MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018518	CCGG	2	8	2608714	2608721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13002	NC_018518	AAGCG	2	10	2609735	2609744	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13003	NC_018518	T	6	6	2609787	2609792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_018518	GCC	2	6	2609833	2609838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_018518	AGC	2	6	2609892	2609897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_018518	ATC	2	6	2610002	2610007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_018518	TACA	2	8	2610586	2610593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13008	NC_018518	CGC	2	6	2614959	2614964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_018518	TTC	2	6	2614969	2614974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_018518	CGG	2	6	2614981	2614986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_018518	GTGC	2	8	2615053	2615060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13012	NC_018518	CCG	2	6	2615158	2615163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_018518	AGT	2	6	2615172	2615177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_018518	ATCAC	2	10	2615194	2615203	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13015	NC_018518	CGC	2	6	2615250	2615255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13016	NC_018518	GCTG	2	8	2615284	2615291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_018518	ATTG	2	8	2615331	2615338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_018518	T	6	6	2616552	2616557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_018518	GC	3	6	2617343	2617348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_018518	GC	3	6	2617357	2617362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13021	NC_018518	G	6	6	2617385	2617390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_018518	GAT	2	6	2617430	2617435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_018518	TGA	2	6	2617459	2617464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_018518	CGG	2	6	2617498	2617503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_018518	AGC	2	6	2617521	2617526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_018518	ACG	2	6	2617549	2617554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_018518	A	6	6	2617555	2617560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_018518	CCT	2	6	2617581	2617586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13029	NC_018518	GTT	2	6	2617619	2617624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_018518	GGGC	2	8	2617701	2617708	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13031	NC_018518	GC	3	6	2617713	2617718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13032	NC_018518	GC	3	6	2617737	2617742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13033	NC_018518	GCA	2	6	2617757	2617762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_018518	GAT	2	6	2617766	2617771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_018518	GAG	2	6	2617774	2617779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_018518	A	6	6	2617782	2617787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_018518	GCG	2	6	2617819	2617824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_018518	GC	3	6	2618594	2618599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_018518	CAC	2	6	2618696	2618701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_018518	CGAA	2	8	2618706	2618713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_018518	GT	3	6	2618725	2618730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_018518	GTT	2	6	2618759	2618764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_018518	CCA	2	6	2618815	2618820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_018518	GCC	2	6	2618836	2618841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_018518	GC	4	8	2618853	2618860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_018518	GCA	2	6	2618923	2618928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13048	NC_018518	GCC	4	12	2619028	2619039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_018518	GC	3	6	2619041	2619046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13050	NC_018518	GC	3	6	2619071	2619076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13051	NC_018518	GC	3	6	2619105	2619110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_018518	TGC	2	6	2619146	2619151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_018518	GAG	2	6	2619169	2619174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_018518	GGGCCG	2	12	2619179	2619190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_018518	AAAAC	2	10	2619834	2619843	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13056	NC_018518	AATC	2	8	2619852	2619859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13057	NC_018518	GC	3	6	2619885	2619890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_018518	AGA	2	6	2619926	2619931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_018518	CCGG	2	8	2621920	2621927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13060	NC_018518	G	6	6	2621944	2621949	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_018518	AGGCC	2	10	2622020	2622029	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13062	NC_018518	GGC	2	6	2622030	2622035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_018518	CG	3	6	2622054	2622059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13064	NC_018518	CGC	2	6	2622067	2622072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_018518	GC	3	6	2622076	2622081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_018518	CGA	2	6	2622116	2622121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_018518	CGC	3	9	2622173	2622181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13068	NC_018518	GCCCC	2	10	2622184	2622193	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13069	NC_018518	GCT	2	6	2622224	2622229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_018518	GGC	4	12	2622233	2622244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13073	NC_018518	GCG	2	6	2622282	2622287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_018518	GC	4	8	2622305	2622312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13075	NC_018518	TGC	2	6	2622871	2622876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13077	NC_018518	CGC	2	6	2622921	2622926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13078	NC_018518	GC	4	8	2622930	2622937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13079	NC_018518	GTG	2	6	2622938	2622943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_018518	CGC	2	6	2622988	2622993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13081	NC_018518	GCC	2	6	2623043	2623048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13084	NC_018518	GTCC	2	8	2623238	2623245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_018518	GCCC	2	8	2624442	2624449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13086	NC_018518	GCC	3	9	2624450	2624458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13087	NC_018518	C	6	6	2624457	2624462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13088	NC_018518	GCG	2	6	2626921	2626926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_018518	CG	3	6	2626925	2626930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13090	NC_018518	CGGC	2	8	2626935	2626942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13091	NC_018518	TTGTG	2	10	2629431	2629440	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_018518	GCC	2	6	2629489	2629494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_018518	CGAC	2	8	2629532	2629539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_018518	CGC	2	6	2629592	2629597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_018518	GCG	2	6	2629599	2629604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_018518	CGAT	2	8	2629628	2629635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13097	NC_018518	CCGG	2	8	2629646	2629653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_018518	CCA	2	6	2629691	2629696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13101	NC_018518	GCG	2	6	2629724	2629729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_018518	TGC	2	6	2629741	2629746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13104	NC_018518	CCG	2	6	2629882	2629887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_018518	GGT	2	6	2629908	2629913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_018518	GC	3	6	2629958	2629963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13107	NC_018518	GCC	2	6	2629999	2630004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13108	NC_018518	GGC	2	6	2630039	2630044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_018518	GC	3	6	2630102	2630107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_018518	CGG	2	6	2630108	2630113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_018518	GCT	2	6	2630172	2630177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_018518	CGC	2	6	2630201	2630206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_018518	CAG	2	6	2630226	2630231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_018518	GCCC	2	8	2630249	2630256	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13115	NC_018518	TCG	2	6	2630263	2630268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13119	NC_018518	CG	3	6	2630420	2630425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_018518	GC	3	6	2630491	2630496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_018518	C	11	11	2630496	2630506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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13124	NC_018518	GC	4	8	2630569	2630576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_018518	CCG	2	6	2630595	2630600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13127	NC_018518	CGC	2	6	2630635	2630640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_018518	GCTT	2	8	2630705	2630712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13130	NC_018518	ACG	2	6	2630729	2630734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_018518	CAT	2	6	2630783	2630788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_018518	CG	3	6	2631377	2631382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13133	NC_018518	GCG	2	6	2631386	2631391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13134	NC_018518	A	6	6	2632677	2632682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_018518	GCC	2	6	2632770	2632775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13138	NC_018518	GCC	2	6	2632847	2632852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13139	NC_018518	CG	3	6	2632853	2632858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13140	NC_018518	GCC	2	6	2632883	2632888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13143	NC_018518	GCCGC	2	10	2632968	2632977	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13144	NC_018518	CCCGAC	2	12	2633003	2633014	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
13145	NC_018518	CGCC	2	8	2633019	2633026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13146	NC_018518	GCCG	3	12	2633032	2633043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13147	NC_018518	CCG	2	6	2633111	2633116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13149	NC_018518	CG	3	6	2633151	2633156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13150	NC_018518	GCCTG	2	10	2633166	2633175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13151	NC_018518	GC	3	6	2633179	2633184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13152	NC_018518	CGC	2	6	2633208	2633213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13154	NC_018518	CG	3	6	2633258	2633263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13155	NC_018518	GCG	2	6	2633278	2633283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13157	NC_018518	GC	3	6	2633355	2633360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13161	NC_018518	CTG	2	6	2633450	2633455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13162	NC_018518	CG	4	8	2633506	2633513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13163	NC_018518	CGG	2	6	2633554	2633559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13164	NC_018518	GCC	3	9	2633574	2633582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13165	NC_018518	CTG	2	6	2633588	2633593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13166	NC_018518	TCG	2	6	2633622	2633627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13170	NC_018518	C	7	7	2633824	2633830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13171	NC_018518	CCGG	2	8	2633847	2633854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13182	NC_018518	ACGGC	2	10	2635025	2635034	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13183	NC_018518	GGCC	2	8	2635035	2635042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13245	NC_018518	GCCG	2	8	2645358	2645365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13246	NC_018518	GGC	2	6	2645412	2645417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13251	NC_018518	TGGCG	2	10	2645579	2645588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13252	NC_018518	CAG	2	6	2645592	2645597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13254	NC_018518	GCC	2	6	2645733	2645738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13255	NC_018518	GCA	2	6	2645741	2645746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13256	NC_018518	CGG	2	6	2645786	2645791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13257	NC_018518	GCC	2	6	2645916	2645921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13258	NC_018518	CGGCG	2	10	2645960	2645969	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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13260	NC_018518	GC	3	6	2646030	2646035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13384	NC_018518	CCGG	2	8	2667051	2667058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13385	NC_018518	ACA	2	6	2667163	2667168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13387	NC_018518	GTC	2	6	2667213	2667218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13388	NC_018518	ACG	2	6	2667229	2667234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13389	NC_018518	CGG	2	6	2667284	2667289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13390	NC_018518	GCA	2	6	2667304	2667309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13391	NC_018518	TCA	2	6	2667331	2667336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13392	NC_018518	GAACTG	2	12	2667342	2667353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13393	NC_018518	ACTG	2	8	2667391	2667398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13394	NC_018518	G	6	6	2667437	2667442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13395	NC_018518	GC	4	8	2671238	2671245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13500	NC_018518	GC	3	6	2685044	2685049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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