	GCCG	2	8	21392	21399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018696	AAC	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018696	CGC	2	6	21495	21500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018696	TCAC	2	8	21527	21534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018696	TCGA	2	8	22212	22219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018696	GGCA	2	8	25883	25890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018696	CAG	2	6	25899	25904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018696	TGA	2	6	25960	25965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018696	GCG	2	6	26011	26016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018696	GC	3	6	26020	26025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018696	CAGC	2	8	26041	26048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018696	CG	3	6	26053	26058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018696	GCT	2	6	26099	26104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018696	TGCGC	2	10	26116	26125	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_018696	AGC	3	9	26653	26661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018696	GC	3	6	27996	28001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018696	GAGC	2	8	28002	28009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018696	AGC	2	6	28019	28024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018696	GC	3	6	28023	28028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018696	CAG	3	9	28033	28041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018696	CAG	2	6	28054	28059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018696	CGGCG	2	10	28063	28072	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018696	CG	4	8	28075	28082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018696	CCT	2	6	30919	30924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018696	GC	3	6	30957	30962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018696	CAAC	2	8	30964	30971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018696	TCAG	2	8	32487	32494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018696	AG	3	6	32493	32498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018696	AAG	2	6	32505	32510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018696	TCG	2	6	32615	32620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018696	AGGA	2	8	32757	32764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018696	GC	3	6	32765	32770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018696	T	7	7	32827	32833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018696	TCG	2	6	32880	32885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018696	TCCCC	2	10	32891	32900	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_018696	TCA	2	6	32948	32953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018696	CGA	2	6	32965	32970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018696	CT	3	6	32975	32980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018696	A	6	6	33003	33008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018696	AGA	2	6	33064	33069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018696	GGC	2	6	33071	33076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018696	GC	3	6	33145	33150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018696	CGA	2	6	33261	33266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018696	TAC	2	6	33278	33283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018696	CCG	2	6	33299	33304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018696	CGC	2	6	33314	33319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_018696	GCTC	2	8	33326	33333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018696	CGC	2	6	33547	33552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018696	TCG	2	6	33565	33570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018696	TGGCCC	2	12	33727	33738	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018696	CAG	2	6	33914	33919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018696	T	6	6	33946	33951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018696	CGA	2	6	33971	33976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018696	AAAG	2	8	33991	33998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018696	TCGT	2	8	34162	34169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018696	GAT	2	6	34174	34179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018696	T	6	6	34210	34215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018696	GAA	2	6	34278	34283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018696	GCC	2	6	34413	34418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018696	TC	3	6	34422	34427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018696	GCA	2	6	34593	34598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018696	GCT	2	6	34964	34969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018696	CGA	2	6	34984	34989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018696	T	6	6	34997	35002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018696	CTT	2	6	35017	35022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018696	CAG	2	6	35023	35028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018696	ATGA	2	8	35327	35334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018696	CGTG	2	8	35385	35392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018696	TTG	2	6	35588	35593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018696	CGC	2	6	35649	35654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018696	GCT	2	6	35788	35793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018696	CTA	2	6	36614	36619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018696	TGC	2	6	36657	36662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018696	AAATA	2	10	36705	36714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018696	CAA	2	6	38854	38859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018696	CG	3	6	38871	38876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018696	TAA	2	6	38916	38921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_018696	CGT	2	6	64957	64962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_018696	CGC	2	6	65365	65370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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300	NC_018696	TG	3	6	70576	70581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_018696	GCAG	2	8	93759	93766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
423	NC_018696	CG	3	6	93767	93772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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425	NC_018696	GC	3	6	93835	93840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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427	NC_018696	CGG	2	6	94833	94838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_018696	TGG	2	6	95043	95048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_018696	ATC	2	6	95066	95071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_018696	GCATTT	2	12	95106	95117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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440	NC_018696	CCG	2	6	95415	95420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_018696	CG	3	6	95427	95432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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446	NC_018696	GCC	2	6	95764	95769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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454	NC_018696	CGC	2	6	97340	97345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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