MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blaberus giganteus) plasmid pBGIBA

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017925	TA	3	6	3	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017925	T	7	7	36	42	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017925	GTGTG	2	10	63	72	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017925	A	6	6	175	180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017925	T	7	7	207	213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017925	AGT	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017925	GTG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017925	GATAA	2	10	272	281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017925	TAATA	2	10	282	291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017925	ATA	4	12	286	297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017925	A	9	9	306	314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017925	CTTTTT	2	12	347	358	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017925	CTTTTT	2	12	362	373	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017925	GCTTTT	2	12	376	387	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017925	CTTTTT	2	12	392	403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017925	TTC	2	6	417	422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017925	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017925	T	8	8	428	435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017925	TTC	2	6	459	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017925	GAAA	2	8	508	515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017925	A	7	7	513	519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017925	AGT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017925	AGG	3	9	540	548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017925	TAG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017925	T	6	6	581	586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017925	TTC	2	6	591	596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017925	TGG	2	6	597	602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017925	ATC	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017925	ATG	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017925	A	6	6	639	644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017925	CAT	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017925	GATAA	2	10	652	661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017925	A	9	9	660	668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017925	T	6	6	672	677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017925	T	8	8	691	698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017925	T	9	9	709	717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017925	ATT	2	6	723	728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017925	CATA	2	8	729	736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017925	TCT	3	9	3131	3139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017925	TCTA	2	8	3158	3165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017925	TAA	2	6	3170	3175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017925	A	6	6	3174	3179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017925	A	8	8	3198	3205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017925	ACAA	2	8	3208	3215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017925	T	8	8	3234	3241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017925	A	7	7	3248	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017925	GTC	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017925	C	7	7	3282	3288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_017925	CG	5	10	3292	3301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017925	CATG	2	8	3302	3309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017925	TGCG	2	8	3310	3317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017925	C	9	9	3340	3348	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_017925	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017925	CTA	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.