MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_018518	CAG	2	6	3625510	3625515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_018518	CTG	2	6	3625535	3625540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_018518	GCG	2	6	3625575	3625580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_018518	TCCCG	2	10	3625597	3625606	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18006	NC_018518	GTG	2	6	3625670	3625675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_018518	GGC	2	6	3625708	3625713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_018518	GCT	2	6	3625733	3625738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_018518	GC	3	6	3625748	3625753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18010	NC_018518	GCG	2	6	3625772	3625777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18011	NC_018518	G	6	6	3625789	3625794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_018518	GGC	2	6	3627992	3627997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_018518	GCCG	2	8	3628016	3628023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18014	NC_018518	CGG	2	6	3628048	3628053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_018518	GCC	2	6	3628112	3628117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18016	NC_018518	GCG	2	6	3628132	3628137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_018518	TCG	2	6	3628203	3628208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_018518	CAG	2	6	3628220	3628225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_018518	TCG	2	6	3628233	3628238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_018518	CCG	2	6	3628239	3628244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18021	NC_018518	GC	3	6	3628247	3628252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18022	NC_018518	CGC	2	6	3628256	3628261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18023	NC_018518	CGGC	2	8	3628264	3628271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18024	NC_018518	GCCGC	2	10	3628285	3628294	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18025	NC_018518	GCA	2	6	3628303	3628308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18030	NC_018518	GC	3	6	3628416	3628421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18034	NC_018518	CAGGG	2	10	3628617	3628626	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18035	NC_018518	ATC	2	6	3628653	3628658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18039	NC_018518	CAGG	2	8	3628724	3628731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18042	NC_018518	TGA	2	6	3628768	3628773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18044	NC_018518	CGG	2	6	3628848	3628853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18045	NC_018518	GC	3	6	3628858	3628863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18047	NC_018518	GC	4	8	3628880	3628887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18048	NC_018518	GCA	2	6	3628891	3628896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18052	NC_018518	CGC	2	6	3628983	3628988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18055	NC_018518	TCCG	2	8	3629055	3629062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18056	NC_018518	GCCA	2	8	3629069	3629076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18057	NC_018518	CAGGC	2	10	3629085	3629094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18058	NC_018518	G	6	6	3629096	3629101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_018518	CGGT	2	8	3629111	3629118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18062	NC_018518	CG	3	6	3631232	3631237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18063	NC_018518	CGG	2	6	3631252	3631257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18081	NC_018518	GC	3	6	3639886	3639891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18082	NC_018518	GGCC	3	12	3639965	3639976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18099	NC_018518	GCCG	2	8	3643671	3643678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18100	NC_018518	GCC	2	6	3643742	3643747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18108	NC_018518	CCA	2	6	3644261	3644266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18109	NC_018518	GC	3	6	3644276	3644281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18110	NC_018518	GCTG	2	8	3644568	3644575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18111	NC_018518	CAT	2	6	3644583	3644588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18114	NC_018518	AAT	2	6	3644659	3644664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18118	NC_018518	TGA	2	6	3645172	3645177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18121	NC_018518	CG	3	6	3645365	3645370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18122	NC_018518	AAGC	2	8	3645418	3645425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18123	NC_018518	TTC	2	6	3645430	3645435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18124	NC_018518	TTC	2	6	3645625	3645630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18125	NC_018518	TCG	2	6	3645634	3645639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18126	NC_018518	CTG	2	6	3645648	3645653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18129	NC_018518	GGA	2	6	3646769	3646774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18256	NC_018518	CACG	2	8	3665168	3665175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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18258	NC_018518	ACC	2	6	3665275	3665280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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