MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli B2904 chromosome

Total Repeats: 13388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018607	T	7	7	20	26	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018607	TAA	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018607	TAA	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018607	TAA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018607	CTAA	2	8	107	114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018607	T	6	6	128	133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018607	ATTTT	2	10	138	147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018607	TTAA	2	8	166	173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018607	T	8	8	217	224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018607	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018607	TAA	3	9	267	275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018607	AT	3	6	299	304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018607	TATCTA	2	12	318	329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018607	TAA	2	6	364	369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018607	ATG	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018607	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018607	TAAA	2	8	422	429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018607	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018607	TTA	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018607	TATAA	2	10	454	463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018607	TAT	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018607	A	6	6	2262	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018607	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018607	TAAT	2	8	2303	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018607	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018607	T	6	6	3460	3465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018607	TA	3	6	3485	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018607	TA	4	8	3497	3504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018607	ATTA	2	8	3528	3535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018607	GAT	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018607	AGCC	2	8	5564	5571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018607	ATTT	2	8	5586	5593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018607	ATT	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018607	AT	3	6	5625	5630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018607	AAT	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018607	TTTA	2	8	5676	5683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018607	AT	4	8	6346	6353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018607	TA	3	6	6384	6389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018607	A	7	7	6409	6415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018607	AAT	2	6	6420	6425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018607	CGTG	2	8	6466	6473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018607	A	6	6	6482	6487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018607	TAA	2	6	6490	6495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018607	TGGG	2	8	6501	6508	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018607	TTAG	2	8	6524	6531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018607	A	8	8	6538	6545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018607	T	6	6	6650	6655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018607	ATTAAT	2	12	6708	6719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018607	TGA	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018607	T	6	6	8230	8235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018607	A	6	6	8241	8246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018607	ATA	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018607	TA	4	8	8897	8904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018607	TA	3	6	8906	8911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018607	ATT	2	6	8942	8947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018607	T	6	6	8946	8951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018607	AAATA	2	10	8956	8965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018607	ATA	2	6	8979	8984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018607	AT	3	6	8989	8994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018607	ATT	2	6	10900	10905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018607	TA	4	8	10929	10936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018607	T	6	6	10956	10961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018607	T	7	7	10963	10969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018607	A	6	6	10982	10987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018607	AT	4	8	10999	11006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018607	TAA	2	6	11013	11018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018607	ATA	2	6	11021	11026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018607	TA	3	6	12175	12180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018607	TTAAT	2	10	12195	12204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018607	AT	3	6	12226	12231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018607	TAAAT	2	10	13262	13271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018607	TGA	2	6	13322	13327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018607	AGA	2	6	13348	13353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018607	TAT	2	6	13404	13409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018607	TTAT	2	8	13412	13419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018607	AT	4	8	13438	13445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018607	T	6	6	13445	13450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018607	TTTA	2	8	13468	13475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018607	ATC	2	6	13486	13491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018607	A	7	7	13494	13500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018607	ATTTTA	2	12	13505	13516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018607	TTAT	2	8	13517	13524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018607	TAA	2	6	13556	13561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018607	TA	3	6	13576	13581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018607	TTC	2	6	13605	13610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018607	ATTA	2	8	14324	14331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018607	TAT	2	6	14332	14337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018607	T	6	6	14381	14386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018607	TTA	2	6	14393	14398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018607	TTTA	2	8	14406	14413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018607	ATTAT	2	10	14443	14452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018607	TAATA	2	10	14468	14477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018607	ATA	2	6	17726	17731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018607	TA	4	8	18825	18832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018607	T	6	6	18835	18840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018607	A	6	6	18847	18852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018607	A	6	6	19873	19878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018607	TAT	2	6	19885	19890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018607	ATTA	2	8	19901	19908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018607	AAT	2	6	19918	19923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018607	TTC	2	6	19924	19929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018607	T	6	6	20335	20340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018607	TATT	2	8	20399	20406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018607	T	6	6	20454	20459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018607	A	6	6	20466	20471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018607	ATTA	2	8	20482	20489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018607	TTC	2	6	21438	21443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018607	CCA	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018607	A	6	6	21583	21588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018607	A	6	6	21592	21597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018607	TAG	2	6	22694	22699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018607	ATT	2	6	22710	22715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018607	A	6	6	22718	22723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018607	TA	3	6	22738	22743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018607	A	7	7	22747	22753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018607	ACC	2	6	22789	22794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018607	ATA	2	6	22805	22810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018607	CTT	2	6	22828	22833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018607	AATTA	2	10	22864	22873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018607	TAA	2	6	22883	22888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018607	TTC	2	6	22897	22902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018607	CTT	2	6	22928	22933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018607	CTTC	2	8	22954	22961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018607	AAG	2	6	22970	22975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018607	A	6	6	23036	23041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018607	T	6	6	23059	23064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018607	TA	3	6	23067	23072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018607	AAT	2	6	24190	24195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018607	A	6	6	24212	24217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018607	TAT	2	6	24774	24779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018607	A	6	6	24786	24791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018607	TAAT	2	8	25478	25485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018607	AAT	2	6	25494	25499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018607	TA	3	6	25533	25538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018607	A	7	7	25542	25548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018607	ATT	2	6	25553	25558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018607	TTA	2	6	25579	25584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018607	TA	4	8	25593	25600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018607	ATT	2	6	25660	25665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018607	ATA	2	6	26404	26409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018607	TAT	2	6	26428	26433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018607	CAGA	2	8	26447	26454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018607	CTG	2	6	26483	26488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018607	ACA	2	6	26509	26514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018607	TA	3	6	26925	26930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018607	TAT	2	6	26942	26947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018607	TAA	3	9	26957	26965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018607	TAT	2	6	26980	26985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018607	ATA	2	6	27805	27810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018607	AAAT	2	8	28792	28799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018607	T	7	7	28812	28818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018607	GTT	2	6	28819	28824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018607	AT	4	8	28903	28910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018607	TAT	2	6	31156	31161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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