MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 19960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018518	CGCC	2	8	1139687	1139694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5502	NC_018518	GCC	2	6	1139716	1139721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_018518	CTG	2	6	1139763	1139768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_018518	GCG	2	6	1139800	1139805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_018518	CTG	2	6	1139835	1139840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_018518	GTG	2	6	1139871	1139876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_018518	GC	3	6	1139886	1139891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_018518	GCA	2	6	1139900	1139905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_018518	GCGCAG	2	12	1139940	1139951	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_018518	GCCG	2	8	1139958	1139965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_018518	CTG	2	6	1139966	1139971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_018518	CGG	3	9	1139972	1139980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_018518	CAG	2	6	1139997	1140002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_018518	GGGC	2	8	1140008	1140015	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_018518	GC	3	6	1140022	1140027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_018518	AGC	2	6	1140028	1140033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_018518	CGG	2	6	1140041	1140046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_018518	GGC	2	6	1140059	1140064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_018518	GC	3	6	1140063	1140068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_018518	CTG	2	6	1140117	1140122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_018518	TGCAGC	2	12	1140145	1140156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_018518	GCC	2	6	1140157	1140162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_018518	GC	3	6	1140163	1140168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_018518	CGA	2	6	1140185	1140190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_018518	GGC	2	6	1140221	1140226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_018518	CAT	2	6	1140250	1140255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_018518	ACC	2	6	1140340	1140345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_018518	GCGCCG	2	12	1140380	1140391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_018518	CGC	3	9	1140436	1140444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_018518	GC	3	6	1140448	1140453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_018518	GC	3	6	1140503	1140508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_018518	CG	3	6	1140534	1140539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_018518	GC	3	6	1140544	1140549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_018518	GGC	2	6	1140591	1140596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_018518	GCC	3	9	1140606	1140614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_018518	CGC	2	6	1140627	1140632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_018518	GGGCC	2	10	1140636	1140645	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5538	NC_018518	TA	4	8	1140675	1140682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_018518	AGAA	2	8	1140683	1140690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_018518	TCC	2	6	1140696	1140701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_018518	CG	3	6	1140736	1140741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_018518	C	6	6	1140746	1140751	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5543	NC_018518	GCC	3	9	1140767	1140775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_018518	GCG	2	6	1140791	1140796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_018518	AGG	2	6	1140930	1140935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_018518	GCA	2	6	1140941	1140946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_018518	GGGC	2	8	1140955	1140962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_018518	GTT	2	6	1141004	1141009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_018518	ACG	2	6	1141012	1141017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5551	NC_018518	CTT	2	6	1141228	1141233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_018518	CTG	3	9	1141249	1141257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_018518	AAC	2	6	1141311	1141316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_018518	GGT	2	6	1141348	1141353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_018518	GTC	2	6	1141361	1141366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_018518	AAAGC	2	10	1141371	1141380	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5557	NC_018518	TGAA	2	8	1141397	1141404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_018518	T	6	6	1141411	1141416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_018518	CA	4	8	1141469	1141476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_018518	GCA	2	6	1141551	1141556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_018518	TGG	2	6	1141569	1141574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_018518	TGG	2	6	1141729	1141734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_018518	CGA	2	6	1141753	1141758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_018518	GAC	2	6	1141778	1141783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_018518	GCA	2	6	1141827	1141832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_018518	GAAA	2	8	1141922	1141929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_018518	CAG	2	6	1141995	1142000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_018518	GAAA	2	8	1142069	1142076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_018518	GT	3	6	1142132	1142137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_018518	GGA	2	6	1142186	1142191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5573	NC_018518	TACC	2	8	1142457	1142464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_018518	TGC	2	6	1142526	1142531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5576	NC_018518	TCGTG	2	10	1142547	1142556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5577	NC_018518	GGA	2	6	1142645	1142650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5584	NC_018518	GCT	2	6	1143082	1143087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_018518	CCA	2	6	1143278	1143283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_018518	GA	3	6	1143325	1143330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_018518	TAG	2	6	1143434	1143439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_018518	GC	3	6	1143513	1143518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_018518	TGG	2	6	1143619	1143624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5598	NC_018518	GCGA	2	8	1143842	1143849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_018518	G	6	6	1144002	1144007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5602	NC_018518	GGA	2	6	1144319	1144324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_018518	TC	3	6	1144405	1144410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_018518	AAC	2	6	1144573	1144578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5610	NC_018518	GCT	2	6	1144820	1144825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5612	NC_018518	G	6	6	1145012	1145017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_018518	TCA	2	6	1145033	1145038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5616	NC_018518	GA	3	6	1145236	1145241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_018518	GC	3	6	1145316	1145321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_018518	TTA	2	6	1145363	1145368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5623	NC_018518	GTTT	2	8	1145758	1145765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5627	NC_018518	CGG	2	6	1146059	1146064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_018518	CTCAT	2	10	1146086	1146095	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5629	NC_018518	CGT	2	6	1146167	1146172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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