MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_018518	GAGGGG	2	12	2085977	2085988	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_018518	GTG	2	6	2085989	2085994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_018518	TGC	2	6	2086041	2086046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_018518	GGC	2	6	2086051	2086056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_018518	GCC	2	6	2086120	2086125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_018518	GCA	2	6	2086165	2086170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_018518	TGC	2	6	2086212	2086217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_018518	GGC	2	6	2086222	2086227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_018518	GCC	2	6	2086291	2086296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_018518	CGTG	2	8	2086300	2086307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10511	NC_018518	CGC	2	6	2086356	2086361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10512	NC_018518	GCG	2	6	2092488	2092493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_018518	CG	3	6	2092492	2092497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_018518	GCG	2	6	2092516	2092521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_018518	CCAG	2	8	2092595	2092602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10516	NC_018518	GCG	2	6	2092617	2092622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_018518	GGC	2	6	2092647	2092652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_018518	CGT	2	6	2093889	2093894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_018518	GTA	2	6	2093907	2093912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_018518	CGG	2	6	2093926	2093931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_018518	CGGC	2	8	2094076	2094083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10522	NC_018518	ACGCGC	2	12	2094092	2094103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_018518	CCGC	2	8	2094119	2094126	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10524	NC_018518	CCT	2	6	2094161	2094166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10525	NC_018518	TGG	2	6	2094177	2094182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_018518	CGT	2	6	2094288	2094293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_018518	CGC	2	6	2094303	2094308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_018518	CGCGC	2	10	2094322	2094331	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10529	NC_018518	GC	3	6	2094376	2094381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10530	NC_018518	T	6	6	2094502	2094507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_018518	CAA	2	6	2094533	2094538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_018518	CAT	2	6	2094567	2094572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_018518	CG	4	8	2094587	2094594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10534	NC_018518	CTGGCG	2	12	2094616	2094627	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_018518	GC	3	6	2094632	2094637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10536	NC_018518	CGGC	2	8	2096109	2096116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10537	NC_018518	GC	4	8	2096126	2096133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10538	NC_018518	CGGC	2	8	2096134	2096141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10539	NC_018518	GCCG	2	8	2096763	2096770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10540	NC_018518	CGA	2	6	2096795	2096800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10542	NC_018518	GGT	2	6	2096824	2096829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_018518	GCG	2	6	2096851	2096856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_018518	GGC	2	6	2098295	2098300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_018518	CGG	2	6	2098324	2098329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_018518	GCG	2	6	2099255	2099260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_018518	TGCAA	2	10	2099266	2099275	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10548	NC_018518	CAA	2	6	2099280	2099285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_018518	TGC	2	6	2102961	2102966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_018518	GCA	2	6	2102981	2102986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_018518	CGC	2	6	2103001	2103006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_018518	GCG	2	6	2103018	2103023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_018518	CAT	2	6	2104656	2104661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_018518	GC	3	6	2104671	2104676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_018518	GCC	2	6	2104695	2104700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_018518	CG	3	6	2104720	2104725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10557	NC_018518	GC	4	8	2104727	2104734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10558	NC_018518	CCT	2	6	2106219	2106224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_018518	CG	4	8	2106227	2106234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_018518	GGC	2	6	2107048	2107053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_018518	CCTG	2	8	2107970	2107977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10562	NC_018518	CTG	2	6	2107996	2108001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_018518	ACG	2	6	2108003	2108008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_018518	GGC	2	6	2108989	2108994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_018518	AGG	2	6	2108999	2109004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_018518	GCCC	2	8	2109059	2109066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10567	NC_018518	CGC	2	6	2109067	2109072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10568	NC_018518	CGTG	2	8	2110137	2110144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10569	NC_018518	CGGC	2	8	2110196	2110203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10570	NC_018518	GC	3	6	2112974	2112979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10571	NC_018518	GGC	2	6	2113043	2113048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_018518	GCG	2	6	2113115	2113120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_018518	CGCA	2	8	2113122	2113129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10574	NC_018518	CG	3	6	2113132	2113137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10575	NC_018518	CG	3	6	2113148	2113153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10578	NC_018518	CGC	2	6	2114538	2114543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10579	NC_018518	A	6	6	2114554	2114559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_018518	CG	3	6	2114563	2114568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10581	NC_018518	GCG	2	6	2114578	2114583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_018518	CCCG	2	8	2115517	2115524	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10583	NC_018518	CG	3	6	2115523	2115528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10584	NC_018518	CGG	2	6	2115564	2115569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10585	NC_018518	GCC	2	6	2115644	2115649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10586	NC_018518	A	6	6	2116173	2116178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_018518	CG	3	6	2116188	2116193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10588	NC_018518	GCGG	3	12	2116207	2116218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10589	NC_018518	GCGCC	2	10	2116225	2116234	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10590	NC_018518	CGC	2	6	2116238	2116243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10591	NC_018518	CCT	2	6	2117317	2117322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10592	NC_018518	CTG	2	6	2117353	2117358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_018518	GAAA	2	8	2117383	2117390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_018518	CGGC	2	8	2118055	2118062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10595	NC_018518	GC	3	6	2118061	2118066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10596	NC_018518	C	6	6	2118115	2118120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10598	NC_018518	AATG	2	8	2118144	2118151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_018518	TCGCG	2	10	2118192	2118201	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10600	NC_018518	CGC	2	6	2118204	2118209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10601	NC_018518	GCC	2	6	2118246	2118251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10602	NC_018518	CG	3	6	2119402	2119407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10603	NC_018518	CAGG	2	8	2119415	2119422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10604	NC_018518	TGCCC	2	10	2119475	2119484	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10605	NC_018518	GCCG	2	8	2119527	2119534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10606	NC_018518	ACC	2	6	2119551	2119556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10607	NC_018518	ACG	2	6	2120802	2120807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_018518	GC	5	10	2120812	2120821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10609	NC_018518	GC	4	8	2120834	2120841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_018518	GAG	2	6	2121380	2121385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_018518	CGC	2	6	2121721	2121726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10612	NC_018518	CCGCG	2	10	2121727	2121736	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10613	NC_018518	AGC	2	6	2121743	2121748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_018518	CCG	2	6	2122966	2122971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10615	NC_018518	ATT	2	6	2123445	2123450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_018518	TGAT	2	8	2123472	2123479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_018518	TCC	2	6	2123551	2123556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10618	NC_018518	CTT	2	6	2123579	2123584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_018518	CA	3	6	2123629	2123634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10620	NC_018518	CCGG	2	8	2124589	2124596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10621	NC_018518	G	7	7	2124613	2124619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_018518	GCC	2	6	2124713	2124718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10623	NC_018518	GCCC	2	8	2124748	2124755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10624	NC_018518	GC	3	6	2124779	2124784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10625	NC_018518	CAG	2	6	2124796	2124801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_018518	GCA	2	6	2124816	2124821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10627	NC_018518	CCAG	2	8	2124828	2124835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10628	NC_018518	GC	3	6	2124854	2124859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10629	NC_018518	CGG	2	6	2124874	2124879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10631	NC_018518	CGC	2	6	2124907	2124912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10755	NC_018518	AAG	2	6	2149859	2149864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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