MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_018518	CGG	2	6	3514887	3514892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17503	NC_018518	CGC	3	9	3514901	3514909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17504	NC_018518	CG	3	6	3514945	3514950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17505	NC_018518	TGA	2	6	3514957	3514962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_018518	CGC	2	6	3514964	3514969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17507	NC_018518	GC	3	6	3514968	3514973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17508	NC_018518	GGCC	2	8	3515016	3515023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17509	NC_018518	CAC	2	6	3515024	3515029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17510	NC_018518	CG	3	6	3515035	3515040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17511	NC_018518	CGC	2	6	3515066	3515071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17512	NC_018518	TCG	2	6	3515101	3515106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17513	NC_018518	CTG	2	6	3515109	3515114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17514	NC_018518	GC	3	6	3515131	3515136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17515	NC_018518	CGA	3	9	3515165	3515173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_018518	ACCT	2	8	3515241	3515248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17517	NC_018518	ACG	2	6	3515284	3515289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17518	NC_018518	CCA	2	6	3515326	3515331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17519	NC_018518	GC	3	6	3515340	3515345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17520	NC_018518	CAGCGC	2	12	3515363	3515374	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17521	NC_018518	CAG	2	6	3515387	3515392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17522	NC_018518	CCAG	2	8	3515437	3515444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17523	NC_018518	GC	4	8	3515464	3515471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17524	NC_018518	CAG	2	6	3515495	3515500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17527	NC_018518	CCG	3	9	3515596	3515604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17529	NC_018518	GCA	2	6	3515713	3515718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17530	NC_018518	GC	3	6	3515734	3515739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17534	NC_018518	CG	3	6	3515783	3515788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17535	NC_018518	GTC	2	6	3515789	3515794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17538	NC_018518	GTG	2	6	3515844	3515849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_018518	TGA	2	6	3515860	3515865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17542	NC_018518	GCA	4	12	3515932	3515943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17543	NC_018518	ACG	2	6	3515967	3515972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17544	NC_018518	GCC	2	6	3516023	3516028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17545	NC_018518	CGGCG	2	10	3516050	3516059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17546	NC_018518	CGC	2	6	3516060	3516065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17547	NC_018518	ATG	2	6	3516066	3516071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_018518	GCCG	2	8	3516072	3516079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17549	NC_018518	CGC	2	6	3516925	3516930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17550	NC_018518	CGG	2	6	3516963	3516968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17551	NC_018518	GCCGC	2	10	3516980	3516989	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17552	NC_018518	GCCCG	2	10	3516991	3517000	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17553	NC_018518	CTG	2	6	3517019	3517024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17555	NC_018518	GCCG	2	8	3517043	3517050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17556	NC_018518	GGCT	2	8	3517067	3517074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17557	NC_018518	CG	4	8	3517078	3517085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17558	NC_018518	GC	3	6	3517098	3517103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17559	NC_018518	C	7	7	3517135	3517141	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17560	NC_018518	GGCC	2	8	3517142	3517149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17561	NC_018518	CCCGA	2	10	3517153	3517162	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17562	NC_018518	GCT	2	6	3517190	3517195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_018518	CGCC	2	8	3517218	3517225	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17564	NC_018518	GC	3	6	3517249	3517254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17565	NC_018518	TGG	2	6	3517255	3517260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17567	NC_018518	CGC	2	6	3517315	3517320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17568	NC_018518	CTGG	2	8	3517364	3517371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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17573	NC_018518	TGG	2	6	3517524	3517529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17583	NC_018518	GCTG	2	8	3518099	3518106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17584	NC_018518	GC	3	6	3518129	3518134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17585	NC_018518	GCG	2	6	3518150	3518155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17598	NC_018518	ACG	2	6	3524176	3524181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17602	NC_018518	CGGC	2	8	3524263	3524270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17603	NC_018518	GC	4	8	3524310	3524317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17604	NC_018518	CGT	2	6	3524330	3524335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17608	NC_018518	GC	3	6	3524460	3524465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17609	NC_018518	GCGCG	2	10	3524482	3524491	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17610	NC_018518	TCG	2	6	3524496	3524501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17611	NC_018518	GCCCG	2	10	3524599	3524608	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17612	NC_018518	TCG	2	6	3524667	3524672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17613	NC_018518	GC	3	6	3524678	3524683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17614	NC_018518	CG	4	8	3524717	3524724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17615	NC_018518	TGCG	2	8	3524733	3524740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17616	NC_018518	GCG	2	6	3524763	3524768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17622	NC_018518	CG	3	6	3524942	3524947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17623	NC_018518	GTC	2	6	3524954	3524959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17624	NC_018518	GCCAG	2	10	3524965	3524974	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17625	NC_018518	GCCG	2	8	3524990	3524997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17626	NC_018518	TGCG	2	8	3525007	3525014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17627	NC_018518	GC	3	6	3525055	3525060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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