MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018518	CCG	2	6	2271528	2271533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11502	NC_018518	CAC	2	6	2272670	2272675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11503	NC_018518	GCAC	2	8	2272687	2272694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11504	NC_018518	CAC	2	6	2272705	2272710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_018518	GTT	2	6	2273619	2273624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_018518	CCG	2	6	2273630	2273635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_018518	GTA	3	9	2275419	2275427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_018518	ACT	2	6	2275434	2275439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_018518	GCC	2	6	2275469	2275474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11510	NC_018518	CCG	2	6	2275526	2275531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11511	NC_018518	CGCA	2	8	2275532	2275539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11512	NC_018518	CCCT	2	8	2275543	2275550	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11513	NC_018518	AGGAG	2	10	2276766	2276775	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_018518	GGA	2	6	2277975	2277980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_018518	CGG	2	6	2279407	2279412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_018518	CGGC	2	8	2280949	2280956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11517	NC_018518	CGGCG	2	10	2280984	2280993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11518	NC_018518	TAC	2	6	2282457	2282462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_018518	GC	3	6	2282473	2282478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11520	NC_018518	CGGC	2	8	2282491	2282498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11521	NC_018518	CGC	2	6	2282509	2282514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_018518	CGC	2	6	2282521	2282526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11523	NC_018518	CGC	2	6	2282531	2282536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_018518	CCTCGT	2	12	2282583	2282594	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11525	NC_018518	TCG	2	6	2282609	2282614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_018518	ATG	2	6	2282657	2282662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_018518	CG	3	6	2282672	2282677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_018518	CAG	2	6	2282701	2282706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_018518	AC	3	6	2282718	2282723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11530	NC_018518	GC	3	6	2282811	2282816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_018518	CAG	2	6	2282830	2282835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_018518	GC	3	6	2282960	2282965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11533	NC_018518	CGC	3	9	2282963	2282971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_018518	GCG	3	9	2282979	2282987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_018518	TCT	2	6	2282988	2282993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_018518	CCGGGC	2	12	2283075	2283086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11537	NC_018518	GCC	2	6	2283118	2283123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11538	NC_018518	GAT	2	6	2283187	2283192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_018518	TGC	2	6	2283216	2283221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_018518	GTT	2	6	2283314	2283319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_018518	TAC	2	6	2286062	2286067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_018518	CCGG	2	8	2287034	2287041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_018518	G	6	6	2287058	2287063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_018518	CGC	2	6	2288231	2288236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_018518	CAC	2	6	2288282	2288287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11546	NC_018518	TCGG	2	8	2288756	2288763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_018518	GC	3	6	2288827	2288832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11548	NC_018518	CG	3	6	2288915	2288920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_018518	GAA	2	6	2288934	2288939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_018518	GC	3	6	2288967	2288972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11551	NC_018518	GTC	2	6	2288976	2288981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_018518	CAC	2	6	2288991	2288996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11553	NC_018518	GCC	2	6	2289003	2289008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_018518	CCA	2	6	2289014	2289019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_018518	AGC	2	6	2289125	2289130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_018518	CAGC	3	12	2289127	2289138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_018518	CAC	2	6	2289141	2289146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11558	NC_018518	GC	3	6	2289240	2289245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11559	NC_018518	CGCCGG	2	12	2289267	2289278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_018518	CG	3	6	2289299	2289304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11561	NC_018518	GCCGC	2	10	2289305	2289314	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11562	NC_018518	CGG	2	6	2291268	2291273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_018518	C	7	7	2294068	2294074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11564	NC_018518	CCGG	2	8	2294091	2294098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11565	NC_018518	TG	3	6	2294177	2294182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_018518	GC	3	6	2294366	2294371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_018518	CAGC	2	8	2294394	2294401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_018518	GCCG	2	8	2294455	2294462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_018518	GGT	2	6	2294467	2294472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11571	NC_018518	AAG	2	6	2294519	2294524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_018518	CTTCGT	2	12	2294599	2294610	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_018518	CGA	2	6	2294656	2294661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_018518	CTA	2	6	2294704	2294709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_018518	CGC	2	6	2294779	2294784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_018518	CCA	2	6	2294971	2294976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11577	NC_018518	GC	3	6	2294986	2294991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11578	NC_018518	TCGA	2	8	2295053	2295060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11579	NC_018518	GC	3	6	2295106	2295111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11580	NC_018518	CAC	2	6	2295142	2295147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11583	NC_018518	GGCCT	2	10	2295218	2295227	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11584	NC_018518	TCG	2	6	2295276	2295281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11589	NC_018518	GCG	2	6	2295364	2295369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11593	NC_018518	GC	3	6	2295445	2295450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_018518	ACG	2	6	2295516	2295521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11597	NC_018518	CGG	2	6	2295558	2295563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_018518	CGCTG	2	10	2295573	2295582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11599	NC_018518	GC	3	6	2295629	2295634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_018518	CGA	2	6	2295676	2295681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11604	NC_018518	AAT	2	6	2298205	2298210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11607	NC_018518	GC	3	6	2298245	2298250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11608	NC_018518	GCCG	2	8	2298255	2298262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11609	NC_018518	CGC	2	6	2298266	2298271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11610	NC_018518	T	6	6	2298298	2298303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_018518	CCGG	2	8	2300015	2300022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11612	NC_018518	G	6	6	2300039	2300044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_018518	AGAA	2	8	2300580	2300587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11624	NC_018518	GC	3	6	2304678	2304683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11625	NC_018518	CCT	2	6	2304684	2304689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11628	NC_018518	GCGATG	2	12	2304755	2304766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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11630	NC_018518	GTG	2	6	2304821	2304826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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