MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	T	7	7	977	983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018486	T	6	6	987	992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018486	AAG	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018486	TA	3	6	1022	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018486	AT	7	14	1048	1061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018486	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018486	CAAC	2	8	1115	1122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018486	AAAT	2	8	1165	1172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018486	GAG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018486	GAAAA	2	10	1848	1857	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018486	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018486	TAA	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018486	T	6	6	1972	1977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018486	CTTT	2	8	1994	2001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018486	TAATA	2	10	2016	2025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018486	ACTTA	2	10	2027	2036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018486	ACC	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018486	GT	3	6	2069	2074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018486	TACT	2	8	2085	2092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018486	ATT	2	6	2119	2124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018486	TAATA	2	10	2130	2139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018486	TAAA	2	8	2336	2343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018486	TATAA	2	10	2370	2379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018486	TAA	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018486	AATAA	2	10	2397	2406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018486	A	6	6	2405	2410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018486	AGA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018486	CAA	2	6	2502	2507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018486	CTC	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018486	GGA	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018486	AAGG	2	8	6310	6317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018486	GAA	2	6	12580	12585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018486	TTA	2	6	13198	13203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018486	A	6	6	13203	13208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018486	ATA	2	6	13257	13262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018486	TAAA	2	8	13273	13280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018486	TA	3	6	13286	13291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018486	TGAAA	2	10	13296	13305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018486	GTA	2	6	14011	14016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018486	ATTT	2	8	14021	14028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018486	TA	3	6	14033	14038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018486	TA	3	6	14052	14057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018486	AT	3	6	14433	14438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018486	ATG	2	6	14450	14455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018486	TAAA	2	8	14479	14486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018486	AGG	2	6	14534	14539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018486	AGG	2	6	15229	15234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018486	TAT	2	6	16504	16509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018486	TAA	2	6	16538	16543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018486	AATTTG	2	12	16622	16633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018486	TTA	2	6	16881	16886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018486	TAA	2	6	17259	17264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018486	T	6	6	17742	17747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018486	TA	5	10	17760	17769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018486	GAAATA	2	12	17773	17784	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018486	TAA	2	6	18483	18488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018486	AAG	2	6	18527	18532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018486	ATA	2	6	18943	18948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018486	ATA	2	6	18978	18983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018486	GA	3	6	19689	19694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018486	T	6	6	20242	20247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018486	ATA	2	6	20256	20261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018486	TAAA	2	8	20316	20323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018486	A	6	6	20321	20326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018486	TAT	2	6	20641	20646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018486	T	7	7	20656	20662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018486	AGT	2	6	20681	20686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018486	TAC	2	6	20734	20739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018486	AGG	2	6	20776	20781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018486	TAT	2	6	21041	21046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018486	AAG	2	6	21622	21627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018486	TAA	2	6	21702	21707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018486	T	6	6	21715	21720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018486	A	6	6	21751	21756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018486	TTA	2	6	21788	21793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018486	TA	3	6	21821	21826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018486	T	8	8	22030	22037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018486	T	6	6	22061	22066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018486	AAT	2	6	22114	22119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018486	TAA	2	6	22129	22134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018486	TAA	2	6	22140	22145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018486	TGTT	2	8	22147	22154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018486	AT	3	6	22158	22163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018486	TAA	2	6	22167	22172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018486	TTTAAT	2	12	22213	22224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018486	CAT	2	6	22227	22232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018486	AT	3	6	22246	22251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018486	ATA	2	6	22266	22271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018486	T	7	7	22280	22286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018486	TCC	2	6	23994	23999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018486	A	9	9	24007	24015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018486	TA	3	6	24137	24142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018486	A	6	6	24151	24156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018486	TAA	2	6	24179	24184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018486	A	6	6	24207	24212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018486	AAT	2	6	24223	24228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018486	ATA	2	6	24249	24254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018486	TATAA	2	10	24272	24281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018486	AAG	2	6	24282	24287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018486	AT	3	6	24308	24313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018486	CTT	2	6	25389	25394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018486	TAATT	2	10	25424	25433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018486	TAT	2	6	25443	25448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018486	TA	3	6	25458	25463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018486	CT	3	6	25464	25469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018486	T	6	6	25548	25553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018486	CTT	2	6	25607	25612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018486	TTC	2	6	25625	25630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018486	TAA	2	6	25634	25639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018486	AAT	2	6	25644	25649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018486	TTA	2	6	25709	25714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018486	TAGA	2	8	25757	25764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018486	GAAC	2	8	25833	25840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018486	AAC	2	6	25847	25852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018486	GAC	2	6	25859	25864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018486	TTAAA	2	10	25944	25953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018486	ATA	2	6	25984	25989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018486	TTAT	2	8	26066	26073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018486	TCT	2	6	26074	26079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018486	ACC	2	6	26084	26089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018486	GGT	2	6	26114	26119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018486	TAT	2	6	26131	26136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018486	GCA	2	6	26196	26201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018486	TAA	2	6	26207	26212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018486	GTA	2	6	26215	26220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018486	CCT	2	6	26240	26245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018486	CAT	2	6	26248	26253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018486	CCCA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_018486	AT	3	6	26355	26360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018486	TAAA	2	8	26364	26371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018486	A	6	6	26369	26374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018486	TA	3	6	26462	26467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018486	ATT	2	6	26471	26476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018486	ATA	2	6	26488	26493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018486	AT	4	8	26510	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018486	GGT	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018486	GGA	2	6	26545	26550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018486	TTTA	2	8	26566	26573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018486	TGATA	2	10	26589	26598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018486	TA	3	6	26597	26602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018486	TAA	2	6	26610	26615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018486	TAT	2	6	26674	26679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018486	TAAAA	2	10	27903	27912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018486	ATT	2	6	27935	27940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018486	GGA	2	6	27964	27969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018486	TCTTT	2	10	27985	27994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018486	AGC	2	6	28102	28107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018486	A	9	9	28126	28134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018486	AT	3	6	28164	28169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018486	TAT	2	6	28477	28482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018486	T	6	6	28841	28846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018486	TA	3	6	28853	28858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_018486	AT	3	6	28954	28959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018486	TA	3	6	28976	28981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_018486	A	6	6	32756	32761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_018486	TA	3	6	44882	44887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_018486	TA	3	6	44907	44912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018486	T	6	6	44927	44932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018486	AT	3	6	44934	44939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018486	A	6	6	45035	45040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018486	TTCT	2	8	45046	45053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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287	NC_018486	T	6	6	45079	45084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018486	A	7	7	46523	46529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018486	T	7	7	46715	46721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018486	GTA	2	6	47240	47245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_018486	ACT	2	6	47301	47306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_018486	TAT	3	9	47364	47372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_018486	TAA	3	9	47402	47410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018486	GAC	2	6	47457	47462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_018486	CCT	2	6	47514	47519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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485	NC_018486	TC	3	6	73095	73100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_018486	TA	3	6	73136	73141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_018486	CT	3	6	73145	73150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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