MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p03

Total Repeats: 388

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018487	GAT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018487	AAG	2	6	516	521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018487	TAA	2	6	596	601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018487	AGA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018487	GCA	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018487	TAC	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018487	CTCC	2	8	759	766	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_018487	ATT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018487	GTT	2	6	786	791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018487	ATG	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018487	TTG	2	6	916	921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018487	ATT	3	9	962	970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018487	TGG	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018487	ATG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018487	CTTA	2	8	1061	1068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018487	A	6	6	1155	1160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018487	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018487	TTC	2	6	1248	1253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018487	A	6	6	1275	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018487	TCA	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018487	AGA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018487	AT	3	6	1334	1339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018487	ACA	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018487	TGGA	2	8	1391	1398	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018487	A	7	7	1440	1446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018487	GAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018487	TAC	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018487	TGGA	2	8	1523	1530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018487	AAT	2	6	1565	1570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018487	A	6	6	1597	1602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018487	A	7	7	1649	1655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018487	TAC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018487	TCT	2	6	1719	1724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018487	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018487	CAA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018487	TA	3	6	1867	1872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018487	TGT	2	6	1886	1891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018487	AAAG	2	8	1934	1941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018487	A	6	6	2012	2017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018487	A	7	7	2102	2108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018487	GTT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018487	ATG	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018487	A	6	6	2230	2235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018487	TAAA	2	8	2269	2276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018487	TGT	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018487	CTG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018487	GAA	2	6	2405	2410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018487	GAC	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018487	GCT	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018487	A	7	7	5949	5955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018487	A	7	7	6105	6111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018487	A	6	6	6140	6145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018487	CAT	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018487	T	6	6	6176	6181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018487	TTAT	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018487	TTA	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018487	ATA	2	6	9854	9859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018487	TAC	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018487	A	6	6	9904	9909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018487	TACT	2	8	9969	9976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018487	TTA	2	6	10061	10066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018487	TA	4	8	10078	10085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018487	ATT	2	6	11076	11081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018487	TCTT	2	8	11096	11103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018487	TAA	2	6	11149	11154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018487	A	6	6	11153	11158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018487	TGATT	2	10	11253	11262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018487	AT	4	8	11345	11352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018487	TTAA	2	8	11354	11361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018487	AGA	2	6	11452	11457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018487	TCCT	2	8	11459	11466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018487	GGTT	2	8	11586	11593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018487	GTG	2	6	11681	11686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018487	GTG	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018487	AGT	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018487	A	7	7	12796	12802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018487	TTCT	2	8	12808	12815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018487	T	6	6	12841	12846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018487	GT	4	8	14316	14323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018487	T	6	6	14353	14358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018487	ATTTT	2	10	14380	14389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018487	AATA	2	8	14436	14443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018487	GGT	2	6	14481	14486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018487	A	7	7	16643	16649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018487	TGA	2	6	16652	16657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018487	TAA	2	6	16680	16685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018487	AAG	2	6	16756	16761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018487	T	8	8	16767	16774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018487	TAG	2	6	16777	16782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018487	AGG	2	6	16800	16805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018487	TAG	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018487	ATA	2	6	16936	16941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018487	A	6	6	17956	17961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018487	T	6	6	18003	18008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018487	ATA	2	6	18046	18051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018487	A	7	7	18062	18068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018487	GGTG	2	8	18127	18134	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018487	T	6	6	18143	18148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018487	T	6	6	18152	18157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018487	T	6	6	18212	18217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018487	TA	4	8	18221	18228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018487	TA	3	6	18235	18240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018487	T	9	9	18248	18256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018487	TTC	2	6	18287	18292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018487	TA	3	6	18325	18330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018487	TTA	2	6	18333	18338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018487	TA	3	6	18385	18390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018487	TGA	2	6	18402	18407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018487	ATTA	2	8	18412	18419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018487	AAGA	2	8	18437	18444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018487	T	7	7	18467	18473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018487	G	6	6	18488	18493	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018487	ATA	2	6	18494	18499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018487	ATATT	2	10	21465	21474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018487	T	7	7	21507	21513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018487	ATTT	2	8	21526	21533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018487	AT	3	6	21546	21551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018487	TAATT	2	10	21556	21565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018487	ATA	2	6	21827	21832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018487	TTTA	2	8	21851	21858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018487	GGAG	2	8	21941	21948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018487	TATGCA	2	12	21952	21963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018487	AAC	2	6	21993	21998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018487	ATTT	2	8	22011	22018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018487	AAT	2	6	22031	22036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018487	T	7	7	22055	22061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018487	AGAGT	2	10	22099	22108	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018487	TACCC	2	10	22122	22131	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_018487	TAG	2	6	22557	22562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018487	CTT	2	6	22575	22580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018487	A	7	7	22595	22601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018487	TCA	2	6	22604	22609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018487	TGAT	2	8	22623	22630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018487	GATAA	2	10	22994	23003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018487	A	7	7	23002	23008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018487	TAT	2	6	23009	23014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018487	TAT	3	9	23017	23025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018487	G	6	6	23057	23062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018487	TGAA	2	8	23376	23383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018487	TGG	2	6	23392	23397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018487	GCC	2	6	23459	23464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018487	CGA	2	6	23492	23497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018487	GAT	2	6	23556	23561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018487	TGAT	2	8	23563	23570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018487	TTC	2	6	23641	23646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018487	TG	3	6	23669	23674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018487	GTC	2	6	23724	23729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018487	ATT	2	6	23779	23784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018487	GGT	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018487	TAT	2	6	24410	24415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018487	GGA	2	6	24443	24448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.