MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_018518	GCA	2	6	2198785	2198790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_018518	GC	3	6	2198809	2198814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_018518	GGC	2	6	2198880	2198885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_018518	GGC	2	6	2198896	2198901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_018518	GC	3	6	2198900	2198905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_018518	TCG	2	6	2198925	2198930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11009	NC_018518	CAC	2	6	2198963	2198968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_018518	CG	3	6	2198977	2198982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_018518	GCC	2	6	2198989	2198994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11012	NC_018518	GGC	2	6	2199000	2199005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_018518	GCA	2	6	2199020	2199025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_018518	GC	4	8	2199049	2199056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_018518	GGC	2	6	2199062	2199067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11018	NC_018518	GCCGC	2	10	2199149	2199158	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11019	NC_018518	GGC	2	6	2199163	2199168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11022	NC_018518	GC	3	6	2199243	2199248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_018518	GCG	2	6	2199254	2199259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11062	NC_018518	GC	4	8	2206908	2206915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_018518	GCCG	2	8	2206972	2206979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_018518	AAG	2	6	2206991	2206996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11077	NC_018518	GC	3	6	2207253	2207258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_018518	GCCAG	2	10	2207272	2207281	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11079	NC_018518	CCA	2	6	2207284	2207289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11088	NC_018518	GC	3	6	2212529	2212534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11092	NC_018518	GC	3	6	2212646	2212651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11093	NC_018518	GCGTG	2	10	2212674	2212683	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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11099	NC_018518	GCC	2	6	2212796	2212801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11101	NC_018518	GGT	2	6	2212819	2212824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_018518	GGCGC	2	10	2212848	2212857	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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11106	NC_018518	CTG	2	6	2213003	2213008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11108	NC_018518	CGCC	2	8	2213032	2213039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11109	NC_018518	GCG	2	6	2213046	2213051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_018518	CCGG	2	8	2214003	2214010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11111	NC_018518	GC	3	6	2214104	2214109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11112	NC_018518	CGC	2	6	2214116	2214121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_018518	GCG	2	6	2214126	2214131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_018518	CGG	2	6	2214144	2214149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11116	NC_018518	TGGCGC	2	12	2214203	2214214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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11121	NC_018518	GCT	2	6	2214348	2214353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11123	NC_018518	CTG	2	6	2214391	2214396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_018518	GCCGCG	2	12	2214397	2214408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11125	NC_018518	GC	3	6	2214415	2214420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11126	NC_018518	CTGGC	2	10	2214439	2214448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11127	NC_018518	CGCTGG	2	12	2214464	2214475	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_018518	TGGC	2	8	2214493	2214500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11129	NC_018518	TGC	2	6	2214512	2214517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_018518	GCG	2	6	2214555	2214560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_018518	CGC	2	6	2214573	2214578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11132	NC_018518	CGC	3	9	2214582	2214590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11133	NC_018518	CG	3	6	2214757	2214762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11134	NC_018518	CAT	2	6	2214829	2214834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11135	NC_018518	TCTTT	2	10	2214854	2214863	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11136	NC_018518	TGA	2	6	2214875	2214880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11137	NC_018518	GCAA	2	8	2214898	2214905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11138	NC_018518	CAT	2	6	2214945	2214950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11139	NC_018518	TGTGG	2	10	2214954	2214963	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11140	NC_018518	TCG	2	6	2214968	2214973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11141	NC_018518	ATTG	2	8	2214990	2214997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11142	NC_018518	CGG	2	6	2215095	2215100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11143	NC_018518	GTG	2	6	2215129	2215134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_018518	GCC	2	6	2215174	2215179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11145	NC_018518	GGT	2	6	2215200	2215205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11146	NC_018518	GGC	2	6	2215212	2215217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11147	NC_018518	CAG	2	6	2215245	2215250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11149	NC_018518	TTC	2	6	2215324	2215329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11150	NC_018518	TTC	2	6	2215378	2215383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11151	NC_018518	CAA	2	6	2215422	2215427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11152	NC_018518	GTG	2	6	2215497	2215502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11153	NC_018518	CTT	2	6	2215524	2215529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11154	NC_018518	ATG	2	6	2215551	2215556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11155	NC_018518	GGCC	2	8	2215577	2215584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11156	NC_018518	CTG	2	6	2215665	2215670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11157	NC_018518	CTG	2	6	2215725	2215730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11158	NC_018518	GGC	2	6	2215743	2215748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11159	NC_018518	CAT	2	6	2215760	2215765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11160	NC_018518	CCGAT	2	10	2215798	2215807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11161	NC_018518	GAT	2	6	2215865	2215870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11162	NC_018518	GC	3	6	2215936	2215941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11163	NC_018518	GAT	2	6	2215955	2215960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11164	NC_018518	TAC	2	6	2215977	2215982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11166	NC_018518	GC	3	6	2216024	2216029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11167	NC_018518	CCA	2	6	2216053	2216058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11168	NC_018518	GTG	2	6	2216064	2216069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11169	NC_018518	CGC	2	6	2216078	2216083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11171	NC_018518	CCG	3	9	2216128	2216136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11172	NC_018518	TCG	2	6	2216158	2216163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11173	NC_018518	CG	3	6	2216176	2216181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11174	NC_018518	TAC	2	6	2216187	2216192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11176	NC_018518	GCG	2	6	2216227	2216232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11177	NC_018518	GCGCG	2	10	2216267	2216276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11178	NC_018518	CG	4	8	2216273	2216280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11179	NC_018518	CG	3	6	2216316	2216321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11180	NC_018518	CGG	2	6	2216341	2216346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11186	NC_018518	CGGC	2	8	2217323	2217330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11187	NC_018518	GGT	2	6	2217333	2217338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11188	NC_018518	TGG	2	6	2217400	2217405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11189	NC_018518	CTG	2	6	2217418	2217423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11191	NC_018518	AAGCAG	2	12	2217514	2217525	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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11195	NC_018518	GCA	2	6	2217674	2217679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11197	NC_018518	CGG	2	6	2217717	2217722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11198	NC_018518	ATC	2	6	2217733	2217738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11200	NC_018518	GATC	2	8	2217792	2217799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11201	NC_018518	TGGC	2	8	2217806	2217813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11202	NC_018518	TACG	2	8	2217826	2217833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11203	NC_018518	ACT	2	6	2217896	2217901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11205	NC_018518	CGA	2	6	2217963	2217968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11207	NC_018518	GCT	2	6	2218077	2218082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11211	NC_018518	CGGC	2	8	2218174	2218181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11212	NC_018518	CGG	2	6	2218190	2218195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11214	NC_018518	GCCC	2	8	2219775	2219782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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11221	NC_018518	TCC	2	6	2221673	2221678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11222	NC_018518	GC	4	8	2223375	2223382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11223	NC_018518	GC	3	6	2224502	2224507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11224	NC_018518	GC	3	6	2224538	2224543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11225	NC_018518	CGGC	2	8	2224560	2224567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11226	NC_018518	CCGG	2	8	2224664	2224671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11227	NC_018518	GCCC	2	8	2226259	2226266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11228	NC_018518	CG	3	6	2226277	2226282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11229	NC_018518	G	6	6	2226304	2226309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_018518	CGG	2	6	2226371	2226376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11231	NC_018518	TGC	2	6	2226441	2226446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11233	NC_018518	T	6	6	2226460	2226465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11234	NC_018518	CGG	2	6	2226480	2226485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11235	NC_018518	A	9	9	2226487	2226495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_018518	GCGGG	2	10	2226557	2226566	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11237	NC_018518	CGC	2	6	2226567	2226572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11238	NC_018518	CGG	2	6	2227936	2227941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11239	NC_018518	GA	3	6	2227963	2227968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11240	NC_018518	TGC	2	6	2227980	2227985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11241	NC_018518	TA	3	6	2228008	2228013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11242	NC_018518	TA	3	6	2228026	2228031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11243	NC_018518	AGT	2	6	2228042	2228047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_018518	TTG	2	6	2228079	2228084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11245	NC_018518	A	7	7	2228154	2228160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11246	NC_018518	CAT	2	6	2228190	2228195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11247	NC_018518	GCG	2	6	2229056	2229061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11248	NC_018518	CAG	2	6	2229086	2229091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11249	NC_018518	GGC	4	12	2229092	2229103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11250	NC_018518	ACGCC	2	10	2229106	2229115	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11251	NC_018518	AGC	2	6	2229153	2229158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11252	NC_018518	CCGAC	2	10	2229184	2229193	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11253	NC_018518	CGG	2	6	2229252	2229257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11254	NC_018518	CG	3	6	2229268	2229273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11255	NC_018518	GCC	2	6	2229279	2229284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11256	NC_018518	ACC	2	6	2229312	2229317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11258	NC_018518	ACCCA	2	10	2229339	2229348	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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11388	NC_018518	TGTC	2	8	2249288	2249295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11500	NC_018518	CACG	2	8	2271500	2271507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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