MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018518	CGCCA	2	10	126359	126368	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
502	NC_018518	CG	4	8	126387	126394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_018518	GGCC	2	8	126402	126409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_018518	ACC	2	6	126428	126433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_018518	GCA	2	6	126549	126554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_018518	GGA	2	6	126555	126560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018518	GCA	3	9	126570	126578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_018518	GC	3	6	126579	126584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_018518	GCC	2	6	126587	126592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_018518	CGG	2	6	126636	126641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_018518	TGCA	2	8	126653	126660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_018518	GGC	2	6	126724	126729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_018518	CGT	2	6	126819	126824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018518	GC	4	8	126888	126895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_018518	GCC	2	6	126926	126931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_018518	GCCG	2	8	126946	126953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_018518	GCG	2	6	126984	126989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_018518	CGG	2	6	126990	126995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_018518	CGC	2	6	127041	127046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_018518	CGA	2	6	127048	127053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018518	CAG	2	6	127063	127068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_018518	CGC	2	6	127092	127097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_018518	GC	3	6	127096	127101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_018518	CAGG	2	8	127102	127109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_018518	GTA	2	6	127174	127179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018518	GCG	2	6	127242	127247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018518	CATCG	2	10	127261	127270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
528	NC_018518	GT	3	6	127353	127358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018518	GCG	2	6	128294	128299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018518	GAA	2	6	128431	128436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018518	GAA	2	6	128464	128469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018518	CAG	2	6	128491	128496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_018518	ACC	2	6	128519	128524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_018518	GCA	2	6	128529	128534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_018518	CAC	2	6	128599	128604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_018518	GGT	2	6	128610	128615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018518	GCA	2	6	128649	128654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_018518	GGT	2	6	128658	128663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018518	CGT	2	6	128679	128684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_018518	CACCAG	2	12	128692	128703	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
541	NC_018518	CGA	2	6	128712	128717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018518	CGG	2	6	128730	128735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_018518	CGT	2	6	128736	128741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_018518	GCCCA	2	10	128750	128759	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
545	NC_018518	GGAC	2	8	128805	128812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_018518	GGA	2	6	128823	128828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018518	CGC	2	6	128834	128839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_018518	CGGC	2	8	128872	128879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_018518	GGGC	2	8	128889	128896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
550	NC_018518	CAG	2	6	128911	128916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_018518	AAC	2	6	128933	128938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_018518	GAA	2	6	128953	128958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018518	CGGG	2	8	129060	129067	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
554	NC_018518	A	6	6	129075	129080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018518	CAGG	2	8	129126	129133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
556	NC_018518	GC	3	6	129174	129179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_018518	CGC	2	6	129220	129225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_018518	CTTGGC	2	12	129302	129313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_018518	CGC	2	6	129349	129354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_018518	GCCG	2	8	129403	129410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_018518	CTG	2	6	129467	129472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_018518	TCG	2	6	129475	129480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_018518	GCA	2	6	129487	129492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018518	GCG	2	6	129610	129615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_018518	CGCC	2	8	129670	129677	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
566	NC_018518	CG	3	6	129683	129688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_018518	GCC	2	6	129692	129697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_018518	GCC	2	6	129728	129733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_018518	CG	3	6	129753	129758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_018518	ACG	2	6	129829	129834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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572	NC_018518	GTCG	2	8	129902	129909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_018518	CG	3	6	129943	129948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_018518	CG	3	6	130088	130093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_018518	CGGC	2	8	130102	130109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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599	NC_018518	CGG	2	6	131014	131019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_018518	ACC	2	6	131085	131090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_018518	CG	3	6	131129	131134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_018518	GCGACG	2	12	131164	131175	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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610	NC_018518	CCCG	2	8	131398	131405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
611	NC_018518	CGGCG	2	10	131486	131495	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
612	NC_018518	CCA	4	12	131515	131526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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620	NC_018518	GCCG	2	8	131798	131805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_018518	GC	3	6	131850	131855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_018518	GCC	3	9	131867	131875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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626	NC_018518	GC	4	8	132048	132055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_018518	GCCG	2	8	132080	132087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_018518	GCC	2	6	132101	132106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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632	NC_018518	CCGTC	2	10	132133	132142	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
633	NC_018518	GC	3	6	132343	132348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_018518	CCGG	2	8	132502	132509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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638	NC_018518	AGC	2	6	133659	133664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_018518	CGA	2	6	133678	133683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_018518	GGA	2	6	133718	133723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_018518	GCCG	2	8	133737	133744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_018518	CGCGC	2	10	133758	133767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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644	NC_018518	CTG	2	6	133791	133796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_018518	CGC	2	6	139105	139110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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652	NC_018518	CG	3	6	139235	139240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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655	NC_018518	A	9	9	139291	139299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_018518	GC	3	6	141088	141093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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665	NC_018518	CG	3	6	141164	141169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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672	NC_018518	CTT	2	6	144577	144582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_018518	CG	3	6	144911	144916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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915	NC_018518	AGC	2	6	222015	222020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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917	NC_018518	GCG	2	6	222087	222092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
918	NC_018518	GCT	2	6	222132	222137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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922	NC_018518	GC	3	6	222212	222217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
923	NC_018518	GCCA	2	8	222221	222228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
924	NC_018518	TGG	2	6	222237	222242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
925	NC_018518	TGG	2	6	222318	222323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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933	NC_018518	GC	3	6	224122	224127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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935	NC_018518	TCC	2	6	228110	228115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
936	NC_018518	GGT	2	6	228116	228121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
937	NC_018518	CAC	2	6	228132	228137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
938	NC_018518	CG	3	6	228138	228143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
939	NC_018518	CTG	2	6	228209	228214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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942	NC_018518	CCG	2	6	229339	229344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
943	NC_018518	CTG	2	6	229356	229361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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945	NC_018518	GCC	2	6	229857	229862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
946	NC_018518	CCGG	2	8	232637	232644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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949	NC_018518	GGC	2	6	234717	234722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
950	NC_018518	GGC	2	6	234754	234759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
951	NC_018518	CGGG	2	8	234796	234803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
952	NC_018518	CGGCT	2	10	234836	234845	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
953	NC_018518	AGC	2	6	235005	235010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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955	NC_018518	CCG	2	6	235274	235279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
956	NC_018518	GC	5	10	235281	235290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
957	NC_018518	CGG	2	6	235318	235323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
958	NC_018518	TGC	3	9	235324	235332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
959	NC_018518	GC	3	6	235346	235351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
960	NC_018518	TGC	2	6	235366	235371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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965	NC_018518	T	6	6	235424	235429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
966	NC_018518	GCCG	2	8	236840	236847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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971	NC_018518	CGG	2	6	247438	247443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
972	NC_018518	GC	3	6	247446	247451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
973	NC_018518	GCC	2	6	248259	248264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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992	NC_018518	CCG	2	6	253632	253637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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998	NC_018518	CGCT	2	8	253816	253823	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
999	NC_018518	TCA	2	6	253830	253835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1000	NC_018518	GAC	2	6	253838	253843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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