MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 1090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018516	CT	3	6	160863	160868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_018516	TTTAT	2	10	160894	160903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018516	CCT	2	6	161390	161395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_018516	CCT	2	6	161578	161583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_018516	TAC	2	6	161671	161676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_018516	TTTCTT	2	12	161704	161715	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_018516	TAA	2	6	161728	161733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018516	CAT	2	6	161734	161739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_018516	CTTA	2	8	161750	161757	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_018516	CTA	2	6	161777	161782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_018516	TAC	2	6	161841	161846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_018516	TAA	2	6	161861	161866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018516	TAC	2	6	162741	162746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018516	CT	3	6	163129	163134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_018516	TCA	2	6	163525	163530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_018516	CTTT	2	8	163533	163540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_018516	TCC	2	6	164793	164798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_018516	CCT	2	6	165193	165198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_018516	TACC	2	8	165515	165522	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_018516	TCC	2	6	165933	165938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_018516	CTTT	2	8	165962	165969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_018516	AC	3	6	165993	165998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_018516	TTTC	2	8	166022	166029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_018516	TA	3	6	166047	166052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018516	CTT	2	6	166099	166104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018516	TAC	2	6	166108	166113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018516	TAT	2	6	166116	166121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018516	TTC	2	6	166131	166136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_018516	AGT	2	6	166145	166150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018516	TTTG	2	8	166165	166172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018516	A	6	6	166176	166181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018516	ACAAA	2	10	166401	166410	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
533	NC_018516	TAA	2	6	166423	166428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018516	TCC	2	6	167316	167321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_018516	TA	3	6	167750	167755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018516	A	6	6	167755	167760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018516	AGT	2	6	167767	167772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018516	CCT	2	6	168823	168828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_018516	TC	3	6	169164	169169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_018516	TTA	2	6	169183	169188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018516	TC	3	6	169246	169251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_018516	TC	3	6	169254	169259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_018516	TACTTT	2	12	169260	169271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
544	NC_018516	ACC	2	6	171372	171377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_018516	TTG	2	6	172202	172207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018516	TA	3	6	173096	173101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018516	CCT	2	6	174469	174474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_018516	AAT	2	6	174495	174500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018516	TACT	2	8	174505	174512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_018516	TC	3	6	175906	175911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_018516	GTA	2	6	176590	176595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018516	ACC	2	6	180009	180014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_018516	CTA	2	6	180031	180036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_018516	AT	3	6	180775	180780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018516	AAAT	2	8	180818	180825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018516	ATCTA	2	10	180888	180897	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
557	NC_018516	ATAA	2	8	180980	180987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018516	TAT	2	6	182565	182570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018516	TATC	2	8	182586	182593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_018516	AGA	2	6	183297	183302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018516	TCT	2	6	183327	183332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_018516	TGTT	2	8	183333	183340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018516	TATCT	2	10	183355	183364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_018516	ACA	2	6	185618	185623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_018516	TAC	2	6	185638	185643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018516	CTTTT	2	10	185664	185673	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
567	NC_018516	GA	3	6	185706	185711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018516	TACC	2	8	185713	185720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_018516	AAAC	2	8	185736	185743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_018516	TTAT	2	8	185752	185759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018516	ACT	2	6	185760	185765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_018516	AAC	2	6	185778	185783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018516	TAT	2	6	185827	185832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018516	ATT	2	6	185845	185850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018516	TA	3	6	185871	185876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018516	AAAAG	2	10	185877	185886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018516	TA	3	6	188094	188099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018516	TTC	2	6	188236	188241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_018516	TGT	2	6	188301	188306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018516	CCT	2	6	188506	188511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_018516	TCC	2	6	189528	189533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_018516	TA	3	6	189541	189546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018516	ATA	2	6	189603	189608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018516	TCT	2	6	189616	189621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_018516	CCT	2	6	189843	189848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_018516	AGAA	2	8	189863	189870	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018516	TACA	2	8	191039	191046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_018516	CT	5	10	191529	191538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_018516	ACCTTA	2	12	191547	191558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_018516	TATT	2	8	191561	191568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018516	AT	3	6	191595	191600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018516	ATTT	2	8	191606	191613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018516	TAG	2	6	191614	191619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018516	TAA	2	6	191633	191638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018516	TTA	2	6	191651	191656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018516	TAAA	2	8	191703	191710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018516	TA	3	6	191756	191761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018516	AAGG	2	8	191766	191773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018516	CCTT	2	8	191785	191792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_018516	CTA	2	6	191800	191805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_018516	TTA	2	6	191815	191820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018516	TTTG	2	8	191889	191896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018516	TC	3	6	192622	192627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_018516	TCTT	2	8	192643	192650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_018516	AAC	2	6	192732	192737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_018516	TGTA	2	8	192766	192773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018516	ACA	2	6	192789	192794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018516	CCAA	2	8	192799	192806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_018516	TG	3	6	192822	192827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018516	TCT	2	6	192852	192857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018516	CCT	2	6	192886	192891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_018516	AAAGA	2	10	192898	192907	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018516	CTT	2	6	192923	192928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_018516	TAT	2	6	193464	193469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018516	TA	3	6	193476	193481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018516	TTA	2	6	193483	193488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018516	TA	3	6	193925	193930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018516	AAAC	2	8	193931	193938	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_018516	GTTT	2	8	193959	193966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018516	TA	3	6	194444	194449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018516	ATT	2	6	194495	194500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018516	TCTG	2	8	194503	194510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_018516	CTT	2	6	194836	194841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_018516	TC	3	6	194889	194894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_018516	CAA	2	6	194917	194922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_018516	TTA	2	6	194953	194958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_018516	TACA	2	8	198560	198567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_018516	CTT	2	6	198615	198620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_018516	TAC	2	6	198645	198650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018516	ATA	2	6	198658	198663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_018516	CTT	2	6	199580	199585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_018516	TTG	2	6	199663	199668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018516	TTTG	2	8	199687	199694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018516	TTG	2	6	199728	199733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018516	TTA	2	6	199737	199742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018516	TAC	2	6	199758	199763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_018516	ACT	2	6	199823	199828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_018516	ATT	2	6	199847	199852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_018516	TAT	2	6	200821	200826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_018516	TCC	2	6	202474	202479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_018516	GTT	2	6	202494	202499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
645	NC_018516	CTT	2	6	202876	202881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_018516	TCA	2	6	202882	202887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_018516	CTT	2	6	204197	204202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_018516	CCT	2	6	206568	206573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
649	NC_018516	CTA	2	6	206639	206644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_018516	TAAA	2	8	206693	206700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_018516	TA	3	6	206795	206800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_018516	CATT	2	8	206921	206928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
654	NC_018516	TTAC	2	8	208000	208007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
655	NC_018516	AGTT	2	8	208074	208081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
656	NC_018516	TAC	2	6	208106	208111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_018516	CCT	2	6	208351	208356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
658	NC_018516	CT	3	6	208763	208768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
659	NC_018516	GTT	2	6	208787	208792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
660	NC_018516	TCCT	2	8	210888	210895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
661	NC_018516	CTG	2	6	213089	213094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_018516	ATT	2	6	213121	213126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_018516	ATA	2	6	213142	213147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_018516	AAG	2	6	213210	213215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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666	NC_018516	CCT	2	6	215895	215900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
667	NC_018516	CTGA	2	8	216015	216022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
668	NC_018516	TA	3	6	216037	216042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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670	NC_018516	CCT	2	6	218284	218289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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674	NC_018516	TTA	2	6	223916	223921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_018516	CTTTA	2	10	223929	223938	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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678	NC_018516	TTA	2	6	223999	224004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
679	NC_018516	TAC	2	6	224010	224015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_018516	TCC	2	6	224072	224077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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685	NC_018516	TTGA	2	8	225099	225106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
686	NC_018516	ACTG	2	8	227272	227279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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695	NC_018516	ACAT	2	8	229959	229966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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718	NC_018516	TAC	2	6	231475	231480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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721	NC_018516	TTTCCG	2	12	231598	231609	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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723	NC_018516	T	6	6	232483	232488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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726	NC_018516	GTT	2	6	232564	232569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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731	NC_018516	TG	3	6	232706	232711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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743	NC_018516	TTAT	2	8	236572	236579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
744	NC_018516	TAT	2	6	236590	236595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_018516	TAT	2	6	242275	242280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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764	NC_018516	TAA	2	6	243331	243336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_018516	CTT	2	6	245415	245420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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777	NC_018516	ACTT	2	8	246785	246792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
778	NC_018516	CTT	2	6	246920	246925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_018516	AAAG	2	8	246959	246966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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