MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 3492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	AGG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018689	ACG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018689	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018689	ATAATT	2	12	727	738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018689	AATA	2	8	767	774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018689	ATT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018689	GTA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018689	AAC	2	6	861	866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018689	TAA	2	6	920	925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018689	CTT	2	6	1019	1024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018689	ACT	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018689	CTTC	2	8	1099	1106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018689	TAAT	2	8	1125	1132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018689	TAT	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018689	AAATC	2	10	4994	5003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018689	T	6	6	5030	5035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018689	TTA	2	6	5055	5060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018689	TA	3	6	5059	5064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018689	ATT	2	6	5093	5098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018689	T	7	7	5195	5201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018689	TAA	2	6	5272	5277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018689	AAG	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018689	A	6	6	5318	5323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018689	GAG	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018689	T	6	6	5345	5350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018689	TAA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018689	AAT	2	6	5836	5841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018689	GT	3	6	5853	5858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018689	TCT	3	9	5900	5908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018689	T	7	7	5911	5917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018689	ATA	2	6	5946	5951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018689	ATA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018689	TA	3	6	6087	6092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018689	T	6	6	6120	6125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018689	GAA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018689	AAG	2	6	6284	6289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018689	AAG	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018689	T	6	6	7351	7356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018689	AAG	2	6	7381	7386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018689	ATG	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018689	CTT	2	6	7417	7422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018689	TTTA	2	8	7423	7430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018689	CAC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018689	T	6	6	8734	8739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018689	A	7	7	8765	8771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018689	GTC	2	6	8792	8797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018689	T	6	6	8805	8810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018689	TCTA	2	8	8842	8849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018689	AATAA	2	10	8860	8869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018689	ATT	2	6	8960	8965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018689	ATT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018689	GTA	2	6	9016	9021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018689	TTAC	2	8	9025	9032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018689	GAAAA	2	10	9051	9060	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018689	A	7	7	9067	9073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018689	GT	3	6	9100	9105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018689	GAA	2	6	9111	9116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018689	TAA	2	6	9186	9191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018689	AGG	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018689	CAT	2	6	11338	11343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018689	AG	3	6	12882	12887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018689	AGT	2	6	12929	12934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018689	AAG	2	6	12942	12947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018689	GATAGA	2	12	13000	13011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018689	AG	3	6	14973	14978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018689	CT	3	6	15010	15015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018689	GA	3	6	15070	15075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018689	CAA	2	6	16023	16028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018689	TCT	2	6	16030	16035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018689	GGTT	2	8	16061	16068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018689	TAA	2	6	16076	16081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018689	ATA	2	6	16082	16087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018689	TTC	2	6	16965	16970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018689	ATA	2	6	16976	16981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018689	TTAG	2	8	16997	17004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018689	ATTA	2	8	17035	17042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018689	AAAG	2	8	17855	17862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018689	T	6	6	17915	17920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018689	AGGC	2	8	17929	17936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018689	TAC	2	6	17972	17977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018689	T	7	7	17979	17985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018689	TTTAG	2	10	18142	18151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018689	TTA	3	9	18169	18177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018689	ATAAA	2	10	18217	18226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018689	ATA	2	6	18242	18247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018689	A	6	6	18270	18275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018689	ATT	2	6	18298	18303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018689	TAC	2	6	18326	18331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018689	AGG	2	6	18332	18337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018689	ATA	2	6	18352	18357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018689	TAT	2	6	18359	18364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018689	TAATTT	2	12	18386	18397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018689	T	6	6	19543	19548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018689	A	6	6	19597	19602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018689	AGC	2	6	19625	19630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018689	A	6	6	19686	19691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018689	ATT	2	6	19706	19711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018689	GT	3	6	19715	19720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018689	A	7	7	19722	19728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018689	A	6	6	19751	19756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018689	A	6	6	19759	19764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018689	ATGA	2	8	19818	19825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018689	TA	3	6	19857	19862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018689	AGA	2	6	19874	19879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018689	ATTT	2	8	19934	19941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018689	ATA	2	6	21298	21303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018689	T	7	7	21336	21342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018689	ATG	2	6	21372	21377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018689	T	7	7	21434	21440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018689	TGT	2	6	21452	21457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018689	CTT	2	6	21468	21473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018689	TAG	2	6	21495	21500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018689	AG	3	6	21505	21510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018689	AT	3	6	21536	21541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018689	TTA	2	6	21547	21552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018689	AAAT	2	8	21573	21580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018689	ATT	2	6	21657	21662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018689	TAA	2	6	21689	21694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018689	TAAG	2	8	21706	21713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018689	TGC	2	6	21860	21865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018689	T	6	6	21867	21872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018689	AAG	2	6	21898	21903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018689	ATC	2	6	21906	21911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018689	ATT	2	6	21927	21932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018689	GTA	2	6	21954	21959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018689	ATT	2	6	21970	21975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018689	ATT	2	6	22072	22077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018689	T	6	6	22103	22108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018689	TTC	2	6	22206	22211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018689	GAT	2	6	22224	22229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018689	TA	3	6	22262	22267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018689	TAAAG	2	10	22270	22279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018689	G	6	6	22279	22284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018689	GATA	2	8	23202	23209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018689	CTC	2	6	23211	23216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018689	GGA	2	6	23259	23264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018689	T	6	6	23289	23294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018689	A	6	6	23297	23302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018689	CA	3	6	23326	23331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018689	TCT	2	6	23364	23369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018689	AT	4	8	23401	23408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018689	GAA	2	6	23528	23533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018689	TTA	2	6	23557	23562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018689	CTC	2	6	23981	23986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_018689	TGT	2	6	24067	24072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018689	T	6	6	24084	24089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018689	AAT	2	6	24149	24154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018689	TAT	2	6	24164	24169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018689	AG	3	6	24254	24259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018689	CAAA	2	8	24265	24272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018689	A	6	6	24295	24300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_018689	TTA	2	6	61984	61989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018689	TCC	2	6	62037	62042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_018689	TA	3	6	62044	62049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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