MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_018518	CAGGGC	2	12	3189407	3189418	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_018518	CGCC	2	8	3189487	3189494	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16003	NC_018518	GC	3	6	3189540	3189545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16004	NC_018518	GCC	2	6	3189611	3189616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16005	NC_018518	CAG	2	6	3189620	3189625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_018518	ATGC	2	8	3189729	3189736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16007	NC_018518	CG	3	6	3189740	3189745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16008	NC_018518	GCA	2	6	3189772	3189777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_018518	CAG	2	6	3189818	3189823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_018518	CCGGCG	2	12	3189831	3189842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16011	NC_018518	CGCC	2	8	3189848	3189855	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16012	NC_018518	CGC	2	6	3189858	3189863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16013	NC_018518	GCGCAG	2	12	3189866	3189877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_018518	CCG	2	6	3189948	3189953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16015	NC_018518	CG	3	6	3189952	3189957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16016	NC_018518	GCG	2	6	3189977	3189982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_018518	CGG	2	6	3190047	3190052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_018518	CGG	2	6	3190084	3190089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_018518	GGC	2	6	3190115	3190120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_018518	CGCC	2	8	3190125	3190132	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16021	NC_018518	CG	3	6	3190225	3190230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16022	NC_018518	CGG	2	6	3190287	3190292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_018518	CGGC	2	8	3190326	3190333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16024	NC_018518	CGG	2	6	3190395	3190400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_018518	GC	3	6	3190460	3190465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16026	NC_018518	TGG	2	6	3190470	3190475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_018518	GGC	2	6	3190487	3190492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_018518	GAC	2	6	3190504	3190509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_018518	ACT	2	6	3190575	3190580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_018518	CG	5	10	3190633	3190642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_018518	CGG	2	6	3190686	3190691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_018518	GC	3	6	3190706	3190711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16033	NC_018518	CGGC	2	8	3190765	3190772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16034	NC_018518	CAT	2	6	3190780	3190785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_018518	TAC	2	6	3190817	3190822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_018518	GCA	2	6	3190869	3190874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_018518	CAT	2	6	3190894	3190899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_018518	GCG	2	6	3190943	3190948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_018518	GCG	2	6	3190956	3190961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_018518	ACG	2	6	3190968	3190973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_018518	CGC	2	6	3191014	3191019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16042	NC_018518	GCC	2	6	3191053	3191058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16043	NC_018518	A	6	6	3192197	3192202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_018518	GCC	2	6	3192203	3192208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16045	NC_018518	GGC	2	6	3192218	3192223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_018518	TCC	2	6	3192268	3192273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_018518	A	8	8	3192348	3192355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_018518	CG	3	6	3192357	3192362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16049	NC_018518	CAC	2	6	3192364	3192369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16050	NC_018518	CCAGG	2	10	3192379	3192388	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16051	NC_018518	TAT	2	6	3194767	3194772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_018518	ACA	2	6	3194779	3194784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_018518	AT	3	6	3194788	3194793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_018518	ACC	2	6	3195212	3195217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16055	NC_018518	GC	3	6	3195237	3195242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16056	NC_018518	GC	3	6	3195249	3195254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16057	NC_018518	CCGG	2	8	3196261	3196268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16058	NC_018518	G	6	6	3196285	3196290	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_018518	GCCG	2	8	3196362	3196369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16060	NC_018518	GGCGC	2	10	3196383	3196392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16061	NC_018518	GCC	2	6	3196401	3196406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_018518	CG	3	6	3196436	3196441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16063	NC_018518	GC	3	6	3196446	3196451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_018518	GCC	2	6	3196455	3196460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16065	NC_018518	AGC	2	6	3196492	3196497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_018518	CG	3	6	3196509	3196514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16067	NC_018518	CCGG	2	8	3196596	3196603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16068	NC_018518	TCG	2	6	3196681	3196686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_018518	GTC	2	6	3196716	3196721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_018518	AGC	2	6	3196732	3196737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_018518	CCT	2	6	3196757	3196762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16072	NC_018518	CAGG	2	8	3196773	3196780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16073	NC_018518	GCG	2	6	3196852	3196857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_018518	CG	4	8	3196856	3196863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16075	NC_018518	GC	4	8	3196873	3196880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16076	NC_018518	GTGA	2	8	3198271	3198278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_018518	GCC	2	6	3198292	3198297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16078	NC_018518	TTA	2	6	3202475	3202480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_018518	ATA	2	6	3202506	3202511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16081	NC_018518	CGG	2	6	3202642	3202647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16082	NC_018518	GCCG	2	8	3203274	3203281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16083	NC_018518	CGGC	2	8	3203287	3203294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16084	NC_018518	TTG	2	6	3210030	3210035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16087	NC_018518	CGC	3	9	3210098	3210106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16088	NC_018518	GCCAGC	2	12	3210123	3210134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16089	NC_018518	CTG	2	6	3210165	3210170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16091	NC_018518	GAAAT	2	10	3210221	3210230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_018518	CAC	2	6	3210253	3210258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16093	NC_018518	CGTG	2	8	3210360	3210367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16094	NC_018518	GCTT	2	8	3210404	3210411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_018518	ACT	2	6	3210419	3210424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_018518	A	6	6	3210531	3210536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_018518	CG	3	6	3210591	3210596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16098	NC_018518	CG	3	6	3210599	3210604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16099	NC_018518	GCG	2	6	3210991	3210996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_018518	CAAC	2	8	3211069	3211076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16101	NC_018518	CG	4	8	3211090	3211097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16102	NC_018518	GGC	2	6	3211112	3211117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_018518	CG	3	6	3211130	3211135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16104	NC_018518	CGCA	2	8	3211173	3211180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16105	NC_018518	TCGA	2	8	3211209	3211216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16106	NC_018518	TCG	2	6	3211274	3211279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_018518	AGC	2	6	3211289	3211294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_018518	CAG	2	6	3211333	3211338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_018518	GC	3	6	3211347	3211352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16110	NC_018518	GC	3	6	3211386	3211391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16111	NC_018518	CG	3	6	3211392	3211397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16112	NC_018518	CG	3	6	3211399	3211404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16113	NC_018518	CAC	2	6	3211436	3211441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16114	NC_018518	GC	4	8	3211467	3211474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16115	NC_018518	GGCG	2	8	3211499	3211506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16116	NC_018518	CG	3	6	3211553	3211558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_018518	TCG	2	6	3211584	3211589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_018518	GATGCA	2	12	3211598	3211609	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16119	NC_018518	GAT	2	6	3211612	3211617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_018518	CG	3	6	3211627	3211632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16121	NC_018518	CG	3	6	3211636	3211641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16122	NC_018518	CAGC	2	8	3211679	3211686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16123	NC_018518	ACG	2	6	3211746	3211751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_018518	CGGCG	2	10	3211874	3211883	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16125	NC_018518	GGC	2	6	3211903	3211908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_018518	GTC	2	6	3211910	3211915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_018518	CAG	2	6	3211952	3211957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16128	NC_018518	GGC	3	9	3211958	3211966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_018518	GC	4	8	3212009	3212016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16130	NC_018518	CGCCAG	2	12	3212024	3212035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16131	NC_018518	GGCC	2	8	3212041	3212048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16132	NC_018518	CGG	2	6	3212078	3212083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16133	NC_018518	GC	5	10	3212095	3212104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16134	NC_018518	TGA	2	6	3212189	3212194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_018518	TGGC	2	8	3212216	3212223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16136	NC_018518	ATCC	2	8	3212935	3212942	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16140	NC_018518	CCG	2	6	3214149	3214154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16143	NC_018518	CGG	2	6	3214612	3214617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16145	NC_018518	CGG	2	6	3215553	3215558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16146	NC_018518	CG	3	6	3215565	3215570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16147	NC_018518	ATAG	2	8	3215574	3215581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16154	NC_018518	CGC	2	6	3215729	3215734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16165	NC_018518	CGC	2	6	3218314	3218319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16167	NC_018518	GGC	2	6	3218352	3218357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16169	NC_018518	GCG	2	6	3218372	3218377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16179	NC_018518	GC	3	6	3218791	3218796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16242	NC_018518	GCT	2	6	3225956	3225961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16245	NC_018518	CCGG	2	8	3226121	3226128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16246	NC_018518	ACG	2	6	3226152	3226157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16250	NC_018518	G	6	6	3229230	3229235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16251	NC_018518	CGG	2	6	3232263	3232268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16252	NC_018518	CGCC	2	8	3232276	3232283	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16253	NC_018518	TGA	2	6	3233278	3233283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16254	NC_018518	GTA	2	6	3233319	3233324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16255	NC_018518	CGGC	2	8	3234405	3234412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16256	NC_018518	CGC	2	6	3235329	3235334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16257	NC_018518	TCG	2	6	3235401	3235406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16258	NC_018518	GCC	2	6	3235427	3235432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16260	NC_018518	TCG	2	6	3235453	3235458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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