MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 1537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	TCCC	2	8	7	14	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_018687	ATC	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018687	TAA	2	6	207	212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018687	TAA	2	6	219	224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018687	TAAA	2	8	237	244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018687	TTA	2	6	250	255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018687	CCT	2	6	311	316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018687	A	6	6	327	332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018687	CTC	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018687	T	6	6	6135	6140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018687	TTC	2	6	8046	8051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018687	TTTCA	2	10	8070	8079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018687	CT	3	6	8862	8867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018687	A	7	7	8893	8899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018687	CAA	2	6	8902	8907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018687	A	7	7	8906	8912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018687	CCT	2	6	8931	8936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018687	T	6	6	8953	8958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018687	CAC	2	6	9534	9539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018687	TAT	2	6	9546	9551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018687	ACT	2	6	9557	9562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018687	CAC	2	6	9652	9657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018687	TAG	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018687	GGC	2	6	9762	9767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018687	TCC	2	6	11129	11134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018687	T	6	6	11188	11193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018687	CAC	2	6	11248	11253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018687	TCC	2	6	11726	11731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018687	TGA	2	6	11765	11770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018687	TTTAT	2	10	11797	11806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018687	CTT	2	6	11986	11991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018687	AT	4	8	12149	12156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018687	CAT	2	6	12176	12181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018687	AT	4	8	12204	12211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018687	AAC	2	6	12226	12231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018687	ATTTC	2	10	13220	13229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018687	T	8	8	16206	16213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018687	TTTA	2	8	16247	16254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018687	T	6	6	16267	16272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018687	CCT	2	6	16488	16493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018687	ATA	2	6	16561	16566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018687	TTTA	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018687	AT	3	6	16587	16592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018687	ATA	2	6	16598	16603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018687	AACA	2	8	17242	17249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018687	A	6	6	17262	17267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018687	ATT	2	6	17273	17278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018687	AT	4	8	17458	17465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018687	TAT	2	6	17476	17481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018687	AT	4	8	17490	17497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018687	AAG	2	6	17782	17787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018687	A	6	6	17820	17825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018687	ATT	2	6	17844	17849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018687	CCA	2	6	17888	17893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018687	ATA	2	6	17950	17955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018687	ATT	2	6	17956	17961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018687	AAATG	2	10	17983	17992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018687	AT	3	6	18007	18012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018687	A	8	8	18039	18046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018687	TCT	2	6	18094	18099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018687	ACTT	2	8	18187	18194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018687	ACC	2	6	18218	18223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018687	ATG	2	6	18260	18265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018687	CTT	2	6	18457	18462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018687	GAT	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018687	TTA	2	6	18541	18546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018687	A	7	7	18573	18579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018687	ATT	3	9	18582	18590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018687	CTTG	2	8	18595	18602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018687	A	6	6	18603	18608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018687	CATA	2	8	18610	18617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018687	TTA	2	6	18639	18644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018687	CTTT	2	8	18653	18660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018687	TCA	2	6	18666	18671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018687	A	7	7	18683	18689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018687	A	6	6	18739	18744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018687	CCCT	2	8	18746	18753	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_018687	TATTT	2	10	18851	18860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018687	TATT	2	8	18867	18874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018687	T	6	6	18883	18888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018687	TAA	2	6	18900	18905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018687	GGA	2	6	18963	18968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018687	TGA	2	6	18981	18986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018687	ATTT	2	8	19059	19066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018687	TTTTAA	2	12	19091	19102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018687	TA	3	6	19137	19142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018687	A	7	7	19144	19150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018687	TA	3	6	19191	19196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018687	A	6	6	19196	19201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018687	AGG	2	6	19205	19210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018687	TAA	2	6	19802	19807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018687	TCC	2	6	19835	19840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018687	TTAAA	2	10	19857	19866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018687	ATTT	2	8	19900	19907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018687	TGT	2	6	19909	19914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018687	T	6	6	19916	19921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018687	A	7	7	19956	19962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018687	AAAT	2	8	19967	19974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018687	GAA	2	6	21681	21686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018687	A	6	6	21689	21694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018687	CAA	2	6	21695	21700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018687	CTTA	2	8	21725	21732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018687	ATAC	2	8	21783	21790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018687	GTG	2	6	21806	21811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018687	AGT	2	6	21829	21834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018687	A	7	7	21839	21845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018687	TATT	2	8	21881	21888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018687	TTA	2	6	21890	21895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018687	T	7	7	21918	21924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018687	ATT	3	9	21946	21954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018687	TAT	2	6	21973	21978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018687	TGT	2	6	21989	21994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018687	AAT	2	6	21999	22004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018687	GTAG	2	8	22021	22028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018687	T	6	6	22059	22064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018687	ATA	2	6	22065	22070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018687	AAG	2	6	22080	22085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018687	TAA	2	6	22308	22313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018687	ATTT	2	8	22331	22338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018687	T	6	6	22336	22341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018687	CAA	2	6	23723	23728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018687	GAG	2	6	23761	23766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018687	AATTT	2	10	23781	23790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018687	TAT	2	6	23804	23809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018687	ATG	2	6	23838	23843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018687	A	7	7	23859	23865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018687	T	6	6	23887	23892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018687	TCCT	2	8	25124	25131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018687	T	6	6	25189	25194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018687	AAT	2	6	25267	25272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018687	AT	3	6	25301	25306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018687	TAGA	2	8	25349	25356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018687	TA	4	8	25477	25484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018687	TA	3	6	25500	25505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018687	AT	3	6	25562	25567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018687	ACAA	2	8	25571	25578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018687	TGT	2	6	25588	25593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018687	TA	3	6	25600	25605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018687	TTA	2	6	25613	25618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018687	CTT	2	6	25627	25632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018687	AGA	2	6	25641	25646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018687	ATC	2	6	25725	25730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018687	TA	3	6	25745	25750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018687	TA	3	6	25770	25775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018687	TA	3	6	25814	25819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018687	TAA	2	6	25846	25851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018687	G	6	6	25883	25888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018687	T	6	6	25893	25898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018687	AAC	2	6	25940	25945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018687	GTT	2	6	25954	25959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018687	ATA	2	6	25994	25999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_018687	TCT	2	6	56202	56207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_018687	ATT	2	6	56211	56216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_018687	AAT	2	6	56228	56233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_018687	T	8	8	56254	56261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018687	T	7	7	56309	56315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_018687	TTACAT	2	12	56401	56412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
453	NC_018687	GAA	2	6	56448	56453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
454	NC_018687	ATT	2	6	56764	56769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_018687	ATG	2	6	56787	56792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_018687	ATTG	2	8	56804	56811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
457	NC_018687	CTG	2	6	56831	56836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_018687	TAAT	2	8	60340	60347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_018687	A	6	6	60378	60383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_018687	TAA	2	6	60424	60429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_018687	A	6	6	60428	60433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_018687	T	6	6	60675	60680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_018687	A	7	7	60910	60916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_018687	TA	3	6	61157	61162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_018687	TTAC	2	8	61222	61229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
489	NC_018687	A	6	6	61335	61340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_018687	TA	3	6	61352	61357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_018687	AT	3	6	61368	61373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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