MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus cereus FRI-35 plasmid p03

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018499	CAA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018499	TTC	2	6	153	158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018499	TTTA	2	8	175	182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018499	TGT	2	6	205	210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018499	TTAG	2	8	234	241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018499	T	6	6	327	332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018499	ATT	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018499	ATA	2	6	349	354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018499	ATTTC	2	10	376	385	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018499	GAA	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018499	A	6	6	442	447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018499	ATT	2	6	832	837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018499	GAT	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018499	T	6	6	1093	1098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018499	GTT	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018499	ATA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018499	GTAT	2	8	1213	1220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018499	T	7	7	1227	1233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018499	TTA	2	6	1238	1243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018499	AAT	2	6	1252	1257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018499	AG	3	6	1289	1294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018499	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018499	ATA	2	6	1377	1382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018499	T	6	6	2618	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018499	AAATAG	2	12	2659	2670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018499	TAT	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018499	ATG	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018499	TAA	2	6	2770	2775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018499	A	8	8	2873	2880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018499	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018499	AAATAG	2	12	2944	2955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018499	ATT	2	6	2968	2973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018499	ACAA	2	8	2999	3006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018499	A	7	7	3005	3011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018499	TGTAA	2	10	3017	3026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018499	CAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018499	TTA	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018499	ATAA	2	8	3090	3097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018499	A	7	7	3103	3109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018499	TAAA	2	8	3110	3117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018499	A	7	7	3115	3121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018499	CAA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018499	AC	3	6	3239	3244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018499	TCCG	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018499	TTA	2	6	3291	3296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018499	GTTT	2	8	3368	3375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018499	GTCT	2	8	3390	3397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018499	CTT	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018499	TAT	2	6	5004	5009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018499	T	7	7	5012	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018499	ATT	2	6	5054	5059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018499	GTT	2	6	5085	5090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018499	ATTTT	2	10	5094	5103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018499	TTGT	2	8	5113	5120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018499	TAC	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018499	T	7	7	5171	5177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018499	T	6	6	5187	5192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018499	TTGT	2	8	5218	5225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018499	TAT	2	6	5305	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018499	A	6	6	5328	5333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018499	CTT	2	6	7268	7273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018499	CT	3	6	8053	8058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018499	T	6	6	8058	8063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018499	TAT	2	6	8066	8071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018499	T	7	7	8075	8081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018499	AAACG	2	10	8133	8142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018499	GAT	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018499	TGT	2	6	8232	8237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018499	CCAATA	2	12	8279	8290	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018499	A	6	6	8364	8369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018499	GTA	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018499	TA	3	6	8435	8440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018499	AAAT	2	8	8449	8456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018499	TCTT	2	8	8523	8530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018499	T	6	6	8556	8561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018499	TA	3	6	11780	11785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018499	AATA	2	8	11837	11844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018499	T	7	7	11919	11925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018499	TAA	2	6	11995	12000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018499	A	6	6	12020	12025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018499	T	7	7	12042	12048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018499	T	6	6	12121	12126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018499	AGA	2	6	12130	12135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018499	TTTTA	2	10	12137	12146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018499	AG	3	6	12225	12230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018499	AATA	2	8	12280	12287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018499	TAA	2	6	12289	12294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018499	ATGA	2	8	12353	12360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018499	AT	3	6	12365	12370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018499	T	6	6	12378	12383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018499	TAA	2	6	13756	13761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018499	TTA	2	6	13888	13893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018499	A	6	6	13916	13921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018499	ATT	2	6	13932	13937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018499	TAT	2	6	13946	13951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018499	CTA	2	6	13972	13977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018499	CTC	2	6	14011	14016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018499	ATA	2	6	14087	14092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018499	TA	4	8	14096	14103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018499	C	6	6	14107	14112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_018499	G	6	6	14134	14139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018499	TA	3	6	14143	14148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018499	AAT	2	6	14175	14180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018499	TTA	2	6	14290	14295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018499	A	6	6	14318	14323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018499	ATT	2	6	14334	14339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018499	TAT	2	6	14348	14353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018499	CTA	2	6	14374	14379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018499	CTC	2	6	14413	14418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018499	CCT	2	6	14463	14468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018499	ATA	2	6	14489	14494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018499	TA	4	8	14498	14505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018499	C	6	6	14509	14514	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_018499	G	6	6	14536	14541	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018499	TA	3	6	14545	14550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018499	AAT	2	6	14577	14582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018499	TTA	2	6	14692	14697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018499	A	6	6	14720	14725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018499	ATT	2	6	14736	14741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018499	TAT	2	6	14750	14755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018499	CTA	2	6	14776	14781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018499	CTC	2	6	14814	14819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018499	CCT	2	6	14864	14869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018499	ATA	2	6	14890	14895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018499	TA	4	8	14899	14906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018499	TA	3	6	14944	14949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018499	AAT	2	6	14976	14981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018499	TTA	2	6	15091	15096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018499	A	6	6	15119	15124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018499	ATT	2	6	15135	15140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018499	TAT	2	6	15149	15154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018499	CTA	2	6	15175	15180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018499	CTC	2	6	15214	15219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_018499	CCT	2	6	15264	15269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018499	ATA	2	6	15290	15295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018499	TA	4	8	15299	15306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018499	TA	3	6	15345	15350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018499	AAAG	2	8	15369	15376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018499	GAT	2	6	15381	15386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018499	A	6	6	15411	15416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018499	GT	3	6	15417	15422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018499	TTA	2	6	15555	15560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018499	AGG	2	6	15606	15611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018499	A	6	6	16262	16267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018499	TCT	2	6	16305	16310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018499	CCA	2	6	16327	16332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_018499	TTA	2	6	16337	16342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018499	CATT	2	8	16364	16371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018499	TTGG	2	8	16607	16614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018499	A	6	6	16636	16641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018499	CA	3	6	16688	16693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018499	TAC	2	6	16711	16716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018499	TTGG	2	8	16758	16765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_018499	A	7	7	17610	17616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_018499	A	7	7	17899	17905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018499	A	7	7	18160	18166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018499	A	7	7	18421	18427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_018499	A	7	7	23506	23512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018499	T	6	6	23519	23524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_018499	T	7	7	26153	26159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_018499	A	6	6	26449	26454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_018499	TA	3	6	26688	26693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018499	TAA	2	6	34562	34567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_018499	ATA	2	6	34647	34652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018499	AT	4	8	34688	34695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_018499	A	6	6	35609	35614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_018499	T	6	6	35640	35645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018499	TTA	2	6	35649	35654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_018499	TTG	2	6	35660	35665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_018499	T	7	7	35666	35672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_018499	TAA	2	6	35757	35762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_018499	ATT	2	6	35791	35796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_018499	AT	3	6	35831	35836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_018499	TAAAAT	2	12	35837	35848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_018499	TCT	2	6	35895	35900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_018499	AT	3	6	35913	35918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_018499	TGTT	2	8	35978	35985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
312	NC_018499	TCA	2	6	36162	36167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_018499	TTCT	2	8	36194	36201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
314	NC_018499	CTT	2	6	36211	36216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
315	NC_018499	GTTTTA	2	12	36244	36255	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.