MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei BPC006 chromosome I

Total Repeats: 15695

< Previous12...20212223242526272829303132Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_018527	GC	3	6	3942679	3942684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15502	NC_018527	CGG	2	6	3942720	3942725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_018527	GCC	2	6	3943400	3943405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15504	NC_018527	AAC	2	6	3944135	3944140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_018527	AAG	2	6	3944144	3944149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_018527	CAT	2	6	3944158	3944163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_018527	GC	3	6	3945803	3945808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15508	NC_018527	CG	3	6	3945809	3945814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15509	NC_018527	GGC	2	6	3945818	3945823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_018527	GCGCG	2	10	3945862	3945871	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15511	NC_018527	CCG	2	6	3945872	3945877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15512	NC_018527	CTG	2	6	3945892	3945897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_018527	AACG	2	8	3945899	3945906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15514	NC_018527	CGC	2	6	3947467	3947472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15515	NC_018527	GGC	2	6	3947473	3947478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_018527	GCC	2	6	3947498	3947503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15517	NC_018527	GC	3	6	3947504	3947509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15518	NC_018527	CCG	2	6	3947528	3947533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15519	NC_018527	A	6	6	3947591	3947596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_018527	CCG	3	9	3947610	3947618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15521	NC_018527	CATCGA	2	12	3947644	3947655	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_018527	GC	3	6	3947657	3947662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15523	NC_018527	CGC	2	6	3947669	3947674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15524	NC_018527	GC	4	8	3947681	3947688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15525	NC_018527	TCT	2	6	3948847	3948852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_018527	TCT	2	6	3952865	3952870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_018527	GATG	3	12	3953142	3953153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_018527	CCG	2	6	3955602	3955607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15529	NC_018527	GC	3	6	3955709	3955714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15530	NC_018527	TTG	2	6	3955736	3955741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_018527	CCAC	2	8	3955783	3955790	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15532	NC_018527	GGGC	2	8	3955806	3955813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15533	NC_018527	GCT	2	6	3955839	3955844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_018527	CCG	2	6	3955854	3955859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15535	NC_018527	GCC	2	6	3955884	3955889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15536	NC_018527	AAGTC	2	10	3955922	3955931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15537	NC_018527	CGC	2	6	3956007	3956012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15538	NC_018527	CGA	2	6	3957135	3957140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15539	NC_018527	GC	3	6	3957174	3957179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15540	NC_018527	GCCG	2	8	3957209	3957216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15541	NC_018527	GTG	2	6	3958053	3958058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_018527	GC	4	8	3958070	3958077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15543	NC_018527	CGC	2	6	3958101	3958106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15544	NC_018527	GC	4	8	3958122	3958129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15545	NC_018527	CGG	2	6	3958197	3958202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_018527	CGCC	2	8	3958209	3958216	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15547	NC_018527	CG	3	6	3958222	3958227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15548	NC_018527	T	6	6	3958779	3958784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_018527	T	7	7	3959119	3959125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_018527	GCGCG	2	10	3959142	3959151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15551	NC_018527	CTG	2	6	3960873	3960878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_018527	TCG	2	6	3960920	3960925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_018527	ATT	2	6	3960946	3960951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_018527	GGA	2	6	3961008	3961013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_018527	CGG	2	6	3961639	3961644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_018527	CGG	2	6	3961731	3961736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_018527	CG	3	6	3963337	3963342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15558	NC_018527	TTGC	2	8	3964225	3964232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15559	NC_018527	GCG	2	6	3964245	3964250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_018527	CGC	2	6	3964271	3964276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_018527	C	6	6	3966360	3966365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15562	NC_018527	GGGC	2	8	3966396	3966403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15563	NC_018527	A	6	6	3967332	3967337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_018527	GTG	2	6	3968166	3968171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_018527	CGGA	2	8	3968183	3968190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15566	NC_018527	TTG	2	6	3968280	3968285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_018527	CG	3	6	3968319	3968324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15568	NC_018527	CCA	2	6	3968608	3968613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15569	NC_018527	ACC	3	9	3968651	3968659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15570	NC_018527	CAT	2	6	3968739	3968744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15571	NC_018527	CTT	2	6	3968745	3968750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15572	NC_018527	GCT	2	6	3968751	3968756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_018527	GTC	2	6	3968767	3968772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15574	NC_018527	GC	3	6	3968783	3968788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15575	NC_018527	GCT	2	6	3968819	3968824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_018527	CTAA	2	8	3968928	3968935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15577	NC_018527	GCG	2	6	3972011	3972016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_018527	G	6	6	3972693	3972698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_018527	A	6	6	3974796	3974801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_018527	TTC	2	6	3978461	3978466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15581	NC_018527	CAG	2	6	3978520	3978525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15582	NC_018527	CAT	2	6	3978589	3978594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15583	NC_018527	TCGC	2	8	3978615	3978622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15584	NC_018527	ACGC	2	8	3978627	3978634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15585	NC_018527	CCG	2	6	3978644	3978649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15586	NC_018527	CG	3	6	3978651	3978656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15587	NC_018527	CGC	2	6	3978672	3978677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15588	NC_018527	AGC	2	6	3978727	3978732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_018527	GC	4	8	3978731	3978738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15590	NC_018527	CG	4	8	3978746	3978753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15591	NC_018527	GCC	2	6	3978760	3978765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15592	NC_018527	CGA	2	6	3980231	3980236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_018527	TGCC	2	8	3980237	3980244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15594	NC_018527	TGCG	2	8	3981730	3981737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15595	NC_018527	CGC	2	6	3981767	3981772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15596	NC_018527	CGG	2	6	3981790	3981795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15597	NC_018527	GCCG	2	8	3981815	3981822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15598	NC_018527	GC	3	6	3981829	3981834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15599	NC_018527	GCC	2	6	3981848	3981853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15600	NC_018527	CG	3	6	3981875	3981880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15601	NC_018527	GTCA	2	8	3983760	3983767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15602	NC_018527	GCG	2	6	3985147	3985152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_018527	GTGCA	2	10	3986849	3986858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15604	NC_018527	T	6	6	3986901	3986906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_018527	T	7	7	3986913	3986919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_018527	TCGAA	2	10	3987061	3987070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15607	NC_018527	CCG	3	9	3987074	3987082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15608	NC_018527	GC	3	6	3987092	3987097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15609	NC_018527	GCTTT	2	10	3987107	3987116	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15610	NC_018527	TTAT	2	8	3987136	3987143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_018527	GCG	2	6	3988895	3988900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_018527	CCG	2	6	3988914	3988919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15613	NC_018527	CG	3	6	3988921	3988926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15614	NC_018527	CG	3	6	3988941	3988946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15615	NC_018527	GC	4	8	3988964	3988971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15616	NC_018527	CG	3	6	3988987	3988992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15617	NC_018527	CG	3	6	3989009	3989014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15618	NC_018527	CG	3	6	3990729	3990734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15619	NC_018527	TCG	2	6	3990736	3990741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15620	NC_018527	CG	4	8	3990746	3990753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15621	NC_018527	CG	4	8	3990766	3990773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15622	NC_018527	GCG	3	9	3990771	3990779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15623	NC_018527	CCG	2	6	3990799	3990804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15624	NC_018527	TGA	2	6	3991613	3991618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_018527	CGG	3	9	3991628	3991636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15626	NC_018527	GCG	2	6	3991661	3991666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_018527	GC	3	6	3991669	3991674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15628	NC_018527	ACG	2	6	3991679	3991684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15629	NC_018527	CG	5	10	3991683	3991692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15630	NC_018527	CCG	2	6	3991702	3991707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15631	NC_018527	CG	3	6	3991714	3991719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15632	NC_018527	AGC	2	6	3991740	3991745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15633	NC_018527	CGCGG	2	10	3991751	3991760	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15634	NC_018527	CGC	2	6	3991810	3991815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15635	NC_018527	CGC	3	9	3991833	3991841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15636	NC_018527	CGC	2	6	3991866	3991871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15637	NC_018527	CGG	2	6	3991883	3991888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15638	NC_018527	GC	3	6	3991894	3991899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15639	NC_018527	CGCGT	2	10	3991907	3991916	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15640	NC_018527	CGC	2	6	3992546	3992551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15641	NC_018527	GC	3	6	3992550	3992555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15642	NC_018527	CGCC	2	8	3992556	3992563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15643	NC_018527	GCC	2	6	3992589	3992594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15644	NC_018527	CGGG	2	8	3992605	3992612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15645	NC_018527	CGCC	2	8	3992613	3992620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15646	NC_018527	GC	3	6	3992621	3992626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15647	NC_018527	CA	3	6	3993173	3993178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15648	NC_018527	CG	3	6	3993201	3993206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15649	NC_018527	TGCA	2	8	3993223	3993230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15650	NC_018527	CAC	2	6	3993235	3993240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15651	NC_018527	GTC	2	6	3994572	3994577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15652	NC_018527	TGAA	2	8	3994610	3994617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15653	NC_018527	TGCG	2	8	3995694	3995701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15654	NC_018527	GC	3	6	3995702	3995707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15655	NC_018527	CG	5	10	3995714	3995723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15656	NC_018527	GCG	2	6	3995752	3995757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15657	NC_018527	TTCTT	2	10	3995762	3995771	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15658	NC_018527	CG	3	6	3995773	3995778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15659	NC_018527	GC	4	8	3997509	3997516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15660	NC_018527	CG	4	8	3997523	3997530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15661	NC_018527	TCGC	2	8	3997539	3997546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15662	NC_018527	GGGA	2	8	3997602	3997609	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15663	NC_018527	CTT	2	6	3997633	3997638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15664	NC_018527	CGG	2	6	3997673	3997678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15665	NC_018527	CG	3	6	3997680	3997685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15666	NC_018527	CCG	3	9	3997699	3997707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15667	NC_018527	GCCG	2	8	3998281	3998288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15668	NC_018527	CG	3	6	3998287	3998292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15669	NC_018527	CGC	2	6	3998306	3998311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15670	NC_018527	GGC	2	6	3998313	3998318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15671	NC_018527	CAT	2	6	3998319	3998324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15672	NC_018527	CG	4	8	3998329	3998336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15673	NC_018527	ATC	2	6	3998350	3998355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15674	NC_018527	CG	3	6	3998399	3998404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15675	NC_018527	CG	3	6	3998416	3998421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15676	NC_018527	GC	3	6	3998469	3998474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15677	NC_018527	CGG	2	6	3998501	3998506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15678	NC_018527	CG	4	8	3998522	3998529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15679	NC_018527	GCC	2	6	3999651	3999656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15680	NC_018527	GCA	2	6	3999691	3999696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15681	NC_018527	CGG	2	6	3999745	3999750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15682	NC_018527	CG	3	6	3999817	3999822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15683	NC_018527	CGC	3	9	3999839	3999847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15684	NC_018527	CGC	2	6	3999850	3999855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15685	NC_018527	TGCCC	2	10	3999861	3999870	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15686	NC_018527	CCA	2	6	4001487	4001492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15687	NC_018527	GAAC	2	8	4001523	4001530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15688	NC_018527	TG	3	6	4001531	4001536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15689	NC_018527	CCG	2	6	4001551	4001556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15690	NC_018527	A	6	6	4001571	4001576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15691	NC_018527	GCG	2	6	4001650	4001655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15692	NC_018527	CGG	2	6	4001679	4001684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15693	NC_018527	ACT	3	9	4001695	4001703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15694	NC_018527	ATACGT	2	12	4001712	4001723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15695	NC_018527	TAAACC	2	12	4001729	4001740	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...20212223242526272829303132Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.